RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000227451.3

DTX4-201, Transcript of deltex E3 ubiquitin ligase 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene DTX4, Length 5,642 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX4-201ENST00000227451 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP27.84■■■□□ 2.05
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DTX4-201ENST00000227451 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP27.78■■■□□ 2.04
DTX4-201ENST00000227451 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP27.77■■■□□ 2.04
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DTX4-201ENST00000227451 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP27.71■■■□□ 2.03
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DTX4-201ENST00000227451 CDCA8Q53HL2 280 aa27.64■■■□□ 2.02
DTX4-201ENST00000227451 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP27.62■■■□□ 2.01
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DTX4-201ENST00000227451 CCNB3Q8WWL7 1395 aa27.58■■■□□ 2.01
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DTX4-201ENST00000227451 CARD11Q9BXL7 1154 aa27.44■■□□□ 1.98
DTX4-201ENST00000227451 KNSTRNQ9Y448 316 aa27.44■■□□□ 1.98
DTX4-201ENST00000227451 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa27.43■■□□□ 1.98
DTX4-201ENST00000227451 POGKQ9P215 609 aa27.42■■□□□ 1.98
DTX4-201ENST00000227451 HDGFP51858 240 aaKnown RBP27.38■■□□□ 1.97
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DTX4-201ENST00000227451 LMOD2Q6P5Q4 547 aa27.24■■□□□ 1.95
DTX4-201ENST00000227451 MLECQ14165 292 aa27.23■■□□□ 1.95
DTX4-201ENST00000227451 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa27.21■■□□□ 1.95
DTX4-201ENST00000227451 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP27.19■■□□□ 1.94
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DTX4-201ENST00000227451 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa27.17■■□□□ 1.94
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DTX4-201ENST00000227451 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP27.02■■□□□ 1.92
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DTX4-201ENST00000227451 NEUROD2Q15784 382 aa26.99■■□□□ 1.91
DTX4-201ENST00000227451 SETD5Q9C0A6 1442 aa26.98■■□□□ 1.91
DTX4-201ENST00000227451 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP26.98■■□□□ 1.91
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DTX4-201ENST00000227451 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP26.96■■□□□ 1.91
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DTX4-201ENST00000227451 PKD2Q13563 968 aa26.94■■□□□ 1.9
DTX4-201ENST00000227451 WIZO95785 1651 aa26.94■■□□□ 1.9
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DTX4-201ENST00000227451 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa26.93■■□□□ 1.9
DTX4-201ENST00000227451 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa26.93■■□□□ 1.9
DTX4-201ENST00000227451 NPHP1O15259 732 aa26.92■■□□□ 1.9
DTX4-201ENST00000227451 BECN1Q14457 450 aa26.89■■□□□ 1.9
DTX4-201ENST00000227451 MS4A1P11836 297 aa26.88■■□□□ 1.89
DTX4-201ENST00000227451 RSPH4AQ5TD94 716 aa26.86■■□□□ 1.89
DTX4-201ENST00000227451 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP26.86■■□□□ 1.89
DTX4-201ENST00000227451 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP26.85■■□□□ 1.89
DTX4-201ENST00000227451 MORC1Q86VD1 984 aa26.85■■□□□ 1.89
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DTX4-201ENST00000227451 NUP155O75694 1391 aa26.84■■□□□ 1.89
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DTX4-201ENST00000227451 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP26.81■■□□□ 1.88
DTX4-201ENST00000227451 CCDC18Q5T9S5 1454 aa26.81■■□□□ 1.88
DTX4-201ENST00000227451 SMARCA4P51532 1647 aa26.81■■□□□ 1.88
DTX4-201ENST00000227451 NCLP19338 710 aaKnown RBP26.81■■□□□ 1.88
DTX4-201ENST00000227451 FANCD2Q9BXW9 1451 aa26.79■■□□□ 1.88
DTX4-201ENST00000227451 KIF3BO15066 747 aa26.79■■□□□ 1.88
DTX4-201ENST00000227451 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa26.79■■□□□ 1.88
DTX4-201ENST00000227451 SOX12O15370 315 aa26.79■■□□□ 1.88
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