RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000219473.11

USP10-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 10, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP10, Length 3,009 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP10-201ENST00000219473 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
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USP10-201ENST00000219473 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa21.99■■□□□ 1.11
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USP10-201ENST00000219473 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa21.99■■□□□ 1.11
USP10-201ENST00000219473 GAPVD1Q14C86 1478 aa21.99■■□□□ 1.11
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USP10-201ENST00000219473 EFCAB5A4FU69 1503 aa21.87■■□□□ 1.09
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USP10-201ENST00000219473 CFAP43Q8NDM7 1665 aa21.82■■□□□ 1.08
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USP10-201ENST00000219473 PTPRKQ15262 1439 aa21.56■■□□□ 1.04
USP10-201ENST00000219473 IFT140Q96RY7 1462 aa21.55■■□□□ 1.04
USP10-201ENST00000219473 MYOM3Q5VTT5 1437 aa21.54■■□□□ 1.04
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USP10-201ENST00000219473 UGGT2Q9NYU1 1516 aa21.43■■□□□ 1.02
USP10-201ENST00000219473 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
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USP10-201ENST00000219473 PTPN23Q9H3S7 1636 aa21.42■■□□□ 1.02
USP10-201ENST00000219473 TRIM52Q96A61 297 aa21.42■■□□□ 1.02
USP10-201ENST00000219473 NAIPQ13075 1403 aa21.41■■□□□ 1.02
USP10-201ENST00000219473 GRIN2AQ12879 1464 aa21.4■■□□□ 1.02
USP10-201ENST00000219473 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa21.4■■□□□ 1.02
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USP10-201ENST00000219473 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP21.33■■□□□ 1.01
USP10-201ENST00000219473 KIAA0556O60303 1618 aa21.33■■□□□ 1.01
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USP10-201ENST00000219473 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP21.26■□□□□ 0.99
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USP10-201ENST00000219473 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP21.2■□□□□ 0.98
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USP10-201ENST00000219473 DAPK1P53355 1430 aa21.16■□□□□ 0.98
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