RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000216361.8

COCH-201, Transcript of cochlin, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene COCH, Length 2,397 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COCH-201ENST00000216361 FGD5Q6ZNL6 1462 aa29.77■■■□□ 2.36
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COCH-201ENST00000216361 CFAP43Q8NDM7 1665 aa29.68■■■□□ 2.34
COCH-201ENST00000216361 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP29.63■■■□□ 2.33
COCH-201ENST00000216361 WDR97A6NE52 1622 aa29.59■■■□□ 2.33
COCH-201ENST00000216361 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP29.58■■■□□ 2.33
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COCH-201ENST00000216361 SIN3AQ96ST3 1273 aa29.55■■■□□ 2.32
COCH-201ENST00000216361 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa29.53■■■□□ 2.32
COCH-201ENST00000216361 FYCO1Q9BQS8 1478 aa29.51■■■□□ 2.31
COCH-201ENST00000216361 P3H3Q8IVL6 736 aa29.5■■■□□ 2.31
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COCH-201ENST00000216361 FANCD2Q9BXW9 1451 aa29.49■■■□□ 2.31
COCH-201ENST00000216361 EFCAB5A4FU69 1503 aa29.48■■■□□ 2.31
COCH-201ENST00000216361 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa29.47■■■□□ 2.31
COCH-201ENST00000216361 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP29.47■■■□□ 2.311e-11■■□□□ 14
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COCH-201ENST00000216361 DNMBPQ6XZF7 1577 aa29.43■■■□□ 2.3
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COCH-201ENST00000216361 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa29.41■■■□□ 2.3
COCH-201ENST00000216361 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa29.38■■■□□ 2.29
COCH-201ENST00000216361 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa29.37■■■□□ 2.29
COCH-201ENST00000216361 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP29.37■■■□□ 2.29
COCH-201ENST00000216361 CUL7Q14999 1698 aa29.35■■■□□ 2.29
COCH-201ENST00000216361 TOPBP1Q92547 1522 aa29.34■■■□□ 2.29
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COCH-201ENST00000216361 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa29.28■■■□□ 2.28
COCH-201ENST00000216361 CCER2I3L3R5 266 aa29.25■■■□□ 2.27
COCH-201ENST00000216361 CCDC18Q5T9S5 1454 aa29.23■■■□□ 2.27
COCH-201ENST00000216361 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP29.22■■■□□ 2.27
COCH-201ENST00000216361 HFM1A2PYH4 1435 aa29.22■■■□□ 2.27
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COCH-201ENST00000216361 UACAQ9BZF9 1416 aa29.19■■■□□ 2.26
COCH-201ENST00000216361 MTUS2Q5JR59 1369 aa29.18■■■□□ 2.26
COCH-201ENST00000216361 TONSLQ96HA7 1378 aa29.18■■■□□ 2.26
COCH-201ENST00000216361 ANP32CO43423 234 aa29.16■■■□□ 2.26
COCH-201ENST00000216361 FKBP8Q14318 412 aa29.16■■■□□ 2.26
COCH-201ENST00000216361 PTPN23Q9H3S7 1636 aa29.16■■■□□ 2.26
COCH-201ENST00000216361 SAMD9Q5K651 1589 aa29.15■■■□□ 2.26
COCH-201ENST00000216361 NESP48681 1621 aa29.15■■■□□ 2.26
COCH-201ENST00000216361 BCANQ96GW7 911 aa29.12■■■□□ 2.25
COCH-201ENST00000216361 NAIPQ13075 1403 aa29.1■■■□□ 2.25
COCH-201ENST00000216361 NCOA2Q15596 1464 aa29.1■■■□□ 2.25
COCH-201ENST00000216361 GRIN2BQ13224 1484 aa29.1■■■□□ 2.25
COCH-201ENST00000216361 MYOM3Q5VTT5 1437 aa29.09■■■□□ 2.25
COCH-201ENST00000216361 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa29.09■■■□□ 2.25
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COCH-201ENST00000216361 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa29.05■■■□□ 2.24
COCH-201ENST00000216361 TRIM52Q96A61 297 aa29.04■■■□□ 2.24
COCH-201ENST00000216361 KDM5BQ9UGL1 1544 aa29.03■■■□□ 2.24
COCH-201ENST00000216361 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa29.01■■■□□ 2.24
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COCH-201ENST00000216361 ARHGEF11O15085 1522 aa28.97■■■□□ 2.23
COCH-201ENST00000216361 UGGT2Q9NYU1 1516 aa28.97■■■□□ 2.23
COCH-201ENST00000216361 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa28.96■■■□□ 2.23
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COCH-201ENST00000216361 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa28.91■■■□□ 2.22
COCH-201ENST00000216361 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP28.89■■■□□ 2.21
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COCH-201ENST00000216361 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP28.85■■■□□ 2.21
COCH-201ENST00000216361 GCC2Q8IWJ2 1684 aa28.84■■■□□ 2.21
COCH-201ENST00000216361 AKNAQ7Z591 1439 aa28.82■■■□□ 2.2
COCH-201ENST00000216361 HECW1Q76N89 1606 aa28.82■■■□□ 2.2
COCH-201ENST00000216361 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa28.81■■■□□ 2.2
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COCH-201ENST00000216361 CHIC2Q9UKJ5 165 aa28.75■■■□□ 2.19
COCH-201ENST00000216361 KDM6BO15054 1643 aa28.74■■■□□ 2.19
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COCH-201ENST00000216361 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP28.68■■■□□ 2.18
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COCH-201ENST00000216361 CNTLNQ9NXG0 1405 aa28.65■■■□□ 2.18
COCH-201ENST00000216361 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP28.63■■■□□ 2.17
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COCH-201ENST00000216361 NCOA1Q15788 1441 aa28.59■■■□□ 2.17
COCH-201ENST00000216361 PBRM1Q86U86 1689 aa28.59■■■□□ 2.17
COCH-201ENST00000216361 ADAMTS12P58397 1594 aa28.56■■■□□ 2.16
COCH-201ENST00000216361 CCDC7Q96M83 1385 aa28.55■■■□□ 2.16
COCH-201ENST00000216361 ROCK1Q13464 1354 aa28.55■■■□□ 2.16
COCH-201ENST00000216361 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP28.54■■■□□ 2.16
COCH-201ENST00000216361 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa28.54■■■□□ 2.16
COCH-201ENST00000216361 FOXD1Q16676 465 aa28.53■■■□□ 2.16
COCH-201ENST00000216361 CCDC184Q52MB2 194 aa28.53■■■□□ 2.16
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