RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000215941.8

ANKRD54-201, Transcript of ankyrin repeat domain 54, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ANKRD54, Length 2,184 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54-201ENST00000215941 ARAP1Q96P48 1450 aa33.33■■■□□ 2.93
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ANKRD54-201ENST00000215941 WDR97A6NE52 1622 aa33.18■■■□□ 2.9
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ANKRD54-201ENST00000215941 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa33.03■■■□□ 2.88
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ANKRD54-201ENST00000215941 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP32.51■■■□□ 2.8
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ANKRD54-201ENST00000215941 PHLDB1Q86UU1 1377 aa32.41■■■□□ 2.78
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ANKRD54-201ENST00000215941 MTUS2Q5JR59 1369 aa32.19■■■□□ 2.74
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ANKRD54-201ENST00000215941 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa32.18■■■□□ 2.74
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ANKRD54-201ENST00000215941 HECW1Q76N89 1606 aa32.11■■■□□ 2.73
ANKRD54-201ENST00000215941 CCDC18Q5T9S5 1454 aa32.11■■■□□ 2.73
ANKRD54-201ENST00000215941 SYNJ2O15056 1496 aa32.08■■■□□ 2.73
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ANKRD54-201ENST00000215941 FGD6Q6ZV73 1430 aa32.05■■■□□ 2.72
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ANKRD54-201ENST00000215941 KIAA0556O60303 1618 aa32.04■■■□□ 2.72
ANKRD54-201ENST00000215941 UACAQ9BZF9 1416 aa32.04■■■□□ 2.72
ANKRD54-201ENST00000215941 BCANQ96GW7 911 aa32.04■■■□□ 2.72
ANKRD54-201ENST00000215941 NCOA2Q15596 1464 aa32.03■■■□□ 2.72
ANKRD54-201ENST00000215941 TONSLQ96HA7 1378 aa32.03■■■□□ 2.72
ANKRD54-201ENST00000215941 HFM1A2PYH4 1435 aa32.03■■■□□ 2.72
ANKRD54-201ENST00000215941 DISP1Q96F81 1524 aa32.02■■■□□ 2.72
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ANKRD54-201ENST00000215941 CEP170Q5SW79 1584 aa31.99■■■□□ 2.71
ANKRD54-201ENST00000215941 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa31.98■■■□□ 2.71
ANKRD54-201ENST00000215941 PTPN23Q9H3S7 1636 aa31.97■■■□□ 2.71
ANKRD54-201ENST00000215941 FBLN2P98095 1184 aa31.96■■■□□ 2.71
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ANKRD54-201ENST00000215941 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa31.84■■■□□ 2.69
ANKRD54-201ENST00000215941 ARID3CA6NKF2 412 aa31.82■■■□□ 2.68
ANKRD54-201ENST00000215941 KDM5BQ9UGL1 1544 aa31.81■■■□□ 2.68
ANKRD54-201ENST00000215941 NAIPQ13075 1403 aa31.81■■■□□ 2.68
ANKRD54-201ENST00000215941 ERICH6BQ5W0A0 696 aa31.8■■■□□ 2.68
ANKRD54-201ENST00000215941 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP31.8■■■□□ 2.68
ANKRD54-201ENST00000215941 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP31.79■■■□□ 2.68
ANKRD54-201ENST00000215941 PTPRKQ15262 1439 aa31.77■■■□□ 2.68
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ANKRD54-201ENST00000215941 JPH4Q96JJ6 628 aa31.76■■■□□ 2.67
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