RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000202024.3

1700028E10Rik-205, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene 1700028E10Rik, Length 924 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 Abcc1O35379 1528 aa24.79■■□□□ 1.56
1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 AknaQ80VW7 1404 aa24.75■■□□□ 1.55
1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 Top2aQ01320 1528 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 NrkQ9R0G8 1455 aa24.73■■□□□ 1.55
1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 Dnmt1P13864 1620 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 SynmQ70IV5 1561 aa24.71■■□□□ 1.55
1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 Ythdc2B2RR83 1445 aaKnown RBP24.7■■□□□ 1.55
1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 Ccdc88bQ4QRL3 1481 aa24.7■■□□□ 1.54
1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 Rapgef2Q8CHG7 1496 aa24.7■■□□□ 1.54
1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 Abca16E9PWJ7 1678 aa24.66■■□□□ 1.54
1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 BC005561E9Q5E2 1589 aa24.65■■□□□ 1.54
1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 Shroom4Q1W617 1475 aa24.63■■□□□ 1.53
1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 Abcc2Q8VI47 1543 aa24.62■■□□□ 1.53
1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 Setbp1Q9Z180 1582 aa24.62■■□□□ 1.53
1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 CadpsQ80TJ1 1355 aa24.57■■□□□ 1.52
1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 Map3k4O08648 1597 aa24.56■■□□□ 1.52
1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 Ak9G3UYQ4 1894 aa24.54■■□□□ 1.52
1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 WizO88286 1684 aaKnown RBP24.54■■□□□ 1.52
1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 Neo1P97798 1493 aa24.52■■□□□ 1.52
1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 PxdnQ3UQ28 1475 aa24.51■■□□□ 1.51
1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 Soga1E1U8D0 1418 aa24.5■■□□□ 1.51
1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 Adamts12Q811B3 1600 aa24.49■■□□□ 1.51
1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 TchhA0A0B4J1F9 1599 aa24.48■■□□□ 1.51
1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 Eif4g1Q6NZJ6 1600 aaKnown RBP24.46■■□□□ 1.51
1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 Arhgef12Q8R4H2 1543 aaKnown RBP24.41■■□□□ 1.5
1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 Arhgap27A2AB59 869 aa24.41■■□□□ 1.5
1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 Chic1Q8CBW7 227 aa24.41■■□□□ 1.5
1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 Gm14025A2AP89 1413 aa24.39■■□□□ 1.5
1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 AI481877A2ALV5 1481 aa24.37■■□□□ 1.49
1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 Slx4Q6P1D7 1565 aa24.37■■□□□ 1.49
1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 EprsQ8CGC7 1512 aaKnown RBP24.34■■□□□ 1.49
1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 Ppp1r18Q8BQ30 594 aa24.32■■□□□ 1.48
1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 Zeb1Q64318 1117 aa24.28■■□□□ 1.48
1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 Mroh2bQ7M6Y6 1581 aa24.27■■□□□ 1.48
1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 Ttc37F8VPK0 1563 aa24.24■■□□□ 1.47
1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 AdgbG3UZ78 1657 aa24.23■■□□□ 1.47
1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 Clasp1Q80TV8 1535 aaKnown RBP24.21■■□□□ 1.47
1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 Ifnlr1Q8CGK5 535 aa24.2■■□□□ 1.46
1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 Abca5Q8K448 1642 aa24.19■■□□□ 1.46
1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 Mapkbp1Q6NS57 1503 aa24.17■■□□□ 1.46
1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 Rpap1Q80TE0 1409 aa24.14■■□□□ 1.45
1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 Jph4Q80WT0 628 aa24.13■■□□□ 1.45
1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 Gm7298A0A0N4SVU1 1476 aa24.09■■□□□ 1.45
1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 Lrrc9Q8CDN9 1456 aa24.08■■□□□ 1.45
1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 Depdc5P61460 1591 aa24.08■■□□□ 1.44
1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 Map3k1P53349 1493 aa24.07■■□□□ 1.44
1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 Plekhg3Q4VAC9 1341 aa24.06■■□□□ 1.44
1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 Cul7Q8VE73 1689 aa24.05■■□□□ 1.44
1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 Alpk3Q924C5 1678 aa24.05■■□□□ 1.44
1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 Znf608Q56A10 1511 aa24.05■■□□□ 1.44
1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 Fkbp15Q6P9Q6 1216 aaKnown RBP24.04■■□□□ 1.44
1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 Rrbp1Q99PL5 1605 aaKnown RBP24.03■■□□□ 1.44
1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 Carmil1Q6EDY6 1374 aa24.03■■□□□ 1.44
1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 Arid3cA6PWV5 409 aa24.02■■□□□ 1.44
1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 Arhgef11Q68FM7 1552 aa24.01■■□□□ 1.43
1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 Kdm5bQ80Y84 1544 aa23.98■■□□□ 1.43
1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 Npm2Q80W85 207 aa23.96■■□□□ 1.43
1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 Dnajc5gQ8C632 165 aa23.95■■□□□ 1.42
1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 Zfyve16Q80U44 1528 aa23.94■■□□□ 1.42
1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 Arhgap35Q91YM2 1499 aa23.94■■□□□ 1.42
1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 WrnO09053 1401 aa23.94■■□□□ 1.42
1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 Polr1aO35134 1717 aaKnown RBP23.93■■□□□ 1.42
1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 NhsB1AV60 1647 aa23.92■■□□□ 1.42
1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 Fndc1E9Q043 1732 aa23.92■■□□□ 1.42
1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 Cux1P53564 1515 aa23.9■■□□□ 1.42
1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 Igf1rQ60751 1373 aa23.89■■□□□ 1.41
1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 Wdr7Q920I9 1489 aa23.86■■□□□ 1.41
1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 Plppr3Q7TPB0 716 aa23.82■■□□□ 1.4
1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 Mroh2aD3Z750 1679 aa23.76■■□□□ 1.39
1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 Gcc2Q8CHG3 1679 aa23.76■■□□□ 1.39
1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 AglF8VPN4 1532 aa23.76■■□□□ 1.39
1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 Arhgap31A6X8Z5 1425 aa23.73■■□□□ 1.39
1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 Atp10dQ8K2X1 1416 aa23.71■■□□□ 1.39
1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 Ccdc141E9Q8Q6 1531 aa23.7■■□□□ 1.38
1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 Abca8bQ8K440 1620 aa23.66■■□□□ 1.38
1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 Clip1Q922J3 1391 aa23.65■■□□□ 1.38
1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 Kiaa1210E9Q0C6 1637 aa23.64■■□□□ 1.38
1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 Rnf17Q99MV7 1640 aa23.64■■□□□ 1.38
1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 Fyco1Q8VDC1 1437 aa23.63■■□□□ 1.37
1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 Gab3Q8BSM5 595 aa23.61■■□□□ 1.37
1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 Brwd3A2AHJ4 1799 aa23.57■■□□□ 1.36
1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 Ankrd26Q811D2 1581 aa23.57■■□□□ 1.36
1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 Rapgef6Q5NCJ1 1609 aa23.56■■□□□ 1.36
1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 MlecQ6ZQI3 291 aaKnown RBP23.56■■□□□ 1.36
1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 Cep162Q6ZQ06 1403 aa23.55■■□□□ 1.36
1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 Kdm6bQ5NCY0 1641 aa23.54■■□□□ 1.36
1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 BlmO88700 1416 aa23.52■■□□□ 1.36
1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 A2mQ6GQT1 1474 aa23.5■■□□□ 1.35
1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 Fancd2Q80V62 1450 aa23.5■■□□□ 1.35
1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 Qser1A2BIE1 1698 aa23.48■■□□□ 1.35
1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 Arap1Q4LDD4 1452 aa23.46■■□□□ 1.35
1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 Abca9Q8K449 1623 aa23.44■■□□□ 1.34
1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 Prex2Q3LAC4 1598 aa23.43■■□□□ 1.34
1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 Hecw2Q6I6G8 1578 aa23.42■■□□□ 1.34
1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 Cul9Q80TT8 1865 aa23.41■■□□□ 1.34
1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 Myt1lP97500 1187 aa23.41■■□□□ 1.34
1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 Ncoa2Q61026 1462 aa23.41■■□□□ 1.34
1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 Cyb5rlB1AS42 316 aa23.39■■□□□ 1.33
1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 Kiaa0556Q8C753 1610 aa23.39■■□□□ 1.33
1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 Naip2Q9QUK4 1447 aa23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 12.6 ms