RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000124246.3

Gt(ROSA)26Sor-201, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Gt(ROSA)26Sor, Length 1,181 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Pla2r1Q62028 1487 aa36.69■■■■□ 3.46
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Top2aQ01320 1528 aaKnown RBP36.69■■■■□ 3.46
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Chd1P40201 1711 aa36.68■■■■□ 3.46
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Ccdc88bQ4QRL3 1481 aa36.66■■■■□ 3.46
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Ythdc2B2RR83 1445 aaKnown RBP36.64■■■■□ 3.46
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 SynmQ70IV5 1561 aa36.63■■■■□ 3.45
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 CadpsQ80TJ1 1355 aa36.6■■■■□ 3.45
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Shroom4Q1W617 1475 aa36.6■■■■□ 3.45
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Pprc1Q6NZN1 1644 aa36.57■■■■□ 3.44
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Rapgef2Q8CHG7 1496 aa36.55■■■■□ 3.44
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Dnmt1P13864 1620 aaKnown RBP36.51■■■■□ 3.43
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Soga1E1U8D0 1418 aa36.45■■■■□ 3.43
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Abca16E9PWJ7 1678 aa36.39■■■■□ 3.42
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Setbp1Q9Z180 1582 aa36.36■■■■□ 3.41
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Zeb1Q64318 1117 aa36.35■■■■□ 3.41
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Neo1P97798 1493 aa36.35■■■■□ 3.41
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Abcc2Q8VI47 1543 aa36.34■■■■□ 3.41
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Arhgap27A2AB59 869 aa36.34■■■■□ 3.41
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 WizO88286 1684 aaKnown RBP36.32■■■■□ 3.41
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 BC005561E9Q5E2 1589 aa36.32■■■■□ 3.41
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Chic1Q8CBW7 227 aa36.32■■■■□ 3.4
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 TchhA0A0B4J1F9 1599 aa36.32■■■■□ 3.4
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Map3k4O08648 1597 aa36.31■■■■□ 3.4
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Ak9G3UYQ4 1894 aa36.26■■■■□ 3.4
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Gm14025A2AP89 1413 aa36.26■■■■□ 3.4
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 PxdnQ3UQ28 1475 aa36.25■■■■□ 3.39
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Adamts12Q811B3 1600 aa36.23■■■■□ 3.39
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Ppp1r18Q8BQ30 594 aa36.17■■■■□ 3.38
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 EprsQ8CGC7 1512 aaKnown RBP36.17■■■■□ 3.38
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 AI481877A2ALV5 1481 aa36.17■■■■□ 3.38
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Mroh2bQ7M6Y6 1581 aa36.1■■■■□ 3.37
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Eif4g1Q6NZJ6 1600 aaKnown RBP36.08■■■■□ 3.37
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Arhgef12Q8R4H2 1543 aaKnown RBP36.08■■■■□ 3.37
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Slx4Q6P1D7 1565 aa36.06■■■■□ 3.36
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Ifnlr1Q8CGK5 535 aa35.95■■■■□ 3.35
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Npm2Q80W85 207 aa35.92■■■■□ 3.34
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Jph4Q80WT0 628 aa35.92■■■■□ 3.34
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Rpap1Q80TE0 1409 aa35.91■■■■□ 3.34
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Clasp1Q80TV8 1535 aaKnown RBP35.85■■■■□ 3.33
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Gm7298A0A0N4SVU1 1476 aa35.82■■■■□ 3.32
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Carmil1Q6EDY6 1374 aa35.82■■■■□ 3.32
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 AdgbG3UZ78 1657 aa35.81■■■■□ 3.32
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Map3k1P53349 1493 aa35.79■■■■□ 3.32
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Ttc37F8VPK0 1563 aa35.78■■■■□ 3.32
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Plekhg3Q4VAC9 1341 aa35.74■■■■□ 3.31
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Fkbp15Q6P9Q6 1216 aaKnown RBP35.73■■■■□ 3.31
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Abca5Q8K448 1642 aa35.72■■■■□ 3.31
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Mapkbp1Q6NS57 1503 aa35.71■■■■□ 3.31
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Igf1rQ60751 1373 aa35.67■■■■□ 3.3
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Polr1aO35134 1717 aaKnown RBP35.66■■■■□ 3.3
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Arid3cA6PWV5 409 aa35.66■■■■□ 3.3
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Rrbp1Q99PL5 1605 aaKnown RBP35.65■■■■□ 3.3
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Lrrc9Q8CDN9 1456 aa35.62■■■■□ 3.29
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 WrnO09053 1401 aa35.61■■■■□ 3.29
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Depdc5P61460 1591 aa35.59■■■■□ 3.29
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Arhgef11Q68FM7 1552 aa35.59■■■■□ 3.29
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Kdm5bQ80Y84 1544 aa35.57■■■■□ 3.29
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Arhgap35Q91YM2 1499 aa35.57■■■■□ 3.28
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Znf608Q56A10 1511 aa35.5■■■■□ 3.27
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Zfyve16Q80U44 1528 aa35.5■■■■□ 3.27
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Wdr7Q920I9 1489 aa35.44■■■■□ 3.26
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Alpk3Q924C5 1678 aa35.43■■■■□ 3.26
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Fndc1E9Q043 1732 aa35.4■■■■□ 3.26
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Cux1P53564 1515 aa35.4■■■■□ 3.26
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Cul7Q8VE73 1689 aa35.38■■■■□ 3.25
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 NhsB1AV60 1647 aa35.35■■■■□ 3.25
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Clip1Q922J3 1391 aa35.33■■■■□ 3.25
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Arhgap31A6X8Z5 1425 aa35.29■■■■□ 3.24
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Plppr3Q7TPB0 716 aa35.28■■■■□ 3.24
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Gab3Q8BSM5 595 aa35.27■■■■□ 3.24
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Fyco1Q8VDC1 1437 aa35.26■■■■□ 3.24
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Ccdc141E9Q8Q6 1531 aa35.24■■■■□ 3.23
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Atp10dQ8K2X1 1416 aa35.22■■■■□ 3.23
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 AglF8VPN4 1532 aa35.22■■■■□ 3.23
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Dnajc5gQ8C632 165 aa35.16■■■■□ 3.22
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Gcc2Q8CHG3 1679 aa35.13■■■■□ 3.21
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Cep162Q6ZQ06 1403 aa35.11■■■■□ 3.21
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Mroh2aD3Z750 1679 aa35.08■■■■□ 3.21
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Kiaa1210E9Q0C6 1637 aa35.03■■■■□ 3.2
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Myt1lP97500 1187 aa35.02■■■■□ 3.2
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Abca8bQ8K440 1620 aa35■■■■□ 3.19
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Rnf17Q99MV7 1640 aa34.99■■■■□ 3.19
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 MlecQ6ZQI3 291 aaKnown RBP34.97■■■■□ 3.19
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Rapgef6Q5NCJ1 1609 aa34.96■■■■□ 3.19
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Ncoa2Q61026 1462 aa34.95■■■■□ 3.19
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Fancd2Q80V62 1450 aa34.95■■■■□ 3.19
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 BlmO88700 1416 aa34.91■■■■□ 3.18
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Ankrd26Q811D2 1581 aa34.91■■■■□ 3.18
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 A2mQ6GQT1 1474 aa34.9■■■■□ 3.18
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Kdm6bQ5NCY0 1641 aa34.85■■■■□ 3.17
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Aebp1Q640N1 1128 aa34.85■■■■□ 3.17
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Kif27Q7M6Z4 1394 aa34.82■■■■□ 3.16
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Arap1Q4LDD4 1452 aa34.8■■■■□ 3.16
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Magi1Q6RHR9 1471 aa34.78■■■■□ 3.16
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Brwd3A2AHJ4 1799 aa34.78■■■■□ 3.16
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 HrcG5E8J6 738 aa34.76■■■■□ 3.16
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Cyb5rlB1AS42 316 aa34.74■■■■□ 3.15
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Naip2Q9QUK4 1447 aa34.71■■■■□ 3.15
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Prex2Q3LAC4 1598 aa34.7■■■■□ 3.15
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Mlh3A0A1Y7VMP7 1443 aa34.67■■■■□ 3.14
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