RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000109241.4

Snx18-201, Transcript of Sorting nexin-18, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Snx18, Length 4,447 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx18-201ENSMUST00000109241 Ccdc18Q640L5 1455 aa21.27■■□□□ 1
Snx18-201ENSMUST00000109241 Ercc6F8VPZ5 1481 aa21.25■□□□□ 0.99
Snx18-201ENSMUST00000109241 Fam71e1A1L3C1 212 aa21.24■□□□□ 0.99
Snx18-201ENSMUST00000109241 Chic2Q9D9G3 165 aa21.24■□□□□ 0.99
Snx18-201ENSMUST00000109241 Pds5bQ4VA53 1446 aaKnown RBP21.23■□□□□ 0.99
Snx18-201ENSMUST00000109241 Hnrnpul2Q00PI9 745 aaKnown RBP21.22■□□□□ 0.99
Snx18-201ENSMUST00000109241 Mrs2Q5NCE8 434 aa21.2■□□□□ 0.98
Snx18-201ENSMUST00000109241 Wdr43Q6ZQL4 677 aaKnown RBP21.19■□□□□ 0.98
Snx18-201ENSMUST00000109241 ArxO35085 564 aa21.19■□□□□ 0.98
Snx18-201ENSMUST00000109241 Rapgef2Q8CHG7 1496 aa21.14■□□□□ 0.97
Snx18-201ENSMUST00000109241 Prdm10Q3UTQ7 1184 aa21.13■□□□□ 0.97
Snx18-201ENSMUST00000109241 Cttnbp2B9EJA2 1648 aa21.13■□□□□ 0.97
Snx18-201ENSMUST00000109241 Smarca4Q3TKT4 1613 aaKnown RBP21.12■□□□□ 0.97
Snx18-201ENSMUST00000109241 SafbD3YXK2 937 aaKnown RBP21.03■□□□□ 0.96
Snx18-201ENSMUST00000109241 Polr3glQ8R0C0 218 aa21.03■□□□□ 0.96
Snx18-201ENSMUST00000109241 Atad2bE9Q166 1460 aaKnown RBP21.02■□□□□ 0.95
Snx18-201ENSMUST00000109241 Fkbp15Q6P9Q6 1216 aaKnown RBP21.01■□□□□ 0.95
Snx18-201ENSMUST00000109241 Rad21Q61550 635 aaKnown RBP20.99■□□□□ 0.95
Snx18-201ENSMUST00000109241 Nlrp6Q91WS2 869 aa20.99■□□□□ 0.95
Snx18-201ENSMUST00000109241 Erich6D3Z6S9 713 aa20.98■□□□□ 0.95
Snx18-201ENSMUST00000109241 P3h3Q8CG70 732 aa20.97■□□□□ 0.95
Snx18-201ENSMUST00000109241 Mia2Q91ZV0 1396 aa20.95■□□□□ 0.94
Snx18-201ENSMUST00000109241 Hspa5P20029 655 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
Snx18-201ENSMUST00000109241 Ifnlr1Q8CGK5 535 aa20.84■□□□□ 0.93
Snx18-201ENSMUST00000109241 Iqgap2Q3UQ44 1575 aa20.82■□□□□ 0.92
Snx18-201ENSMUST00000109241 Baz1bQ9Z277 1479 aa20.82■□□□□ 0.92
Snx18-201ENSMUST00000109241 Gm13697A2AK42 830 aa20.81■□□□□ 0.92
Snx18-201ENSMUST00000109241 Aebp1Q640N1 1128 aa20.81■□□□□ 0.92
Snx18-201ENSMUST00000109241 Hsp90aa1P07901 733 aaKnown RBP20.8■□□□□ 0.92
Snx18-201ENSMUST00000109241 Upf2A2AT37 1269 aaKnown RBP20.8■□□□□ 0.92
Snx18-201ENSMUST00000109241 Rangap1P46061 589 aaKnown RBP20.8■□□□□ 0.92
Snx18-201ENSMUST00000109241 CntlnA2AM05 1397 aa20.8■□□□□ 0.92
Snx18-201ENSMUST00000109241 Bcl11aQ9QYE3 773 aa20.79■□□□□ 0.92
Snx18-201ENSMUST00000109241 Top2aQ01320 1528 aaKnown RBP20.78■□□□□ 0.92
Snx18-201ENSMUST00000109241 Fyco1Q8VDC1 1437 aa20.78■□□□□ 0.92
Snx18-201ENSMUST00000109241 Hdac5Q9Z2V6 1113 aa20.78■□□□□ 0.92
Snx18-201ENSMUST00000109241 Cc2d2aQ8CFW7 1633 aa20.78■□□□□ 0.92
Snx18-201ENSMUST00000109241 Rgl3Q3UYI5 709 aa20.77■□□□□ 0.91
Snx18-201ENSMUST00000109241 Cux2P70298 1426 aa20.76■□□□□ 0.91
Snx18-201ENSMUST00000109241 Clstn2Q9ER65 966 aa20.75■□□□□ 0.91
Snx18-201ENSMUST00000109241 Ofd1Q80Z25 1017 aa20.73■□□□□ 0.91
Snx18-201ENSMUST00000109241 CanxP35564 591 aaKnown RBP20.73■□□□□ 0.91
Snx18-201ENSMUST00000109241 Arhgap35Q91YM2 1499 aa20.72■□□□□ 0.91
Snx18-201ENSMUST00000109241 Carmil1Q6EDY6 1374 aa20.72■□□□□ 0.91
Snx18-201ENSMUST00000109241 Arhgap27A2AB59 869 aa20.7■□□□□ 0.9
Snx18-201ENSMUST00000109241 Kif27Q7M6Z4 1394 aa20.7■□□□□ 0.9
Snx18-201ENSMUST00000109241 Atp1b4Q99ME6 356 aa20.7■□□□□ 0.9
Snx18-201ENSMUST00000109241 Phldb1Q6PDH0 1371 aaKnown RBP20.68■□□□□ 0.9
Snx18-201ENSMUST00000109241 Ccdc9Q8VC31 543 aaKnown RBP20.67■□□□□ 0.9
Snx18-201ENSMUST00000109241 Mtus2Q3UHD3 1353 aa20.66■□□□□ 0.9
Snx18-201ENSMUST00000109241 BicraF8VPZ9 1578 aa20.65■□□□□ 0.9
Snx18-201ENSMUST00000109241 Top2bQ64511 1612 aa20.62■□□□□ 0.89
Snx18-201ENSMUST00000109241 Ccdc27Q3V036 639 aa20.62■□□□□ 0.89
Snx18-201ENSMUST00000109241 Trim30dE9PWL0 497 aa20.61■□□□□ 0.89
Snx18-201ENSMUST00000109241 Cwc22Q8C5N3 908 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
Snx18-201ENSMUST00000109241 LrpprcQ6PB66 1392 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
Snx18-201ENSMUST00000109241 Slc4a3P16283 1227 aa20.59■□□□□ 0.89
Snx18-201ENSMUST00000109241 Grwd1Q810D6 446 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.88
Snx18-201ENSMUST00000109241 Sin3aQ60520 1274 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.88
Snx18-201ENSMUST00000109241 Pkd2O35245 966 aa20.57■□□□□ 0.88
Snx18-201ENSMUST00000109241 Card11Q8CIS0 1159 aa20.56■□□□□ 0.88
Snx18-201ENSMUST00000109241 Shroom4Q1W617 1475 aa20.55■□□□□ 0.88
Snx18-201ENSMUST00000109241 Vsig10D3YX43 558 aa20.55■□□□□ 0.88
Snx18-201ENSMUST00000109241 Wwc2Q6NXJ0 1187 aa20.54■□□□□ 0.88
Snx18-201ENSMUST00000109241 Mphosph9A6H5Y1 991 aa20.53■□□□□ 0.88
Snx18-201ENSMUST00000109241 Cabp1Q9JLK7 227 aa20.53■□□□□ 0.88
Snx18-201ENSMUST00000109241 Rpap1Q80TE0 1409 aa20.52■□□□□ 0.88
Snx18-201ENSMUST00000109241 Hsp90ab1P11499 724 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
Snx18-201ENSMUST00000109241 Trim26Q99PN3 545 aa20.5■□□□□ 0.87
Snx18-201ENSMUST00000109241 Apbb1Q9QXJ1 710 aa20.5■□□□□ 0.87
Snx18-201ENSMUST00000109241 DekQ7TNV0 380 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
Snx18-201ENSMUST00000109241 Ythdc1E9Q5K9 736 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
Snx18-201ENSMUST00000109241 Ccnb3Q810T2 1396 aa20.46■□□□□ 0.87
Snx18-201ENSMUST00000109241 Ncapd3Q6ZQK0 1506 aa20.45■□□□□ 0.86
Snx18-201ENSMUST00000109241 Arap1Q4LDD4 1452 aa20.44■□□□□ 0.86
Snx18-201ENSMUST00000109241 NrkQ9R0G8 1455 aa20.44■□□□□ 0.86
Snx18-201ENSMUST00000109241 Supt16hQ920B9 1047 aa20.43■□□□□ 0.86
Snx18-201ENSMUST00000109241 Arid4bA2CG63 1314 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
Snx18-201ENSMUST00000109241 Rrp7aQ9D1C9 280 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
Snx18-201ENSMUST00000109241 Dhx29Q6PGC1 1365 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
Snx18-201ENSMUST00000109241 Dbr1Q923B1 550 aa20.42■□□□□ 0.86
Snx18-201ENSMUST00000109241 Efcab5A0JP43 1406 aa20.42■□□□□ 0.86
Snx18-201ENSMUST00000109241 Naip1Q9QWK5 1403 aa20.41■□□□□ 0.86
Snx18-201ENSMUST00000109241 PtprkP35822 1457 aa20.39■□□□□ 0.86
Snx18-201ENSMUST00000109241 B4galnt3Q6L8S8 986 aa20.39■□□□□ 0.85
Snx18-201ENSMUST00000109241 UacaQ8CGB3 1411 aa20.38■□□□□ 0.85
Snx18-201ENSMUST00000109241 Map3k1P53349 1493 aa20.38■□□□□ 0.85
Snx18-201ENSMUST00000109241 Lmod3E9QA62 571 aa20.37■□□□□ 0.85
Snx18-201ENSMUST00000109241 Trim44Q9QXA7 346 aa20.37■□□□□ 0.85
Snx18-201ENSMUST00000109241 Mroh3A0A1D5RM54 893 aa20.36■□□□□ 0.85
Snx18-201ENSMUST00000109241 Map4P27546 1125 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
Snx18-201ENSMUST00000109241 Rundc1Q0VDN7 615 aa20.35■□□□□ 0.85
Snx18-201ENSMUST00000109241 Fhad1A6PWD2 1420 aa20.35■□□□□ 0.85
Snx18-201ENSMUST00000109241 Irx3P81067 507 aa20.35■□□□□ 0.85
Snx18-201ENSMUST00000109241 Trak1Q6PD31 939 aa20.35■□□□□ 0.85
Snx18-201ENSMUST00000109241 Neurod2Q62414 383 aa20.34■□□□□ 0.85
Snx18-201ENSMUST00000109241 Exoc6Q8R313 802 aa20.34■□□□□ 0.85
Snx18-201ENSMUST00000109241 Arhgef5E9Q7D5 1581 aa20.34■□□□□ 0.85
Snx18-201ENSMUST00000109241 Frmpd1A2AKB4 1549 aa20.33■□□□□ 0.85
Snx18-201ENSMUST00000109241 Gm13695A2AK44 830 aa20.33■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 12 ms