RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000035812.13

Ttl-201, Transcript of Tubulin--tyrosine ligase, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ttl, Length 4,567 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttl-201ENSMUST00000035812 Ppp1r18Q8BQ30 594 aa22.86■■□□□ 1.25
Ttl-201ENSMUST00000035812 Ccer2J3QPU5 274 aa22.85■■□□□ 1.25
Ttl-201ENSMUST00000035812 Prdm10Q3UTQ7 1184 aa22.84■■□□□ 1.25
Ttl-201ENSMUST00000035812 Rpap1Q80TE0 1409 aa22.84■■□□□ 1.25
Ttl-201ENSMUST00000035812 Clstn2Q9ER65 966 aa22.82■■□□□ 1.24
Ttl-201ENSMUST00000035812 Aebp1Q640N1 1128 aa22.81■■□□□ 1.24
Ttl-201ENSMUST00000035812 Kif27Q7M6Z4 1394 aa22.8■■□□□ 1.24
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Ttl-201ENSMUST00000035812 P3h3Q8CG70 732 aa22.68■■□□□ 1.22
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Ttl-201ENSMUST00000035812 Kdm2aP59997 1161 aa22.44■■□□□ 1.18
Ttl-201ENSMUST00000035812 Rad54l2Q99NG0 1466 aa22.44■■□□□ 1.18
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Ttl-201ENSMUST00000035812 Nlrp6Q91WS2 869 aa22.39■■□□□ 1.17
Ttl-201ENSMUST00000035812 Soga1E1U8D0 1418 aa22.38■■□□□ 1.17
Ttl-201ENSMUST00000035812 Jph4Q80WT0 628 aa22.38■■□□□ 1.17
Ttl-201ENSMUST00000035812 Duox2A2AQ99 1517 aa22.38■■□□□ 1.17
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Ttl-201ENSMUST00000035812 Shroom4Q1W617 1475 aa22.26■■□□□ 1.15
Ttl-201ENSMUST00000035812 Sart1Q9Z315 806 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
Ttl-201ENSMUST00000035812 Mia2Q91ZV0 1396 aa22.25■■□□□ 1.15
Ttl-201ENSMUST00000035812 Srpk2O54781 681 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
Ttl-201ENSMUST00000035812 Plb1Q3TTY0 1478 aa22.24■■□□□ 1.15
Ttl-201ENSMUST00000035812 Dhx57Q6P5D3 1388 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
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Ttl-201ENSMUST00000035812 Kif3bQ61771 747 aa22.21■■□□□ 1.15
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Ttl-201ENSMUST00000035812 Trak1Q6PD31 939 aa22.19■■□□□ 1.14
Ttl-201ENSMUST00000035812 Ccnb3Q810T2 1396 aa22.18■■□□□ 1.14
Ttl-201ENSMUST00000035812 Grin2bQ01097 1482 aa22.17■■□□□ 1.14
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Ttl-201ENSMUST00000035812 IqubQ8CDK3 788 aa22.14■■□□□ 1.14
Ttl-201ENSMUST00000035812 Pkd2O35245 966 aa22.14■■□□□ 1.14
Ttl-201ENSMUST00000035812 Fgd6Q69ZL1 1399 aa22.13■■□□□ 1.13
Ttl-201ENSMUST00000035812 Top2aQ01320 1528 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
Ttl-201ENSMUST00000035812 NrkQ9R0G8 1455 aa22.11■■□□□ 1.13
Ttl-201ENSMUST00000035812 PtprkP35822 1457 aa22.1■■□□□ 1.13
Ttl-201ENSMUST00000035812 Card11Q8CIS0 1159 aa22.08■■□□□ 1.13
Ttl-201ENSMUST00000035812 Polr3glQ8R0C0 218 aa22.07■■□□□ 1.12
Ttl-201ENSMUST00000035812 Tdrd9Q14BI7 1383 aa22.06■■□□□ 1.12
Ttl-201ENSMUST00000035812 NgefQ8CHT1 710 aa22.04■■□□□ 1.12
Ttl-201ENSMUST00000035812 Arid4bA2CG63 1314 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
Ttl-201ENSMUST00000035812 Ift140E9PY46 1464 aa22.03■■□□□ 1.12
Ttl-201ENSMUST00000035812 Arhgap35Q91YM2 1499 aa22.03■■□□□ 1.12
Ttl-201ENSMUST00000035812 Mphosph9A6H5Y1 991 aa22.02■■□□□ 1.12
Ttl-201ENSMUST00000035812 Exosc9Q9JHI7 438 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
Ttl-201ENSMUST00000035812 Tnnt3Q9QZ47 272 aa22.02■■□□□ 1.12
Ttl-201ENSMUST00000035812 Cc2d2bA0A286YDU8 1405 aa22■■□□□ 1.11
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Ttl-201ENSMUST00000035812 Plekhh2Q8C115 1491 aa22■■□□□ 1.11
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Ttl-201ENSMUST00000035812 Arhgap31A6X8Z5 1425 aa21.95■■□□□ 1.1
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Ttl-201ENSMUST00000035812 Ifit1bl1D3Z6F0 470 aa21.94■■□□□ 1.1
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Ttl-201ENSMUST00000035812 Gm7298A0A0N4SVU1 1476 aa21.94■■□□□ 1.1
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Ttl-201ENSMUST00000035812 Rad21Q61550 635 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
Ttl-201ENSMUST00000035812 Ncoa2Q61026 1462 aa21.91■■□□□ 1.1
Ttl-201ENSMUST00000035812 Crocc2F6XLV1 1638 aa21.9■■□□□ 1.1
Ttl-201ENSMUST00000035812 Gm14025A2AP89 1413 aa21.9■■□□□ 1.1
Ttl-201ENSMUST00000035812 Cnga1P29974 684 aa21.89■■□□□ 1.1
Ttl-201ENSMUST00000035812 CadpsQ80TJ1 1355 aa21.89■■□□□ 1.1
Ttl-201ENSMUST00000035812 EprsQ8CGC7 1512 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
Ttl-201ENSMUST00000035812 Psme1P97371 249 aa21.87■■□□□ 1.09
Ttl-201ENSMUST00000035812 Top2bQ64511 1612 aa21.86■■□□□ 1.09
Ttl-201ENSMUST00000035812 Polr1aO35134 1717 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
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