RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000018713.12

Cldn7-201, Transcript of Claudin-7, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Cldn7, Length 1,335 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn7-201ENSMUST00000018713 AqrQ8CFQ3 1481 aaKnown RBP27.25■■□□□ 1.95
Cldn7-201ENSMUST00000018713 Rad54l2Q99NG0 1466 aa27.25■■□□□ 1.95
Cldn7-201ENSMUST00000018713 Grin2bQ01097 1482 aa27.21■■□□□ 1.95
Cldn7-201ENSMUST00000018713 Ppp1r18Q8BQ30 594 aa27.19■■□□□ 1.94
Cldn7-201ENSMUST00000018713 NrkQ9R0G8 1455 aa27.18■■□□□ 1.94
Cldn7-201ENSMUST00000018713 Chd1P40201 1711 aa27.18■■□□□ 1.94
Cldn7-201ENSMUST00000018713 Grin2aP35436 1464 aa27.17■■□□□ 1.94
Cldn7-201ENSMUST00000018713 Magi3Q9EQJ9 1476 aa27.12■■□□□ 1.93
Cldn7-201ENSMUST00000018713 Setbp1Q9Z180 1582 aa27.11■■□□□ 1.93
Cldn7-201ENSMUST00000018713 Efcab5A0JP43 1406 aa27.07■■□□□ 1.92
Cldn7-201ENSMUST00000018713 Ak9G3UYQ4 1894 aa27.05■■□□□ 1.92
Cldn7-201ENSMUST00000018713 CadpsQ80TJ1 1355 aa27.05■■□□□ 1.92
Cldn7-201ENSMUST00000018713 Shroom4Q1W617 1475 aa27.02■■□□□ 1.92
Cldn7-201ENSMUST00000018713 Soga1E1U8D0 1418 aa26.98■■□□□ 1.91
Cldn7-201ENSMUST00000018713 Ifnlr1Q8CGK5 535 aa26.9■■□□□ 1.9
Cldn7-201ENSMUST00000018713 Dnmt1P13864 1620 aaKnown RBP26.86■■□□□ 1.89
Cldn7-201ENSMUST00000018713 Gab3Q8BSM5 595 aa26.86■■□□□ 1.89
Cldn7-201ENSMUST00000018713 Pla2r1Q62028 1487 aa26.84■■□□□ 1.89
Cldn7-201ENSMUST00000018713 Neo1P97798 1493 aa26.83■■□□□ 1.88
Cldn7-201ENSMUST00000018713 AI481877A2ALV5 1481 aa26.82■■□□□ 1.88
Cldn7-201ENSMUST00000018713 Arhgap27A2AB59 869 aa26.81■■□□□ 1.88
Cldn7-201ENSMUST00000018713 Eif4g1Q6NZJ6 1600 aaKnown RBP26.79■■□□□ 1.88
Cldn7-201ENSMUST00000018713 Alpk3Q924C5 1678 aa26.79■■□□□ 1.88
Cldn7-201ENSMUST00000018713 Cep162Q6ZQ06 1403 aa26.78■■□□□ 1.88
Cldn7-201ENSMUST00000018713 Map3k1P53349 1493 aa26.78■■□□□ 1.88
Cldn7-201ENSMUST00000018713 Npm2Q80W85 207 aa26.77■■□□□ 1.88
Cldn7-201ENSMUST00000018713 Plppr3Q7TPB0 716 aa26.76■■□□□ 1.87
Cldn7-201ENSMUST00000018713 Gm14025A2AP89 1413 aa26.76■■□□□ 1.87
Cldn7-201ENSMUST00000018713 EprsQ8CGC7 1512 aaKnown RBP26.76■■□□□ 1.87
Cldn7-201ENSMUST00000018713 BC005561E9Q5E2 1589 aa26.74■■□□□ 1.87
Cldn7-201ENSMUST00000018713 AdgbG3UZ78 1657 aa26.72■■□□□ 1.87
Cldn7-201ENSMUST00000018713 Gpatch8A2A6A1 1505 aa26.72■■□□□ 1.87
Cldn7-201ENSMUST00000018713 Mroh2bQ7M6Y6 1581 aa26.7■■□□□ 1.86
Cldn7-201ENSMUST00000018713 Abcc2Q8VI47 1543 aa26.69■■□□□ 1.86
Cldn7-201ENSMUST00000018713 Ttc37F8VPK0 1563 aa26.66■■□□□ 1.86
Cldn7-201ENSMUST00000018713 Abca16E9PWJ7 1678 aa26.65■■□□□ 1.86
Cldn7-201ENSMUST00000018713 Arhgap35Q91YM2 1499 aa26.65■■□□□ 1.86
Cldn7-201ENSMUST00000018713 Clasp1Q80TV8 1535 aaKnown RBP26.65■■□□□ 1.86
Cldn7-201ENSMUST00000018713 SynmQ70IV5 1561 aa26.64■■□□□ 1.86
Cldn7-201ENSMUST00000018713 Arhgef11Q68FM7 1552 aa26.63■■□□□ 1.85
Cldn7-201ENSMUST00000018713 Map3k4O08648 1597 aa26.63■■□□□ 1.85
Cldn7-201ENSMUST00000018713 Mapkbp1Q6NS57 1503 aa26.62■■□□□ 1.85
Cldn7-201ENSMUST00000018713 Arid3cA6PWV5 409 aa26.59■■□□□ 1.85
Cldn7-201ENSMUST00000018713 PxdnQ3UQ28 1475 aa26.58■■□□□ 1.85
Cldn7-201ENSMUST00000018713 WizO88286 1684 aaKnown RBP26.58■■□□□ 1.85
Cldn7-201ENSMUST00000018713 Arhgef12Q8R4H2 1543 aaKnown RBP26.58■■□□□ 1.85
Cldn7-201ENSMUST00000018713 Cyb5rlB1AS42 316 aa26.57■■□□□ 1.84
Cldn7-201ENSMUST00000018713 Dnajc5gQ8C632 165 aa26.56■■□□□ 1.84
Cldn7-201ENSMUST00000018713 Depdc5P61460 1591 aa26.53■■□□□ 1.84
Cldn7-201ENSMUST00000018713 TchhA0A0B4J1F9 1599 aa26.52■■□□□ 1.84
Cldn7-201ENSMUST00000018713 Zeb1Q64318 1117 aa26.5■■□□□ 1.83
Cldn7-201ENSMUST00000018713 Carmil1Q6EDY6 1374 aa26.5■■□□□ 1.83
Cldn7-201ENSMUST00000018713 Fkbp15Q6P9Q6 1216 aaKnown RBP26.5■■□□□ 1.83
Cldn7-201ENSMUST00000018713 MlecQ6ZQI3 291 aaKnown RBP26.5■■□□□ 1.83
Cldn7-201ENSMUST00000018713 Jph4Q80WT0 628 aa26.46■■□□□ 1.83
Cldn7-201ENSMUST00000018713 Clip1Q922J3 1391 aa26.46■■□□□ 1.83
Cldn7-201ENSMUST00000018713 Fndc1E9Q043 1732 aa26.45■■□□□ 1.82
Cldn7-201ENSMUST00000018713 Slx4Q6P1D7 1565 aa26.45■■□□□ 1.82
Cldn7-201ENSMUST00000018713 Polr1aO35134 1717 aaKnown RBP26.44■■□□□ 1.82
Cldn7-201ENSMUST00000018713 Adamts12Q811B3 1600 aa26.4■■□□□ 1.82
Cldn7-201ENSMUST00000018713 Rpap1Q80TE0 1409 aa26.38■■□□□ 1.81
Cldn7-201ENSMUST00000018713 Zfyve16Q80U44 1528 aa26.38■■□□□ 1.81
Cldn7-201ENSMUST00000018713 Brwd3A2AHJ4 1799 aa26.33■■□□□ 1.81
Cldn7-201ENSMUST00000018713 Lrrc9Q8CDN9 1456 aa26.33■■□□□ 1.8
Cldn7-201ENSMUST00000018713 Myt1lP97500 1187 aa26.31■■□□□ 1.8
Cldn7-201ENSMUST00000018713 Znf608Q56A10 1511 aa26.3■■□□□ 1.8
Cldn7-201ENSMUST00000018713 Ercc6l2Q9JIM3 1537 aa26.29■■□□□ 1.8
Cldn7-201ENSMUST00000018713 Igf1rQ60751 1373 aa26.27■■□□□ 1.8
Cldn7-201ENSMUST00000018713 Hecw2Q6I6G8 1578 aa26.24■■□□□ 1.79
Cldn7-201ENSMUST00000018713 Eea1Q8BL66 1411 aa26.23■■□□□ 1.79
Cldn7-201ENSMUST00000018713 Fyco1Q8VDC1 1437 aa26.21■■□□□ 1.79
Cldn7-201ENSMUST00000018713 Erich3F6QRE9 1637 aa26.18■■□□□ 1.78
Cldn7-201ENSMUST00000018713 Fbxo41Q6NS60 873 aa26.15■■□□□ 1.78
Cldn7-201ENSMUST00000018713 Ankrd26Q811D2 1581 aa26.14■■□□□ 1.78
Cldn7-201ENSMUST00000018713 Cux1P53564 1515 aa26.11■■□□□ 1.77
Cldn7-201ENSMUST00000018713 Kdm6bQ5NCY0 1641 aa26.11■■□□□ 1.77
Cldn7-201ENSMUST00000018713 Setd5Q5XJV7 1441 aa26.1■■□□□ 1.77
Cldn7-201ENSMUST00000018713 Wdr7Q920I9 1489 aa26.09■■□□□ 1.77
Cldn7-201ENSMUST00000018713 Kdm5bQ80Y84 1544 aa26.09■■□□□ 1.77
Cldn7-201ENSMUST00000018713 Abca5Q8K448 1642 aa26.09■■□□□ 1.77
Cldn7-201ENSMUST00000018713 Gm7298A0A0N4SVU1 1476 aa26.08■■□□□ 1.77
Cldn7-201ENSMUST00000018713 Cypt1Q8CH20 168 aa26.04■■□□□ 1.76
Cldn7-201ENSMUST00000018713 WrnO09053 1401 aa26.02■■□□□ 1.76
Cldn7-201ENSMUST00000018713 Rnf17Q99MV7 1640 aa26.02■■□□□ 1.76
Cldn7-201ENSMUST00000018713 Rrbp1Q99PL5 1605 aaKnown RBP26.02■■□□□ 1.76
Cldn7-201ENSMUST00000018713 AglF8VPN4 1532 aa26.01■■□□□ 1.75
Cldn7-201ENSMUST00000018713 Lmo7E9PYF4 1699 aaKnown RBP25.99■■□□□ 1.75
Cldn7-201ENSMUST00000018713 Arap1Q4LDD4 1452 aa25.95■■□□□ 1.75
Cldn7-201ENSMUST00000018713 Cul7Q8VE73 1689 aa25.94■■□□□ 1.74
Cldn7-201ENSMUST00000018713 NhsB1AV60 1647 aa25.91■■□□□ 1.74
Cldn7-201ENSMUST00000018713 Naip2Q9QUK4 1447 aa25.91■■□□□ 1.74
Cldn7-201ENSMUST00000018713 Atp10dQ8K2X1 1416 aa25.9■■□□□ 1.74
Cldn7-201ENSMUST00000018713 Pcf11G3X9Z4 1553 aa25.89■■□□□ 1.74
Cldn7-201ENSMUST00000018713 CntlnA2AM05 1397 aa25.89■■□□□ 1.73
Cldn7-201ENSMUST00000018713 BlmO88700 1416 aa25.86■■□□□ 1.73
Cldn7-201ENSMUST00000018713 Peg3Q3URU2 1571 aa25.86■■□□□ 1.73
Cldn7-201ENSMUST00000018713 Tiam1Q60610 1591 aa25.82■■□□□ 1.72
Cldn7-201ENSMUST00000018713 Aebp1Q640N1 1128 aa25.81■■□□□ 1.72
Cldn7-201ENSMUST00000018713 Arhgap31A6X8Z5 1425 aa25.77■■□□□ 1.72
Cldn7-201ENSMUST00000018713 A2mQ6GQT1 1474 aa25.76■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 13.9 ms