RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000025804.5

Rab1b-201, Transcript of Ras-related protein Rab-1B, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Rab1b, Length 1,835 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Gemin8Q8BHE1 238 aa14.52□□□□□ -0.08
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Hif1anQ8BLR9 349 aa14.52□□□□□ -0.08
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Gm26558Q8BLW8 286 aa14.52□□□□□ -0.08
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Olfr1257Q8VGP0 309 aa14.52□□□□□ -0.08
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Fam96bQ9D187 163 aa14.52□□□□□ -0.08
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Gm17333C6EQI3 125 aa14.52□□□□□ -0.09
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Gm3486L7N2D0 199 aa14.52□□□□□ -0.09
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Pet117P0DJF2 80 aa14.52□□□□□ -0.09
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Rpl27aP14115 148 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Q0VG49 157 aa14.52□□□□□ -0.09
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Lclat1Q3UN02 376 aa14.52□□□□□ -0.09
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Vdac1Q60932 296 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Gal3st2Q6XQH0 394 aa14.52□□□□□ -0.09
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Spink6Q8BT20 105 aa14.52□□□□□ -0.09
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Ndufs8Q8K3J1 212 aa14.52□□□□□ -0.09
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Commd1Q8K4M5 188 aa14.52□□□□□ -0.09
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Hsbp1Q9CQZ1 76 aa14.52□□□□□ -0.09
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Ube2j1Q9JJZ4 318 aa14.52□□□□□ -0.09
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Gm5890A0A140LI04 305 aa14.51□□□□□ -0.09
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Kcnk15B2RVL1 343 aa14.51□□□□□ -0.09
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Ighv3-6P18531 116 aa14.51□□□□□ -0.09
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Dnase1P49183 284 aa14.51□□□□□ -0.09
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Zfp386Q1WWJ5 626 aa14.51□□□□□ -0.09
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Taar5Q5QD14 337 aa14.51□□□□□ -0.09
Rab1b-201ENSMUST00000025804 1810024B03RikQ8BWE1 200 aa14.51□□□□□ -0.09
Rab1b-201ENSMUST00000025804 F930015N05RikQ8C3A3 210 aa14.51□□□□□ -0.09
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Olfr206Q8VGP9 306 aa14.51□□□□□ -0.09
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Siglec12Q91Y57 467 aa14.51□□□□□ -0.09
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Ighv1-31A0A0A6YWK5 117 aa14.5□□□□□ -0.09
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Olfr573-ps1A0A1B0GRU2 297 aa14.5□□□□□ -0.09
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Gm5819E9PZ96 154 aa14.5□□□□□ -0.09
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Vmn1r60G3UY47 300 aa14.5□□□□□ -0.09
Rab1b-201ENSMUST00000025804 GbaP17439 515 aa14.5□□□□□ -0.09
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Meox1P32442 253 aa14.5□□□□□ -0.09
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Tnfsf8P32972 239 aa14.5□□□□□ -0.09
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Lmo4P61969 165 aa14.5□□□□□ -0.09
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Arf6P62331 175 aa14.5□□□□□ -0.09
Rab1b-201ENSMUST00000025804 ClcP97400 68 aa14.5□□□□□ -0.09
Rab1b-201ENSMUST00000025804 F13bQ07968 669 aa14.5□□□□□ -0.09
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Slc35e3Q6PGC7 313 aa14.5□□□□□ -0.09
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Klhdc1Q80YG3 406 aa14.5□□□□□ -0.09
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Harbi1Q8BR93 349 aa14.5□□□□□ -0.09
Rab1b-201ENSMUST00000025804 BC049762Q8C601 163 aa14.5□□□□□ -0.09
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Nxph3Q91VX5 252 aa14.5□□□□□ -0.09
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Rab29Q91YQ1 204 aa14.5□□□□□ -0.09
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Slc50a1Q9CXK4 221 aa14.5□□□□□ -0.09
Rab1b-201ENSMUST00000025804 NagkQ9QZ08 343 aa14.5□□□□□ -0.09
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Trav6-1A0A075B5Z8 112 aa14.5□□□□□ -0.09
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Olfr231E9Q0M4 307 aa14.5□□□□□ -0.09
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Sult2a5K7N6K9 285 aa14.5□□□□□ -0.09
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Hspb7P35385 169 aa14.5□□□□□ -0.09
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Il11P47873 199 aa14.5□□□□□ -0.09
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Isoc2aP85094 206 aa14.5□□□□□ -0.09
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Sap30lQ5SQF8 182 aa14.5□□□□□ -0.09
Rab1b-201ENSMUST00000025804 SepsecsQ6P6M7 504 aa14.5□□□□□ -0.09
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Q8BN57 294 aa14.5□□□□□ -0.09
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Znf146Q8BQN6 292 aa14.5□□□□□ -0.09
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Gpr4Q8BUD0 365 aa14.5□□□□□ -0.09
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Olfr303Q8VFP0 319 aa14.5□□□□□ -0.09
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Olfr1297Q8VGE8 312 aa14.5□□□□□ -0.09
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Rwdd3Q8VIL2 267 aa14.5□□□□□ -0.09
Rab1b-201ENSMUST00000025804 GgactQ923B0 149 aa14.5□□□□□ -0.09
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Znhit3Q9CQK1 151 aa14.5□□□□□ -0.09
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Sec11cQ9D8V7 192 aa14.5□□□□□ -0.09
Rab1b-201ENSMUST00000025804 PbkQ9JJ78 330 aa14.5□□□□□ -0.09
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Bahcc1Q3UHR0 2643 aa14.5□□□□□ -0.09
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Gm44596A0A0N4SVA0 210 aa14.49□□□□□ -0.09
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Gm12355A2A4X6 163 aa14.49□□□□□ -0.09
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Gm14408E9Q6B9 136 aa14.49□□□□□ -0.09
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Gm10666K7N6B8 321 aa14.49□□□□□ -0.09
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Vmn1r114L7N226 321 aa14.49□□□□□ -0.09
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Vmn1r126L7N2C8 321 aa14.49□□□□□ -0.09
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Hist1h2baP70696 127 aa14.49□□□□□ -0.09
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Srsf3P84104 164 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
Rab1b-201ENSMUST00000025804 ShbgP97497 403 aa14.49□□□□□ -0.09
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Fbxw26Q8BI58 466 aa14.49□□□□□ -0.09
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Sft2d2Q8VD57 159 aa14.49□□□□□ -0.09
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Olfr1457Q8VFK3 317 aa14.49□□□□□ -0.09
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Olfr710Q9EP55 310 aa14.49□□□□□ -0.09
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Nek7Q9ES74 302 aa14.49□□□□□ -0.09
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Gng13Q9JMF3 67 aa14.49□□□□□ -0.09
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Ighv1-36A0A0A6YXT2 117 aa14.48□□□□□ -0.09
Rab1b-201ENSMUST00000025804 PhyhO35386 338 aa14.48□□□□□ -0.09
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Prss2P07146 246 aa14.48□□□□□ -0.09
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Ube2kP61087 200 aa14.48□□□□□ -0.09
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Tff1Q08423 87 aa14.48□□□□□ -0.09
Rab1b-201ENSMUST00000025804 FshbQ60687 130 aa14.48□□□□□ -0.09
Rab1b-201ENSMUST00000025804 C030005K15RikQ8BQN9 115 aa14.48□□□□□ -0.09
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Neil3Q8K203 606 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Q8VC23 124 aa14.48□□□□□ -0.09
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Mpped1Q91ZG2 326 aa14.48□□□□□ -0.09
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Srp19Q9D7A6 144 aa14.48□□□□□ -0.09
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Rgs21V9GXQ3 152 aa14.48□□□□□ -0.09
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Unc79Q0KK59 2596 aa14.48□□□□□ -0.09
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Gm21778A0A087WNP8 232 aa14.48□□□□□ -0.09
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Ovol3D3YYM0 189 aa14.48□□□□□ -0.09
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Gm27021M0QWE2 156 aa14.48□□□□□ -0.09
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Ccl2P10148 148 aa14.48□□□□□ -0.09
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Ier2P17950 221 aa14.48□□□□□ -0.09
Rab1b-201ENSMUST00000025804 P18528 98 aa14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 43.4 ms