Protein–RNA interactions for Protein: P97400

Clc, Galectin-10 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 68 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClcP97400 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
ClcP97400 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ClcP97400 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ClcP97400 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ClcP97400 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ClcP97400 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ClcP97400 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
ClcP97400 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
ClcP97400 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ClcP97400 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
ClcP97400 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ClcP97400 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ClcP97400 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
ClcP97400 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ClcP97400 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ClcP97400 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ClcP97400 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
ClcP97400 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ClcP97400 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ClcP97400 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ClcP97400 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ClcP97400 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ClcP97400 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ClcP97400 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ClcP97400 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ClcP97400 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ClcP97400 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
ClcP97400 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ClcP97400 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ClcP97400 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
ClcP97400 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ClcP97400 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ClcP97400 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ClcP97400 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ClcP97400 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ClcP97400 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ClcP97400 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ClcP97400 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ClcP97400 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ClcP97400 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ClcP97400 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ClcP97400 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ClcP97400 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
ClcP97400 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ClcP97400 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ClcP97400 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
ClcP97400 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ClcP97400 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ClcP97400 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ClcP97400 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ClcP97400 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ClcP97400 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ClcP97400 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ClcP97400 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ClcP97400 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ClcP97400 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
ClcP97400 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ClcP97400 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ClcP97400 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ClcP97400 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ClcP97400 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ClcP97400 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ClcP97400 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ClcP97400 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ClcP97400 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ClcP97400 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ClcP97400 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ClcP97400 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ClcP97400 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ClcP97400 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ClcP97400 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ClcP97400 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ClcP97400 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ClcP97400 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ClcP97400 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ClcP97400 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ClcP97400 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ClcP97400 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ClcP97400 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ClcP97400 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ClcP97400 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ClcP97400 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ClcP97400 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ClcP97400 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ClcP97400 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ClcP97400 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ClcP97400 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ClcP97400 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ClcP97400 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ClcP97400 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ClcP97400 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ClcP97400 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ClcP97400 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ClcP97400 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ClcP97400 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ClcP97400 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ClcP97400 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ClcP97400 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ClcP97400 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ClcP97400 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms