Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK1

Znhit3, Zinc finger HIT domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 151 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znhit3Q9CQK1 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
Znhit3Q9CQK1 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Znhit3Q9CQK1 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Znhit3Q9CQK1 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
Znhit3Q9CQK1 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC29■■■□□ 2.23
Znhit3Q9CQK1 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Znhit3Q9CQK1 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Znhit3Q9CQK1 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Znhit3Q9CQK1 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Znhit3Q9CQK1 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Znhit3Q9CQK1 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Znhit3Q9CQK1 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Znhit3Q9CQK1 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Znhit3Q9CQK1 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Znhit3Q9CQK1 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Znhit3Q9CQK1 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Znhit3Q9CQK1 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Znhit3Q9CQK1 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Znhit3Q9CQK1 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Znhit3Q9CQK1 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Znhit3Q9CQK1 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Znhit3Q9CQK1 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Znhit3Q9CQK1 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Znhit3Q9CQK1 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Znhit3Q9CQK1 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Znhit3Q9CQK1 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Znhit3Q9CQK1 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Znhit3Q9CQK1 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Znhit3Q9CQK1 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Znhit3Q9CQK1 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Znhit3Q9CQK1 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Znhit3Q9CQK1 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Znhit3Q9CQK1 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
Znhit3Q9CQK1 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Znhit3Q9CQK1 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Znhit3Q9CQK1 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Znhit3Q9CQK1 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Znhit3Q9CQK1 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Znhit3Q9CQK1 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Znhit3Q9CQK1 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Znhit3Q9CQK1 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Znhit3Q9CQK1 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Znhit3Q9CQK1 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Znhit3Q9CQK1 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Znhit3Q9CQK1 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Znhit3Q9CQK1 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Znhit3Q9CQK1 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Znhit3Q9CQK1 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Znhit3Q9CQK1 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Znhit3Q9CQK1 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Znhit3Q9CQK1 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Znhit3Q9CQK1 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Znhit3Q9CQK1 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Znhit3Q9CQK1 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Znhit3Q9CQK1 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Znhit3Q9CQK1 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Znhit3Q9CQK1 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Znhit3Q9CQK1 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Znhit3Q9CQK1 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Znhit3Q9CQK1 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Znhit3Q9CQK1 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Znhit3Q9CQK1 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Znhit3Q9CQK1 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Znhit3Q9CQK1 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Znhit3Q9CQK1 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Znhit3Q9CQK1 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Znhit3Q9CQK1 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Znhit3Q9CQK1 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Znhit3Q9CQK1 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Znhit3Q9CQK1 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Znhit3Q9CQK1 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Znhit3Q9CQK1 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Znhit3Q9CQK1 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Znhit3Q9CQK1 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Znhit3Q9CQK1 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Znhit3Q9CQK1 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Znhit3Q9CQK1 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Znhit3Q9CQK1 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Znhit3Q9CQK1 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Znhit3Q9CQK1 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Znhit3Q9CQK1 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Znhit3Q9CQK1 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Znhit3Q9CQK1 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Znhit3Q9CQK1 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Znhit3Q9CQK1 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Znhit3Q9CQK1 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Znhit3Q9CQK1 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Znhit3Q9CQK1 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Znhit3Q9CQK1 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Znhit3Q9CQK1 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Znhit3Q9CQK1 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Znhit3Q9CQK1 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Znhit3Q9CQK1 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Znhit3Q9CQK1 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Znhit3Q9CQK1 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Znhit3Q9CQK1 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Znhit3Q9CQK1 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Znhit3Q9CQK1 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Znhit3Q9CQK1 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Znhit3Q9CQK1 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
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