Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHE1

Gemin8, Gem-associated protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gemin8Q8BHE1 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
Gemin8Q8BHE1 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Gemin8Q8BHE1 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Gemin8Q8BHE1 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Gemin8Q8BHE1 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Gemin8Q8BHE1 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Gemin8Q8BHE1 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Gemin8Q8BHE1 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Gemin8Q8BHE1 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Gemin8Q8BHE1 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Gemin8Q8BHE1 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Gemin8Q8BHE1 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Gemin8Q8BHE1 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Gemin8Q8BHE1 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Gemin8Q8BHE1 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Gemin8Q8BHE1 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Gemin8Q8BHE1 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Gemin8Q8BHE1 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Gemin8Q8BHE1 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gemin8Q8BHE1 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gemin8Q8BHE1 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gemin8Q8BHE1 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gemin8Q8BHE1 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Gemin8Q8BHE1 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gemin8Q8BHE1 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Gemin8Q8BHE1 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gemin8Q8BHE1 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gemin8Q8BHE1 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gemin8Q8BHE1 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Gemin8Q8BHE1 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gemin8Q8BHE1 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Gemin8Q8BHE1 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gemin8Q8BHE1 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gemin8Q8BHE1 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Gemin8Q8BHE1 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gemin8Q8BHE1 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gemin8Q8BHE1 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gemin8Q8BHE1 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gemin8Q8BHE1 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gemin8Q8BHE1 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gemin8Q8BHE1 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gemin8Q8BHE1 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gemin8Q8BHE1 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Gemin8Q8BHE1 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gemin8Q8BHE1 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gemin8Q8BHE1 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Gemin8Q8BHE1 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gemin8Q8BHE1 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Gemin8Q8BHE1 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gemin8Q8BHE1 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Gemin8Q8BHE1 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gemin8Q8BHE1 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gemin8Q8BHE1 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gemin8Q8BHE1 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gemin8Q8BHE1 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Gemin8Q8BHE1 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gemin8Q8BHE1 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gemin8Q8BHE1 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Gemin8Q8BHE1 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gemin8Q8BHE1 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gemin8Q8BHE1 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Gemin8Q8BHE1 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gemin8Q8BHE1 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gemin8Q8BHE1 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gemin8Q8BHE1 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Gemin8Q8BHE1 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Gemin8Q8BHE1 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gemin8Q8BHE1 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Gemin8Q8BHE1 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Gemin8Q8BHE1 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gemin8Q8BHE1 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gemin8Q8BHE1 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gemin8Q8BHE1 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gemin8Q8BHE1 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gemin8Q8BHE1 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gemin8Q8BHE1 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gemin8Q8BHE1 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Gemin8Q8BHE1 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gemin8Q8BHE1 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gemin8Q8BHE1 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gemin8Q8BHE1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gemin8Q8BHE1 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gemin8Q8BHE1 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gemin8Q8BHE1 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gemin8Q8BHE1 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Gemin8Q8BHE1 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gemin8Q8BHE1 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gemin8Q8BHE1 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gemin8Q8BHE1 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gemin8Q8BHE1 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gemin8Q8BHE1 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gemin8Q8BHE1 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gemin8Q8BHE1 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gemin8Q8BHE1 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gemin8Q8BHE1 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Gemin8Q8BHE1 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gemin8Q8BHE1 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gemin8Q8BHE1 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gemin8Q8BHE1 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gemin8Q8BHE1 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms