Protein–RNA interactions for Protein: P47873

Il11, Interleukin-11, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Il11P47873 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
Il11P47873 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Il11P47873 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Il11P47873 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Il11P47873 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Il11P47873 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Il11P47873 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Il11P47873 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Il11P47873 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Il11P47873 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Il11P47873 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Il11P47873 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Il11P47873 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Il11P47873 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Il11P47873 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Il11P47873 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Il11P47873 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Il11P47873 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Il11P47873 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Il11P47873 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Il11P47873 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Il11P47873 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Il11P47873 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Il11P47873 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Il11P47873 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Il11P47873 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Il11P47873 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Il11P47873 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Il11P47873 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Il11P47873 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Il11P47873 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Il11P47873 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Il11P47873 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Il11P47873 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Il11P47873 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Il11P47873 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Il11P47873 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Il11P47873 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Il11P47873 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Il11P47873 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Il11P47873 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Il11P47873 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Il11P47873 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Il11P47873 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Il11P47873 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Il11P47873 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Il11P47873 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Il11P47873 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Il11P47873 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Il11P47873 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Il11P47873 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Il11P47873 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Il11P47873 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Il11P47873 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Il11P47873 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Il11P47873 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Il11P47873 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Il11P47873 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Il11P47873 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Il11P47873 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Il11P47873 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Il11P47873 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Il11P47873 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Il11P47873 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Il11P47873 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Il11P47873 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Il11P47873 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Il11P47873 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Il11P47873 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Il11P47873 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Il11P47873 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Il11P47873 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Il11P47873 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Il11P47873 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Il11P47873 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Il11P47873 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Il11P47873 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Il11P47873 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Il11P47873 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Il11P47873 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Il11P47873 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Il11P47873 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Il11P47873 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Il11P47873 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Il11P47873 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Il11P47873 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Il11P47873 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Il11P47873 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Il11P47873 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Il11P47873 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Il11P47873 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Il11P47873 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Il11P47873 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Il11P47873 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Il11P47873 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Il11P47873 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Il11P47873 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Il11P47873 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Il11P47873 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Il11P47873 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms