Protein–RNA interactions for Protein: A0A140LI04

Gm5890, Predicted gene 5890, mousemouse

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Length 305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5890A0A140LI04 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Gm5890A0A140LI04 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Gm5890A0A140LI04 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Gm5890A0A140LI04 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Gm5890A0A140LI04 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Gm5890A0A140LI04 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Gm5890A0A140LI04 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Gm5890A0A140LI04 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gm5890A0A140LI04 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gm5890A0A140LI04 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gm5890A0A140LI04 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gm5890A0A140LI04 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gm5890A0A140LI04 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gm5890A0A140LI04 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gm5890A0A140LI04 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gm5890A0A140LI04 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gm5890A0A140LI04 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gm5890A0A140LI04 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gm5890A0A140LI04 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gm5890A0A140LI04 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Gm5890A0A140LI04 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Gm5890A0A140LI04 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gm5890A0A140LI04 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm5890A0A140LI04 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gm5890A0A140LI04 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gm5890A0A140LI04 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gm5890A0A140LI04 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gm5890A0A140LI04 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Gm5890A0A140LI04 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gm5890A0A140LI04 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gm5890A0A140LI04 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
Gm5890A0A140LI04 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gm5890A0A140LI04 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
Gm5890A0A140LI04 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gm5890A0A140LI04 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gm5890A0A140LI04 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Gm5890A0A140LI04 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Gm5890A0A140LI04 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gm5890A0A140LI04 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gm5890A0A140LI04 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm5890A0A140LI04 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm5890A0A140LI04 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm5890A0A140LI04 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm5890A0A140LI04 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm5890A0A140LI04 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm5890A0A140LI04 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm5890A0A140LI04 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm5890A0A140LI04 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm5890A0A140LI04 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm5890A0A140LI04 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm5890A0A140LI04 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm5890A0A140LI04 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm5890A0A140LI04 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm5890A0A140LI04 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm5890A0A140LI04 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm5890A0A140LI04 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm5890A0A140LI04 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm5890A0A140LI04 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Gm5890A0A140LI04 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm5890A0A140LI04 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm5890A0A140LI04 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm5890A0A140LI04 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gm5890A0A140LI04 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm5890A0A140LI04 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm5890A0A140LI04 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm5890A0A140LI04 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm5890A0A140LI04 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm5890A0A140LI04 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm5890A0A140LI04 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm5890A0A140LI04 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm5890A0A140LI04 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm5890A0A140LI04 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm5890A0A140LI04 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm5890A0A140LI04 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm5890A0A140LI04 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm5890A0A140LI04 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm5890A0A140LI04 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm5890A0A140LI04 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm5890A0A140LI04 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm5890A0A140LI04 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm5890A0A140LI04 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm5890A0A140LI04 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm5890A0A140LI04 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm5890A0A140LI04 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm5890A0A140LI04 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm5890A0A140LI04 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm5890A0A140LI04 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm5890A0A140LI04 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm5890A0A140LI04 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm5890A0A140LI04 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm5890A0A140LI04 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm5890A0A140LI04 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gm5890A0A140LI04 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm5890A0A140LI04 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm5890A0A140LI04 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm5890A0A140LI04 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm5890A0A140LI04 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm5890A0A140LI04 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm5890A0A140LI04 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm5890A0A140LI04 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
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