Protein–RNA interactions for Protein: P18531

Ighv3-6, Ig heavy chain V region 3-6, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ighv3-6P18531 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
Ighv3-6P18531 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Ighv3-6P18531 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Ighv3-6P18531 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Ighv3-6P18531 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Ighv3-6P18531 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ighv3-6P18531 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Ighv3-6P18531 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ighv3-6P18531 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ighv3-6P18531 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ighv3-6P18531 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Ighv3-6P18531 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ighv3-6P18531 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ighv3-6P18531 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ighv3-6P18531 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Ighv3-6P18531 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ighv3-6P18531 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ighv3-6P18531 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ighv3-6P18531 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ighv3-6P18531 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ighv3-6P18531 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ighv3-6P18531 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ighv3-6P18531 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ighv3-6P18531 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Ighv3-6P18531 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ighv3-6P18531 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ighv3-6P18531 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ighv3-6P18531 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Ighv3-6P18531 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Ighv3-6P18531 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ighv3-6P18531 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ighv3-6P18531 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ighv3-6P18531 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ighv3-6P18531 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ighv3-6P18531 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ighv3-6P18531 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ighv3-6P18531 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Ighv3-6P18531 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ighv3-6P18531 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ighv3-6P18531 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ighv3-6P18531 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ighv3-6P18531 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ighv3-6P18531 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ighv3-6P18531 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ighv3-6P18531 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ighv3-6P18531 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Ighv3-6P18531 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ighv3-6P18531 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ighv3-6P18531 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Ighv3-6P18531 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ighv3-6P18531 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ighv3-6P18531 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ighv3-6P18531 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ighv3-6P18531 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Ighv3-6P18531 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Ighv3-6P18531 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ighv3-6P18531 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ighv3-6P18531 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ighv3-6P18531 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ighv3-6P18531 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ighv3-6P18531 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ighv3-6P18531 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ighv3-6P18531 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ighv3-6P18531 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ighv3-6P18531 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Ighv3-6P18531 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ighv3-6P18531 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ighv3-6P18531 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ighv3-6P18531 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ighv3-6P18531 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ighv3-6P18531 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ighv3-6P18531 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Ighv3-6P18531 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ighv3-6P18531 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ighv3-6P18531 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ighv3-6P18531 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ighv3-6P18531 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ighv3-6P18531 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ighv3-6P18531 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ighv3-6P18531 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ighv3-6P18531 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ighv3-6P18531 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ighv3-6P18531 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ighv3-6P18531 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ighv3-6P18531 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ighv3-6P18531 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ighv3-6P18531 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ighv3-6P18531 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Ighv3-6P18531 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ighv3-6P18531 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ighv3-6P18531 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ighv3-6P18531 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ighv3-6P18531 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ighv3-6P18531 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ighv3-6P18531 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ighv3-6P18531 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ighv3-6P18531 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ighv3-6P18531 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ighv3-6P18531 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ighv3-6P18531 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms