Protein–RNA interactions for Protein: Q07968

F13b, Coagulation factor XIII B chain, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F13bQ07968 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
F13bQ07968 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
F13bQ07968 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
F13bQ07968 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
F13bQ07968 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
F13bQ07968 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
F13bQ07968 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
F13bQ07968 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
F13bQ07968 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
F13bQ07968 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
F13bQ07968 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
F13bQ07968 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
F13bQ07968 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
F13bQ07968 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
F13bQ07968 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
F13bQ07968 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
F13bQ07968 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
F13bQ07968 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
F13bQ07968 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
F13bQ07968 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
F13bQ07968 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
F13bQ07968 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
F13bQ07968 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
F13bQ07968 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
F13bQ07968 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
F13bQ07968 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
F13bQ07968 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
F13bQ07968 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
F13bQ07968 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
F13bQ07968 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
F13bQ07968 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
F13bQ07968 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
F13bQ07968 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
F13bQ07968 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
F13bQ07968 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
F13bQ07968 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
F13bQ07968 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
F13bQ07968 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
F13bQ07968 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
F13bQ07968 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
F13bQ07968 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
F13bQ07968 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
F13bQ07968 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
F13bQ07968 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
F13bQ07968 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
F13bQ07968 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
F13bQ07968 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
F13bQ07968 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
F13bQ07968 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
F13bQ07968 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
F13bQ07968 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
F13bQ07968 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
F13bQ07968 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
F13bQ07968 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
F13bQ07968 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
F13bQ07968 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
F13bQ07968 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
F13bQ07968 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
F13bQ07968 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
F13bQ07968 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
F13bQ07968 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
F13bQ07968 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
F13bQ07968 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
F13bQ07968 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
F13bQ07968 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
F13bQ07968 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
F13bQ07968 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
F13bQ07968 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
F13bQ07968 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
F13bQ07968 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
F13bQ07968 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
F13bQ07968 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
F13bQ07968 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
F13bQ07968 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
F13bQ07968 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
F13bQ07968 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
F13bQ07968 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
F13bQ07968 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
F13bQ07968 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
F13bQ07968 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
F13bQ07968 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
F13bQ07968 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
F13bQ07968 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
F13bQ07968 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
F13bQ07968 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
F13bQ07968 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
F13bQ07968 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
F13bQ07968 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
F13bQ07968 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
F13bQ07968 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
F13bQ07968 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
F13bQ07968 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
F13bQ07968 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
F13bQ07968 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
F13bQ07968 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
F13bQ07968 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
F13bQ07968 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
F13bQ07968 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
F13bQ07968 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
F13bQ07968 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 113.9 ms