Protein–RNA interactions for Protein: P35385

Hspb7, Heat shock protein beta-7, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hspb7P35385 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
Hspb7P35385 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Hspb7P35385 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Hspb7P35385 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Hspb7P35385 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Hspb7P35385 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Hspb7P35385 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Hspb7P35385 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Hspb7P35385 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Hspb7P35385 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Hspb7P35385 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Hspb7P35385 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Hspb7P35385 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Hspb7P35385 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Hspb7P35385 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Hspb7P35385 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Hspb7P35385 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Hspb7P35385 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Hspb7P35385 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Hspb7P35385 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Hspb7P35385 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Hspb7P35385 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Hspb7P35385 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Hspb7P35385 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Hspb7P35385 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Hspb7P35385 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Hspb7P35385 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Hspb7P35385 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Hspb7P35385 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hspb7P35385 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Hspb7P35385 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hspb7P35385 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hspb7P35385 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Hspb7P35385 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hspb7P35385 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Hspb7P35385 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Hspb7P35385 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hspb7P35385 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hspb7P35385 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Hspb7P35385 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hspb7P35385 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hspb7P35385 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hspb7P35385 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Hspb7P35385 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Hspb7P35385 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Hspb7P35385 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Hspb7P35385 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Hspb7P35385 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hspb7P35385 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Hspb7P35385 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Hspb7P35385 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hspb7P35385 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hspb7P35385 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
Hspb7P35385 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hspb7P35385 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hspb7P35385 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hspb7P35385 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hspb7P35385 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Hspb7P35385 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hspb7P35385 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hspb7P35385 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hspb7P35385 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hspb7P35385 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hspb7P35385 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hspb7P35385 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Hspb7P35385 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hspb7P35385 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hspb7P35385 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hspb7P35385 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hspb7P35385 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Hspb7P35385 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Hspb7P35385 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hspb7P35385 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hspb7P35385 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hspb7P35385 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hspb7P35385 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Hspb7P35385 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hspb7P35385 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hspb7P35385 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hspb7P35385 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Hspb7P35385 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hspb7P35385 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hspb7P35385 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hspb7P35385 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hspb7P35385 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hspb7P35385 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hspb7P35385 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hspb7P35385 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Hspb7P35385 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hspb7P35385 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hspb7P35385 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hspb7P35385 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hspb7P35385 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hspb7P35385 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hspb7P35385 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hspb7P35385 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hspb7P35385 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hspb7P35385 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hspb7P35385 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hspb7P35385 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.9 ms