Protein–RNA interactions for Protein: P97497

Shbg, Sex hormone-binding globulin, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ShbgP97497 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC30.68■■■□□ 2.5
ShbgP97497 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ShbgP97497 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ShbgP97497 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ShbgP97497 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
ShbgP97497 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ShbgP97497 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ShbgP97497 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ShbgP97497 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
ShbgP97497 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
ShbgP97497 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ShbgP97497 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ShbgP97497 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ShbgP97497 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ShbgP97497 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ShbgP97497 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
ShbgP97497 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
ShbgP97497 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ShbgP97497 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
ShbgP97497 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ShbgP97497 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ShbgP97497 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ShbgP97497 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ShbgP97497 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ShbgP97497 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ShbgP97497 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ShbgP97497 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ShbgP97497 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ShbgP97497 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
ShbgP97497 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ShbgP97497 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
ShbgP97497 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ShbgP97497 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ShbgP97497 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ShbgP97497 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ShbgP97497 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ShbgP97497 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ShbgP97497 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ShbgP97497 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ShbgP97497 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ShbgP97497 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ShbgP97497 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ShbgP97497 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ShbgP97497 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ShbgP97497 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ShbgP97497 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ShbgP97497 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ShbgP97497 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ShbgP97497 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
ShbgP97497 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ShbgP97497 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ShbgP97497 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ShbgP97497 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ShbgP97497 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ShbgP97497 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ShbgP97497 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ShbgP97497 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
ShbgP97497 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ShbgP97497 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ShbgP97497 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ShbgP97497 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ShbgP97497 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ShbgP97497 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ShbgP97497 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
ShbgP97497 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ShbgP97497 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ShbgP97497 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ShbgP97497 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ShbgP97497 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
ShbgP97497 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ShbgP97497 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ShbgP97497 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ShbgP97497 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ShbgP97497 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ShbgP97497 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ShbgP97497 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ShbgP97497 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ShbgP97497 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ShbgP97497 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ShbgP97497 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ShbgP97497 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ShbgP97497 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ShbgP97497 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ShbgP97497 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ShbgP97497 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ShbgP97497 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ShbgP97497 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ShbgP97497 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ShbgP97497 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ShbgP97497 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ShbgP97497 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ShbgP97497 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ShbgP97497 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ShbgP97497 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ShbgP97497 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ShbgP97497 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ShbgP97497 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ShbgP97497 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ShbgP97497 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ShbgP97497 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 210.4 ms