Protein–RNA interactions for Protein: Q91VX5

Nxph3, Neurexophilin-3, mousemouse

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nxph3Q91VX5 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Nxph3Q91VX5 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Nxph3Q91VX5 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Nxph3Q91VX5 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Nxph3Q91VX5 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Nxph3Q91VX5 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Nxph3Q91VX5 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Nxph3Q91VX5 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Nxph3Q91VX5 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Nxph3Q91VX5 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nxph3Q91VX5 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nxph3Q91VX5 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nxph3Q91VX5 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nxph3Q91VX5 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nxph3Q91VX5 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nxph3Q91VX5 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Nxph3Q91VX5 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Nxph3Q91VX5 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Nxph3Q91VX5 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nxph3Q91VX5 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nxph3Q91VX5 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nxph3Q91VX5 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Nxph3Q91VX5 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nxph3Q91VX5 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nxph3Q91VX5 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nxph3Q91VX5 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nxph3Q91VX5 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nxph3Q91VX5 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nxph3Q91VX5 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nxph3Q91VX5 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nxph3Q91VX5 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nxph3Q91VX5 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nxph3Q91VX5 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Nxph3Q91VX5 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nxph3Q91VX5 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nxph3Q91VX5 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nxph3Q91VX5 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nxph3Q91VX5 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Nxph3Q91VX5 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nxph3Q91VX5 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Nxph3Q91VX5 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Nxph3Q91VX5 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nxph3Q91VX5 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Nxph3Q91VX5 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nxph3Q91VX5 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nxph3Q91VX5 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nxph3Q91VX5 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nxph3Q91VX5 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Nxph3Q91VX5 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nxph3Q91VX5 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Nxph3Q91VX5 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nxph3Q91VX5 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nxph3Q91VX5 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nxph3Q91VX5 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Nxph3Q91VX5 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nxph3Q91VX5 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nxph3Q91VX5 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nxph3Q91VX5 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nxph3Q91VX5 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nxph3Q91VX5 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nxph3Q91VX5 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nxph3Q91VX5 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nxph3Q91VX5 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nxph3Q91VX5 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nxph3Q91VX5 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Nxph3Q91VX5 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nxph3Q91VX5 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nxph3Q91VX5 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nxph3Q91VX5 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Nxph3Q91VX5 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nxph3Q91VX5 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nxph3Q91VX5 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nxph3Q91VX5 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nxph3Q91VX5 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nxph3Q91VX5 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Nxph3Q91VX5 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nxph3Q91VX5 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nxph3Q91VX5 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nxph3Q91VX5 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nxph3Q91VX5 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nxph3Q91VX5 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nxph3Q91VX5 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nxph3Q91VX5 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nxph3Q91VX5 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nxph3Q91VX5 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nxph3Q91VX5 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nxph3Q91VX5 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nxph3Q91VX5 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nxph3Q91VX5 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nxph3Q91VX5 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nxph3Q91VX5 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nxph3Q91VX5 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nxph3Q91VX5 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nxph3Q91VX5 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nxph3Q91VX5 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nxph3Q91VX5 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nxph3Q91VX5 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nxph3Q91VX5 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nxph3Q91VX5 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nxph3Q91VX5 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.6 ms