RNA–Protein interactions for RNA: tT(AGU)C

tT(AGU)C, Transcript of Threonine tRNA (tRNA-Thr), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene tT(AGU)C, Length 73 nt, Biotype tRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tT(AGU)CtT(AGU)C KGD2P19262 463 aaPredicted RBP0.73□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C ACO1P19414 778 aaKnown RBP RIP-Chip data0.73□□□□□ -2.29not detected
tT(AGU)CtT(AGU)C RDS2P19541 446 aaKnown RBP0.73□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C GAL11P19659 1081 aa0.73□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C PRP2P20095 876 aaPredicted RBP0.73□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C CKI1P20485 582 aa0.73□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C SIR1P21691 654 aa0.73□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C MRPL8P22353 238 aa0.73□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C YSR3P23501 404 aa0.73□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C PHO84P25297 587 aaKnown RBP0.73□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C PUP3P25451 205 aaKnown RBP0.73□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C SGF29P25554 259 aa0.73□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C GEX1P25596 615 aa0.73□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C YIH1P25637 258 aa0.73□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C SPT5P27692 1063 aaKnown RBP0.73□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C YJU3P28321 313 aa0.73□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C CCR4P31384 837 aaKnown RBP0.73□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C DAL1P32375 460 aa0.73□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C SPC110P32380 944 aa0.73□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C EFB1P32471 206 aaKnown RBP0.73□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C SMI1P32566 505 aa0.73□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C SAC6P32599 642 aaKnown RBP0.73□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C SEC6P32844 805 aa0.73□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C AIM26P32858 118 aa0.73□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C PMT1P33775 817 aa0.73□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C STO1P34160 861 aaKnown RBP0.73□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C SRB2P34162 210 aa0.73□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C YBL055CP34220 418 aaPredicted RBP0.73□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C PTC3P34221 468 aaKnown RBP0.73□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C RPC25P35718 212 aa0.73□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C PHO11P35842 467 aa0.73□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C DCW1P36091 449 aa0.73□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C SET3P36124 751 aa0.73□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C UTH1P36135 365 aa0.73□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C GEX2P36173 615 aa0.73□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C MRPL37P36532 105 aa0.73□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C MRPL40P36534 297 aa0.73□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C TBS1P38114 1094 aa0.73□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C PCH2P38126 564 aa0.73□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C NCL1P38205 684 aaKnown RBP0.73□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C ECM2P38241 364 aaKnown RBP0.73□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C HSL7P38274 827 aa0.73□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C PCA1P38360 1216 aa0.73□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C PCM1P38628 557 aaKnown RBP0.73□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C HIS2P38635 335 aa0.73□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C PHO12P38693 467 aa0.73□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C GND1P38720 489 aaKnown RBP0.73□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C YHL049CP38722 271 aa0.73□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C HSE1P38753 452 aa0.73□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C TCD1P38756 429 aa0.73□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C TDA3P38758 523 aa0.73□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C PPE1P38796 400 aa0.73□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C RTT107P38850 1070 aa0.73□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C FMO1P38866 432 aa0.73□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C SMC2P38989 1170 aaKnown RBP0.73□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C END3P39013 349 aa0.73□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C CCT6P39079 546 aa0.73□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C PIK1P39104 1066 aa0.73□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C MNN1P39106 762 aa0.73□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C TIM17P39515 158 aa0.73□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C SEO1P39709 593 aa0.73□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C RPH1P39956 796 aa0.73□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C YAT2P40017 923 aa0.73□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C SLX8P40072 274 aa0.73□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C LCP5P40079 357 aaPredicted RBP0.73□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C YER189WP40104 122 aa0.73□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C PSY2P40164 858 aa0.73□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C ATG3P40344 310 aa0.73□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C YIL054WP40524 105 aa0.73□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C IST3P40565 148 aaPredicted RBP0.73□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C MVP1P40959 511 aaKnown RBP0.73□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C SBE2P42223 864 aaKnown RBP0.73□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C YJL107CP42947 387 aa0.73□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C YFL064CP43540 174 aa0.73□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C RRT5P43607 289 aa0.73□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C SAE2P46946 345 aa0.73□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C PFD1P46988 109 aa0.73□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C GLG2P47011 380 aa0.73□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C AIM23P47015 356 aa0.73□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C CCT8P47079 568 aaKnown RBP0.73□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C TCB2P48231 1178 aa0.73□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C HLJ1P48353 224 aa0.73□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C VEL1P53058 206 aa0.73□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C KAP114P53067 1004 aa0.73□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C COG1P53079 417 aa0.73□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C PCL10P53124 433 aa0.73□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C RIM8P53179 542 aa0.73□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C RTS3P53289 263 aa0.73□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C COQ6P53318 479 aa0.73□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C YGR283CP53336 341 aaPredicted RBP0.73□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C LSC1P53598 329 aaKnown RBP0.73□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C YNR061CP53747 219 aa0.73□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C PRM1P53835 661 aa0.73□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C YNL247WP53852 767 aaKnown RBP0.73□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C YNL058CP53947 316 aa0.73□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C KTR6P54070 446 aa0.73□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C ORC3P54790 616 aa0.73□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C GPD1Q00055 391 aaKnown RBP0.73□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C TOF2Q02208 771 aa0.73□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C SPP2Q02521 185 aa0.73□□□□□ -2.29
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 30.2 ms