RNA–Protein interactions for RNA: YER104W

RTT105, Transcript of Protein with a role in regulation of Ty1 transposition, yeastyeast

Gene RTT105, Length 627 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RTT105YER104W BCD1P38772 366 aa3.46□□□□□ -1.86
RTT105YER104W PSF2P40359 213 aa3.46□□□□□ -1.86
RTT105YER104W RIC1P40395 1056 aa3.46□□□□□ -1.86
RTT105YER104W PFA3P42836 336 aa3.46□□□□□ -1.86
RTT105YER104W VTC2P43585 828 aa3.46□□□□□ -1.86
RTT105YER104W BNA1P47096 177 aa3.46□□□□□ -1.86
RTT105YER104W UPF3P48412 387 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
RTT105YER104W CTF18P49956 741 aa3.46□□□□□ -1.86
RTT105YER104W TAF4P50105 388 aa3.46□□□□□ -1.86
RTT105YER104W YNR071CP53757 342 aa3.46□□□□□ -1.86
RTT105YER104W ASI2P53895 289 aa3.46□□□□□ -1.86
RTT105YER104W SLU7Q02775 382 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
RTT105YER104W MUS81Q04149 632 aaPredicted RBP3.46□□□□□ -1.86
RTT105YER104W ASM4Q05166 528 aa3.46□□□□□ -1.86
RTT105YER104W TFC6Q06339 672 aa3.46□□□□□ -1.86
RTT105YER104W CSR1Q06705 408 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
RTT105YER104W IWR1Q07532 353 aaPredicted RBP3.46□□□□□ -1.86
RTT105YER104W ISA1Q07821 250 aaPredicted RBP3.46□□□□□ -1.86
RTT105YER104W DIN7Q12086 430 aa3.46□□□□□ -1.86
RTT105YER104W TRM11Q12463 433 aa3.46□□□□□ -1.86
RTT105YER104W BNR1P40450 1375 aa3.46□□□□□ -1.86
RTT105YER104W SEM1O94742 89 aa3.45□□□□□ -1.86
RTT105YER104W PPR1P07272 904 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
RTT105YER104W ALG7P07286 448 aa3.45□□□□□ -1.86
RTT105YER104W MET3P08536 511 aa3.45□□□□□ -1.86
RTT105YER104W POL3P15436 1097 aa3.45□□□□□ -1.86
RTT105YER104W FRS1P15624 595 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
RTT105YER104W AAC3P18238 307 aa3.45□□□□□ -1.86
RTT105YER104W CWH43P25618 953 aa3.45□□□□□ -1.86
RTT105YER104W TFC3P34111 1160 aa3.45□□□□□ -1.86
RTT105YER104W CTF13P35203 478 aa3.45□□□□□ -1.86
RTT105YER104W MUD2P36084 527 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
RTT105YER104W AXL2P38928 823 aa3.45□□□□□ -1.86
RTT105YER104W UME6P39001 836 aa3.45□□□□□ -1.86
RTT105YER104W CCT3P39077 534 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
RTT105YER104W ECM1P39715 212 aa3.45□□□□□ -1.86
RTT105YER104W SGM1P47166 707 aa3.45□□□□□ -1.86
RTT105YER104W SCS3P53012 380 aa3.45□□□□□ -1.86
RTT105YER104W PEF1P53238 335 aa3.45□□□□□ -1.86
RTT105YER104W ARG5,6Q01217 863 aa3.45□□□□□ -1.86
RTT105YER104W REC102Q02721 264 aa3.45□□□□□ -1.86
RTT105YER104W VIP1Q06685 1146 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
RTT105YER104W SGO1Q08490 590 aa3.45□□□□□ -1.86
RTT105YER104W SUT2Q12286 268 aa3.45□□□□□ -1.86
RTT105YER104W TUB3P09734 445 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
RTT105YER104W GUK1P15454 187 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
RTT105YER104W PRP4P20053 465 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
RTT105YER104W PRP22P24384 1145 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
RTT105YER104W RAD16P31244 790 aa3.44□□□□□ -1.86
RTT105YER104W CBF2P32504 956 aa3.44□□□□□ -1.86
RTT105YER104W PPZ2P33329 710 aa3.44□□□□□ -1.86
RTT105YER104W NUP120P35729 1037 aa3.44□□□□□ -1.86
RTT105YER104W YBR259WP38338 688 aa3.44□□□□□ -1.86
RTT105YER104W SIC1P38634 284 aa3.44□□□□□ -1.86
RTT105YER104W YHR033WP38690 423 aa3.44□□□□□ -1.86
RTT105YER104W YER010CP40011 234 aa3.44□□□□□ -1.86
RTT105YER104W DPH1P40487 425 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
RTT105YER104W SDS3P40505 327 aa3.44□□□□□ -1.86
RTT105YER104W PRM2P40534 656 aa3.44□□□□□ -1.86
RTT105YER104W BUD8P41698 603 aa3.44□□□□□ -1.86
RTT105YER104W PXA1P41909 870 aa3.44□□□□□ -1.86
RTT105YER104W PRP31P49704 494 aaPredicted RBP3.44□□□□□ -1.86
RTT105YER104W IMA1P53051 589 aa3.44□□□□□ -1.86
RTT105YER104W SQS1P53866 767 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
RTT105YER104W CBK1P53894 756 aa3.44□□□□□ -1.86
RTT105YER104W ERG5P54781 538 aa3.44□□□□□ -1.86
RTT105YER104W TIM50Q02776 476 aa3.44□□□□□ -1.86
RTT105YER104W PKH1Q03407 766 aa3.44□□□□□ -1.86
RTT105YER104W HMO1Q03973 246 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
RTT105YER104W DLT1Q04216 342 aa3.44□□□□□ -1.86
RTT105YER104W VBA4Q04602 768 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
RTT105YER104W MCM21Q06675 368 aa3.44□□□□□ -1.86
RTT105YER104W CRD1Q07560 283 aa3.44□□□□□ -1.86
RTT105YER104W AAD4Q07747 329 aa3.44□□□□□ -1.86
RTT105YER104W HOS1Q12214 470 aa3.44□□□□□ -1.86
RTT105YER104W SCM3Q12334 223 aa3.44□□□□□ -1.86
RTT105YER104W TRM13Q12383 476 aa3.44□□□□□ -1.86
RTT105YER104W SNU66Q12420 587 aaPredicted RBP3.44□□□□□ -1.86
RTT105YER104W YLR415CO13578 112 aa3.43□□□□□ -1.86
RTT105YER104W FUM1P08417 488 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
RTT105YER104W ERG20P08524 352 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
RTT105YER104W BET2P20133 325 aa3.43□□□□□ -1.86
RTT105YER104W CMK1P27466 446 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
RTT105YER104W FRD1P32614 470 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
RTT105YER104W MTC7P32633 139 aa3.43□□□□□ -1.86
RTT105YER104W YPT7P32939 208 aa3.43□□□□□ -1.86
RTT105YER104W TEF4P36008 412 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
RTT105YER104W RKM3P38222 552 aa3.43□□□□□ -1.86
RTT105YER104W YBR138CP38277 524 aa3.43□□□□□ -1.86
RTT105YER104W IFA38P38286 347 aa3.43□□□□□ -1.86
RTT105YER104W FSH1P38777 243 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
RTT105YER104W RBG2P53295 368 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
RTT105YER104W SPO1P53541 631 aa3.43□□□□□ -1.86
RTT105YER104W RCR2Q03446 210 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
RTT105YER104W ARA2Q04212 335 aa3.43□□□□□ -1.86
RTT105YER104W MRH1Q12117 320 aaPredicted RBP3.43□□□□□ -1.86
RTT105YER104W ATG11Q12527 1178 aa3.43□□□□□ -1.86
RTT105YER104W TUF1P02992 437 aaKnown RBP3.42□□□□□ -1.86
RTT105YER104W URA3P03962 267 aa3.42□□□□□ -1.86
RTT105YER104W CDC16P09798 840 aa3.42□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 14.2 ms