RNA–Protein interactions for RNA: YCL057W

PRD1, Transcript of Zinc metalloendopeptidase, yeastyeast

Gene PRD1, Length 2,139 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PRD1YCL057W ESC8Q08119 714 aa5.36□□□□□ -1.55
PRD1YCL057W POM34Q12445 299 aa5.36□□□□□ -1.55
PRD1YCL057W GAL1P04385 528 aa5.36□□□□□ -1.55
PRD1YCL057W CCT3P39077 534 aaKnown RBP5.36□□□□□ -1.55
PRD1YCL057W BUD27P43573 796 aaKnown RBP RIP-Chip data5.36□□□□□ -1.55not detected
PRD1YCL057W UBC11P52492 156 aa5.36□□□□□ -1.55
PRD1YCL057W PIP2P52960 996 aa5.36□□□□□ -1.55
PRD1YCL057W HEF3P53978 1044 aaKnown RBP5.36□□□□□ -1.55
PRD1YCL057W LSP1Q12230 341 aaKnown RBP5.36□□□□□ -1.55
PRD1YCL057W KCC4P25389 1037 aa5.35□□□□□ -1.55
PRD1YCL057W HRR25P29295 494 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
PRD1YCL057W DGR2P32330 852 aa5.35□□□□□ -1.55
PRD1YCL057W BCD1P38772 366 aa5.35□□□□□ -1.55
PRD1YCL057W TAF1P46677 1066 aa5.35□□□□□ -1.55
PRD1YCL057W YJL163CP46996 555 aa5.35□□□□□ -1.55
PRD1YCL057W ADY4Q05955 493 aa5.35□□□□□ -1.55
PRD1YCL057W RTT109Q07794 436 aa5.35□□□□□ -1.55
PRD1YCL057W AIM39Q08223 395 aa5.35□□□□□ -1.55
PRD1YCL057W DIA2Q08496 732 aaPredicted RBP5.35□□□□□ -1.55
PRD1YCL057W FRE5Q08908 694 aa5.35□□□□□ -1.55
PRD1YCL057W CWC2Q12046 339 aaPredicted RBP5.35□□□□□ -1.55
PRD1YCL057W BCK1Q01389 1478 aa5.35□□□□□ -1.55
PRD1YCL057W PRE4P30657 266 aa5.35□□□□□ -1.55
PRD1YCL057W MTC7P32633 139 aa5.35□□□□□ -1.55
PRD1YCL057W EAF5P39995 279 aa5.35□□□□□ -1.55
PRD1YCL057W IRC24P40580 263 aa5.35□□□□□ -1.55
PRD1YCL057W PUS4P48567 403 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
PRD1YCL057W HOL1P53389 586 aa5.35□□□□□ -1.55
PRD1YCL057W PAP2P53632 584 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
PRD1YCL057W MTD1Q02046 320 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
PRD1YCL057W PPN1Q04119 674 aa5.35□□□□□ -1.55
PRD1YCL057W OMS1Q06668 471 aa5.35□□□□□ -1.55
PRD1YCL057W YLR040CQ07988 224 aa5.35□□□□□ -1.55
PRD1YCL057W PIF1P07271 859 aa5.34□□□□□ -1.55
PRD1YCL057W HOP1P20050 605 aa5.34□□□□□ -1.55
PRD1YCL057W PRP22P24384 1145 aaKnown RBP5.34□□□□□ -1.55
PRD1YCL057W KIN82P25341 720 aa5.34□□□□□ -1.55
PRD1YCL057W PMI40P29952 429 aaKnown RBP5.34□□□□□ -1.55
PRD1YCL057W IRC13Q08630 104 aa5.34□□□□□ -1.55
PRD1YCL057W DNF3Q12674 1656 aa5.34□□□□□ -1.55
PRD1YCL057W SIR3P06701 978 aa5.33□□□□□ -1.56
PRD1YCL057W YEL076C-AP0CX16 216 aa5.33□□□□□ -1.56
PRD1YCL057W YLR464WP0CX17 216 aa5.33□□□□□ -1.56
PRD1YCL057W YEL076CP39971 216 aa5.33□□□□□ -1.56
PRD1YCL057W RNT1Q02555 471 aa5.33□□□□□ -1.56
PRD1YCL057W MLC2Q06580 163 aa5.33□□□□□ -1.56
PRD1YCL057W NYV1Q12255 253 aa5.33□□□□□ -1.56
PRD1YCL057W ALG7P07286 448 aa5.33□□□□□ -1.56
PRD1YCL057W PTP2P29461 750 aa5.33□□□□□ -1.56
PRD1YCL057W CDS1P38221 457 aa5.33□□□□□ -1.56
PRD1YCL057W STL1P39932 569 aa5.33□□□□□ -1.56
PRD1YCL057W HIM1Q06674 414 aa5.33□□□□□ -1.56
PRD1YCL057W RRP6Q12149 733 aaKnown RBP5.33□□□□□ -1.56
PRD1YCL057W NOP58Q12499 511 aaKnown RBP5.33□□□□□ -1.56
PRD1YCL057W BCS1P32839 456 aa5.32□□□□□ -1.56
PRD1YCL057W YKL133CP36066 463 aa5.32□□□□□ -1.56
PRD1YCL057W CEG1Q01159 459 aaPredicted RBP5.32□□□□□ -1.56
PRD1YCL057W PPR1P07272 904 aaPredicted RBP5.32□□□□□ -1.56
PRD1YCL057W HRB1P38922 454 aaKnown RBP RIP-Chip data5.32□□□□□ -1.56not detected
PRD1YCL057W FMP52P40008 231 aa5.32□□□□□ -1.56
PRD1YCL057W PRM2P40534 656 aa5.32□□□□□ -1.56
PRD1YCL057W RSC1P53236 928 aa5.32□□□□□ -1.56
PRD1YCL057W PEF1P53238 335 aa5.32□□□□□ -1.56
PRD1YCL057W SPO1P53541 631 aa5.32□□□□□ -1.56
PRD1YCL057W FEN2P25621 512 aaKnown RBP5.31□□□□□ -1.56
PRD1YCL057W MVD1P32377 396 aaKnown RBP5.3□□□□□ -1.56
PRD1YCL057W TRM2P33753 639 aa5.3□□□□□ -1.56
PRD1YCL057W YHR033WP38690 423 aa5.3□□□□□ -1.56
PRD1YCL057W MAD2P40958 196 aa5.3□□□□□ -1.56
PRD1YCL057W PAN2P53010 1115 aaPredicted RBP5.3□□□□□ -1.56
PRD1YCL057W MNT2P53059 558 aa5.3□□□□□ -1.56
PRD1YCL057W MDG1P53885 366 aa5.3□□□□□ -1.56
PRD1YCL057W KIN4Q01919 800 aa5.3□□□□□ -1.56
PRD1YCL057W YFT2Q06676 274 aa5.3□□□□□ -1.56
PRD1YCL057W YOL073CQ08232 322 aa5.3□□□□□ -1.56
PRD1YCL057W RTK1Q12100 620 aaPredicted RBP5.3□□□□□ -1.56
PRD1YCL057W YKL033W-AQ86ZR7 236 aa5.3□□□□□ -1.56
PRD1YCL057W VPS5Q92331 675 aa5.3□□□□□ -1.56
PRD1YCL057W QCR6P00127 147 aa5.3□□□□□ -1.56
PRD1YCL057W RPS9BP05755 195 aaKnown RBP5.3□□□□□ -1.56
PRD1YCL057W PRP28P23394 588 aa5.3□□□□□ -1.56
PRD1YCL057W COS111P38308 924 aa5.3□□□□□ -1.56
PRD1YCL057W CRG1P38892 291 aaRIP-Chip data5.3□□□□□ -1.56not detected
PRD1YCL057W GIP4P39732 760 aa5.3□□□□□ -1.56
PRD1YCL057W SSP120P39931 234 aaKnown RBP5.3□□□□□ -1.56
PRD1YCL057W YDL183CP48569 320 aa5.3□□□□□ -1.56
PRD1YCL057W FHN1P53279 174 aa5.3□□□□□ -1.56
PRD1YCL057W UBX4P54730 416 aa5.3□□□□□ -1.56
PRD1YCL057W DIN7Q12086 430 aa5.3□□□□□ -1.56
PRD1YCL057W SIR4P11978 1358 aa5.3□□□□□ -1.56
PRD1YCL057W MSS18P08593 268 aa5.29□□□□□ -1.56
PRD1YCL057W PHO3P24031 467 aa5.29□□□□□ -1.56
PRD1YCL057W MSS1P32559 526 aaPredicted RBP5.29□□□□□ -1.56
PRD1YCL057W SUL1P38359 859 aa5.29□□□□□ -1.56
PRD1YCL057W REV7P38927 245 aa5.29□□□□□ -1.56
PRD1YCL057W FTR1P40088 404 aa5.29□□□□□ -1.56
PRD1YCL057W YIL077CP40508 320 aa5.29□□□□□ -1.56
PRD1YCL057W HLR1Q04429 423 aa5.29□□□□□ -1.56
PRD1YCL057W PSF3Q12146 194 aa5.29□□□□□ -1.56
PRD1YCL057W YCR015CP25616 317 aa5.29□□□□□ -1.56
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