RNA–Protein interactions for RNA: YHL011C

PRS3, Transcript of 5-phospho-ribosyl-1(alpha)-pyrophosphate synthetase, yeast

Gene PRS3, Length 963 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PRS3	YHL011C	PPE1	P38796	400 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PRS3	YHL011C	YGL117W	P53133	265 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PRS3	YHL011C	MTQ2	Q03920	221 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
PRS3	YHL011C	SEG1	Q04279	960 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PRS3	YHL011C	PRE4	P30657	266 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PRS3	YHL011C	HXT6	P39003	570 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
PRS3	YHL011C	HXT7	P39004	570 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PRS3	YHL011C	DUN1	P39009	513 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PRS3	YHL011C	CCT5	P40413	562 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
PRS3	YHL011C	YGR153W	P48238	217 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PRS3	YHL011C	GLO1	P50107	326 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PRS3	YHL011C	DAK1	P54838	584 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
PRS3	YHL011C	ECM9	Q02202	377 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PRS3	YHL011C	YAP7	Q08182	245 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PRS3	YHL011C	AAD3	P25612	363 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PRS3	YHL011C	CDS1	P38221	457 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PRS3	YHL011C	CRG1	P38892	291 aa	RIP-Chip data	4.12	□□□□□ -1.75	not detected
PRS3	YHL011C	THI6	P41835	540 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PRS3	YHL011C	TAF4	P50105	388 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PRS3	YHL011C	SPO1	P53541	631 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PRS3	YHL011C	TIM50	Q02776	476 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PRS3	YHL011C	PPN1	Q04119	674 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PRS3	YHL011C	PGK1	P00560	416 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
PRS3	YHL011C	GLN4	P13188	809 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
PRS3	YHL011C	TUP1	P16649	713 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PRS3	YHL011C	APN1	P22936	367 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PRS3	YHL011C	PTP1	P25044	335 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PRS3	YHL011C	FAT1	P38225	669 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PRS3	YHL011C	NMD2	P38798	1089 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
PRS3	YHL011C	FTR1	P40088	404 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PRS3	YHL011C	XBP1	P40489	647 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PRS3	YHL011C	BNA3	P47039	444 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
PRS3	YHL011C	CPR8	P53728	308 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PRS3	YHL011C	FDC1	Q03034	503 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PRS3	YHL011C	YHM2	Q04013	314 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PRS3	YHL011C	UTP14	Q04500	899 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
PRS3	YHL011C	RPS21A	P0C0V8	87 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
PRS3	YHL011C	TMT1	P32643	299 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PRS3	YHL011C	PIH1	P38768	344 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PRS3	YHL011C	IES1	P43579	692 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PRS3	YHL011C	YGR054W	P53235	642 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
PRS3	YHL011C	EFR3	Q03653	782 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
PRS3	YHL011C	HFI1	Q12060	488 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PRS3	YHL011C	AI5_ALPHA	Q9ZZX1	630 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PRS3	YHL011C	CNE1	P27825	502 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PRS3	YHL011C	OAF3	P36023	863 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PRS3	YHL011C	MRPL7	P36519	292 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PRS3	YHL011C	RIM4	P38741	713 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PRS3	YHL011C	GZF3	P42944	551 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
PRS3	YHL011C	NET1	P47035	1189 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PRS3	YHL011C	YIP4	P53093	235 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PRS3	YHL011C	MFM1	Q02783	413 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PRS3	YHL011C	YTM1	Q12024	460 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
PRS3	YHL011C	ZPS1	Q12512	249 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PRS3	YHL011C	HOT13	P36078	116 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PRS3	YHL011C	YHR033W	P38690	423 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PRS3	YHL011C	PRM2	P40534	656 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PRS3	YHL011C	VID28	P40547	921 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PRS3	YHL011C	PIP2	P52960	996 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PRS3	YHL011C	YNR029C	P53729	429 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
PRS3	YHL011C	UME1	Q03010	460 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PRS3	YHL011C	LEU2	P04173	364 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
PRS3	YHL011C	OAF1	P39720	1047 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
PRS3	YHL011C	GAT1	P43574	510 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PRS3	YHL011C	MNN11	P46985	422 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
PRS3	YHL011C	PMT3	P47190	753 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PRS3	YHL011C	SEC5	P89102	971 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PRS3	YHL011C	CEF1	Q03654	590 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
PRS3	YHL011C	NSE5	Q03718	556 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PRS3	YHL011C	CDC26	P14724	124 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PRS3	YHL011C	PMA2	P19657	947 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PRS3	YHL011C	MTC7	P32633	139 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PRS3	YHL011C	EHT1	P38295	451 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PRS3	YHL011C	LTP1	P40347	161 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PRS3	YHL011C	GPP1	P41277	250 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
PRS3	YHL011C	YJR142W	P47173	342 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PRS3	YHL011C	GPG1	P53130	126 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PRS3	YHL011C	HLR1	Q04429	423 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PRS3	YHL011C	CPA2	P03965	1118 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
PRS3	YHL011C	MBR1	P23493	339 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PRS3	YHL011C	DID4	P36108	232 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PRS3	YHL011C	YEL025C	P39991	1188 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PRS3	YHL011C	BUD17	P53727	317 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PRS3	YHL011C	YNL018C	P53976	612 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PRS3	YHL011C	PTA1	Q01329	785 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
PRS3	YHL011C	ARR3	Q06598	404 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PRS3	YHL011C	YDL073W	Q07454	984 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PRS3	YHL011C	YPL216W	Q08964	1102 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PRS3	YHL011C	APM4	Q99186	491 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PRS3	YHL011C	NUP145	P49687	1317 aa		4.04	□□□□□ -1.76
PRS3	YHL011C	RPL7A	P05737	244 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
PRS3	YHL011C	AQY1	P0CD91	305 aa		4.04	□□□□□ -1.76
PRS3	YHL011C	DGR2	P32330	852 aa		4.04	□□□□□ -1.76
PRS3	YHL011C	MF(ALPHA)2	P32435	120 aa		4.04	□□□□□ -1.76
PRS3	YHL011C	YDL183C	P48569	320 aa		4.04	□□□□□ -1.76
PRS3	YHL011C	COQ6	P53318	479 aa		4.04	□□□□□ -1.76
PRS3	YHL011C	YCG1	Q06680	1035 aa		4.04	□□□□□ -1.76
PRS3	YHL011C	AIM41	Q12032	185 aa		4.04	□□□□□ -1.76
PRS3	YHL011C	RPL7B	Q12213	244 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
PRS3	YHL011C	WHI2	P12611	486 aa		4.03	□□□□□ -1.76

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