RNA–Protein interactions for RNA: YER136W

GDI1, Transcript of GDP dissociation inhibitor, yeast

Gene GDI1, Length 1,356 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
GDI1	YER136W	ULS1	Q08562	1619 aa		3.5	□□□□□ -1.85
GDI1	YER136W	STU1	P38198	1513 aa		3.5	□□□□□ -1.85
GDI1	YER136W	SIR3	P06701	978 aa		3.5	□□□□□ -1.85
GDI1	YER136W	ABF1	P14164	731 aa		3.5	□□□□□ -1.85
GDI1	YER136W	PRP28	P23394	588 aa		3.5	□□□□□ -1.85
GDI1	YER136W	TSR4	P25040	408 aa		3.5	□□□□□ -1.85
GDI1	YER136W	KIN82	P25341	720 aa		3.5	□□□□□ -1.85
GDI1	YER136W	PET127	P32606	800 aa		3.5	□□□□□ -1.85
GDI1	YER136W	EMP70	P32802	667 aa		3.5	□□□□□ -1.85
GDI1	YER136W	SFB3	P38810	929 aa		3.5	□□□□□ -1.85
GDI1	YER136W	RSC8	P43609	557 aa	Known RBP	3.5	□□□□□ -1.85
GDI1	YER136W	NOP9	P47077	666 aa	Known RBP	3.5	□□□□□ -1.85
GDI1	YER136W	YJR096W	P47137	282 aa		3.5	□□□□□ -1.85
GDI1	YER136W	CTR1	P49573	406 aa		3.5	□□□□□ -1.85
GDI1	YER136W	YGR237C	P50089	785 aa		3.5	□□□□□ -1.85
GDI1	YER136W	PAN2	P53010	1115 aa	Predicted RBP	3.5	□□□□□ -1.85
GDI1	YER136W	VBA4	Q04602	768 aa	Known RBP	3.5	□□□□□ -1.85
GDI1	YER136W	FAP7	Q12055	197 aa	Predicted RBP	3.5	□□□□□ -1.85
GDI1	YER136W	DCS2	Q12123	353 aa		3.5	□□□□□ -1.85
GDI1	YER136W	SSD1	P24276	1250 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.49	□□□□□ -1.85	not detected
GDI1	YER136W	NTH1	P32356	751 aa		3.49	□□□□□ -1.85
GDI1	YER136W	ORC2	P32833	620 aa		3.49	□□□□□ -1.85
GDI1	YER136W	DID4	P36108	232 aa		3.49	□□□□□ -1.85
GDI1	YER136W	NDC80	P40460	691 aa		3.49	□□□□□ -1.85
GDI1	YER136W	ATG4	P53867	494 aa		3.49	□□□□□ -1.85
GDI1	YER136W	SMX3	P54999	86 aa	Predicted RBP	3.49	□□□□□ -1.85
GDI1	YER136W	MTQ2	Q03920	221 aa	Predicted RBP	3.49	□□□□□ -1.85
GDI1	YER136W	PPN1	Q04119	674 aa		3.49	□□□□□ -1.85
GDI1	YER136W	TAF3	Q12297	353 aa		3.49	□□□□□ -1.85
GDI1	YER136W	POM34	Q12445	299 aa		3.49	□□□□□ -1.85
GDI1	YER136W	SNQ2	P32568	1501 aa	Known RBP	3.48	□□□□□ -1.85
GDI1	YER136W	FRS1	P15624	595 aa	Known RBP	3.48	□□□□□ -1.85
GDI1	YER136W	SPO11	P23179	398 aa		3.48	□□□□□ -1.85
GDI1	YER136W	RGT1	P32862	1170 aa		3.48	□□□□□ -1.85
GDI1	YER136W	GLG1	P36143	616 aa		3.48	□□□□□ -1.85
GDI1	YER136W	BIT2	P38346	545 aa		3.48	□□□□□ -1.85
GDI1	YER136W	LYS9	P38999	446 aa		3.48	□□□□□ -1.85
GDI1	YER136W	BEM4	P39011	633 aa		3.48	□□□□□ -1.85
GDI1	YER136W	GET2	P40056	285 aa		3.48	□□□□□ -1.85
GDI1	YER136W	CCT5	P40413	562 aa	Known RBP	3.48	□□□□□ -1.85
GDI1	YER136W	PTA1	Q01329	785 aa	Predicted RBP	3.48	□□□□□ -1.85
GDI1	YER136W	LEE1	Q02799	301 aa	Known RBP	3.48	□□□□□ -1.85
GDI1	YER136W	RIM13	Q03792	727 aa		3.48	□□□□□ -1.85
GDI1	YER136W	TRM3	Q07527	1436 aa		3.48	□□□□□ -1.85
GDI1	YER136W	RPS9B	P05755	195 aa	Known RBP	3.47	□□□□□ -1.85
GDI1	YER136W	ERG6	P25087	383 aa	Known RBP	3.47	□□□□□ -1.85
GDI1	YER136W	PHO11	P35842	467 aa		3.47	□□□□□ -1.85
GDI1	YER136W	PHO12	P38693	467 aa		3.47	□□□□□ -1.85
GDI1	YER136W	NUG1	P40010	520 aa	Known RBP	3.47	□□□□□ -1.85
GDI1	YER136W	PXA1	P41909	870 aa		3.47	□□□□□ -1.85
GDI1	YER136W	MNN11	P46985	422 aa	Known RBP	3.47	□□□□□ -1.85
GDI1	YER136W	FHN1	P53279	174 aa		3.47	□□□□□ -1.85
GDI1	YER136W	YLR407W	Q06070	228 aa		3.47	□□□□□ -1.85
GDI1	YER136W	THI22	Q06490	572 aa		3.47	□□□□□ -1.85
GDI1	YER136W	ECM3	Q99252	613 aa		3.47	□□□□□ -1.85
GDI1	YER136W	PDR12	Q02785	1511 aa		3.47	□□□□□ -1.85
GDI1	YER136W	IMG2	P25642	146 aa	Predicted RBP	3.46	□□□□□ -1.86
GDI1	YER136W	YJL206C	P39529	758 aa		3.46	□□□□□ -1.86
GDI1	YER136W	BDH2	P39713	417 aa		3.46	□□□□□ -1.86
GDI1	YER136W	CCT7	P42943	550 aa	Known RBP	3.46	□□□□□ -1.86
GDI1	YER136W	ENP2	P48234	707 aa	Known RBP	3.46	□□□□□ -1.86
GDI1	YER136W	YHM2	Q04013	314 aa		3.46	□□□□□ -1.86
GDI1	YER136W	CHS5	Q12114	671 aa	Known RBP	3.46	□□□□□ -1.86
GDI1	YER136W	RPN13	O13563	156 aa		3.45	□□□□□ -1.86
GDI1	YER136W	SWI6	P09959	803 aa		3.45	□□□□□ -1.86
GDI1	YER136W	SEC65	P29478	273 aa		3.45	□□□□□ -1.86
GDI1	YER136W	YKU70	P32807	602 aa		3.45	□□□□□ -1.86
GDI1	YER136W	BCS1	P32839	456 aa		3.45	□□□□□ -1.86
GDI1	YER136W	DUN1	P39009	513 aa		3.45	□□□□□ -1.86
GDI1	YER136W	OAF1	P39720	1047 aa	Predicted RBP	3.45	□□□□□ -1.86
GDI1	YER136W	YEL020C	P39994	560 aa		3.45	□□□□□ -1.86
GDI1	YER136W	YNL195C	P40168	261 aa		3.45	□□□□□ -1.86
GDI1	YER136W	STB2	P46679	850 aa		3.45	□□□□□ -1.86
GDI1	YER136W	BNA3	P47039	444 aa	Known RBP	3.45	□□□□□ -1.86
GDI1	YER136W	BIT61	P47041	543 aa		3.45	□□□□□ -1.86
GDI1	YER136W	BPL1	P48445	690 aa	Predicted RBP	3.45	□□□□□ -1.86
GDI1	YER136W	PDR10	P51533	1564 aa		3.45	□□□□□ -1.86
GDI1	YER136W	GDB1	Q06625	1536 aa		3.44	□□□□□ -1.86
GDI1	YER136W	BUD3	P25558	1636 aa		3.44	□□□□□ -1.86
GDI1	YER136W	KCC4	P25389	1037 aa		3.44	□□□□□ -1.86
GDI1	YER136W	FEN2	P25621	512 aa	Known RBP	3.44	□□□□□ -1.86
GDI1	YER136W	GRX4	P32642	244 aa		3.44	□□□□□ -1.86
GDI1	YER136W	GMH1	P36125	273 aa		3.44	□□□□□ -1.86
GDI1	YER136W	HRB1	P38922	454 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.44	□□□□□ -1.86	not detected
GDI1	YER136W	YEN1	P40028	759 aa		3.44	□□□□□ -1.86
GDI1	YER136W	ECM9	Q02202	377 aa		3.44	□□□□□ -1.86
GDI1	YER136W	NSE5	Q03718	556 aa		3.44	□□□□□ -1.86
GDI1	YER136W	SEG1	Q04279	960 aa		3.44	□□□□□ -1.86
GDI1	YER136W	VPS36	Q06696	566 aa		3.44	□□□□□ -1.86
GDI1	YER136W	USV1	Q12132	391 aa		3.44	□□□□□ -1.86
GDI1	YER136W	APM4	Q99186	491 aa		3.44	□□□□□ -1.86
GDI1	YER136W	IQG1	Q12280	1495 aa		3.44	□□□□□ -1.86
GDI1	YER136W	MLP2	P40457	1679 aa		3.44	□□□□□ -1.86
GDI1	YER136W	RPS17A	P02407	136 aa	Known RBP	3.43	□□□□□ -1.86
GDI1	YER136W	RPS17B	P14127	136 aa	Known RBP	3.43	□□□□□ -1.86
GDI1	YER136W	THR1	P17423	357 aa	Known RBP	3.43	□□□□□ -1.86
GDI1	YER136W	SEC6	P32844	805 aa		3.43	□□□□□ -1.86
GDI1	YER136W	APL3	P38065	1025 aa		3.43	□□□□□ -1.86
GDI1	YER136W	CTP1	P38152	299 aa		3.43	□□□□□ -1.86
GDI1	YER136W	COS111	P38308	924 aa		3.43	□□□□□ -1.86

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 17.7 ms