RNA–Protein interactions for RNA: YEL009C

GCN4, Transcript of bZIP transcriptional activator of amino acid biosynthetic genes, yeastyeast

Gene GCN4, Length 846 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
GCN4YEL009C TSR4P25040 408 aa2.89□□□□□ -1.95
GCN4YEL009C ERG6P25087 383 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
GCN4YEL009C PRP45P28004 379 aaPredicted RBP2.89□□□□□ -1.95
GCN4YEL009C YMC1P32331 307 aa2.89□□□□□ -1.95
GCN4YEL009C PXL1P36166 706 aa2.89□□□□□ -1.95
GCN4YEL009C PAM1P37304 830 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
GCN4YEL009C CRP1P38845 465 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
GCN4YEL009C PMC1P38929 1173 aaPredicted RBP2.89□□□□□ -1.95
GCN4YEL009C MIT1P40002 666 aa2.89□□□□□ -1.95
GCN4YEL009C ALG2P43636 503 aa2.89□□□□□ -1.95
GCN4YEL009C TY4A-JP47023 414 aa2.89□□□□□ -1.95
GCN4YEL009C SNU71P53207 620 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
GCN4YEL009C RRP5Q05022 1729 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
GCN4YEL009C YDL124WQ07551 312 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
GCN4YEL009C ENT1Q12518 454 aa2.89□□□□□ -1.95
GCN4YEL009C PHO5P00635 467 aa2.88□□□□□ -1.95
GCN4YEL009C RPS24AP0CX31 135 aaKnown RBP2.88□□□□□ -1.95
GCN4YEL009C RPS24BP0CX32 135 aaKnown RBP2.88□□□□□ -1.95
GCN4YEL009C PEX1P24004 1043 aa2.88□□□□□ -1.95
GCN4YEL009C GCS1P35197 352 aa2.88□□□□□ -1.95
GCN4YEL009C YHR020WP38708 688 aaKnown RBP2.88□□□□□ -1.95
GCN4YEL009C GET2P40056 285 aa2.88□□□□□ -1.95
GCN4YEL009C RTA1P53047 317 aa2.88□□□□□ -1.95
GCN4YEL009C NUP53Q03790 475 aa2.88□□□□□ -1.95
GCN4YEL009C TY4B-HP0C2J7 1802 aa2.87□□□□□ -1.95
GCN4YEL009C TY4B-JP47024 1803 aa2.87□□□□□ -1.95
GCN4YEL009C HUL4P40985 892 aa2.87□□□□□ -1.95
GCN4YEL009C ENP2P48234 707 aaKnown RBP2.87□□□□□ -1.95
GCN4YEL009C YGR151CP53287 111 aa2.87□□□□□ -1.95
GCN4YEL009C SCW4P53334 386 aaKnown RBP2.87□□□□□ -1.95
GCN4YEL009C YDR338CQ05497 695 aa2.87□□□□□ -1.95
GCN4YEL009C FLC1Q08967 793 aa2.87□□□□□ -1.95
GCN4YEL009C YRF1-2P40105 1681 aa2.86□□□□□ -1.95
GCN4YEL009C PCI8P40512 444 aa2.86□□□□□ -1.95
GCN4YEL009C ASN1P49089 572 aaKnown RBP2.86□□□□□ -1.95
GCN4YEL009C ORC4P54791 529 aa2.86□□□□□ -1.95
GCN4YEL009C ERG13P54839 491 aaKnown RBP2.86□□□□□ -1.95
GCN4YEL009C REC102Q02721 264 aa2.86□□□□□ -1.95
GCN4YEL009C TAP42Q04372 366 aa2.86□□□□□ -1.95
GCN4YEL009C SCW10Q04951 389 aa2.86□□□□□ -1.95
GCN4YEL009C IMH1Q06704 911 aaKnown RBP2.86□□□□□ -1.95
GCN4YEL009C SLM3Q12093 417 aa2.86□□□□□ -1.95
GCN4YEL009C SEC3P33332 1336 aaKnown RBP2.86□□□□□ -1.95
GCN4YEL009C AUS1Q08409 1394 aa2.86□□□□□ -1.95
GCN4YEL009C YEF3P16521 1044 aaKnown RBP2.85□□□□□ -1.95
GCN4YEL009C PRP28P23394 588 aa2.85□□□□□ -1.95
GCN4YEL009C GRX4P32642 244 aa2.85□□□□□ -1.95
GCN4YEL009C MIP6P38760 659 aaKnown RBP2.85□□□□□ -1.95
GCN4YEL009C YAT2P40017 923 aa2.85□□□□□ -1.95
GCN4YEL009C GID8P40208 455 aa2.85□□□□□ -1.95
GCN4YEL009C MNT3P40549 630 aa2.85□□□□□ -1.95
GCN4YEL009C MAF1P41910 395 aa2.85□□□□□ -1.95
GCN4YEL009C ALY2P47029 1046 aa2.85□□□□□ -1.95
GCN4YEL009C NMA2P53204 395 aa2.85□□□□□ -1.95
GCN4YEL009C HIM1Q06674 414 aa2.85□□□□□ -1.95
GCN4YEL009C Q0142Q9ZZW4 58 aa2.85□□□□□ -1.95
GCN4YEL009C SPT7P35177 1332 aa2.85□□□□□ -1.95
GCN4YEL009C RSF2P46974 1380 aa2.85□□□□□ -1.95
GCN4YEL009C CAN1P04817 590 aa2.84□□□□□ -1.95
GCN4YEL009C RNR1P21524 888 aaKnown RBP2.84□□□□□ -1.95
GCN4YEL009C ECM32P32644 1121 aaKnown RBP2.84□□□□□ -1.95
GCN4YEL009C BEM3P32873 1128 aa2.84□□□□□ -1.95
GCN4YEL009C KSP1P38691 1029 aaKnown RBP2.84□□□□□ -1.95
GCN4YEL009C BNA2P47125 453 aa2.84□□□□□ -1.95
GCN4YEL009C HUL5P53119 910 aa2.84□□□□□ -1.95
GCN4YEL009C MDM20Q12387 796 aaKnown RBP2.84□□□□□ -1.95
GCN4YEL009C MLP1Q02455 1875 aaKnown RBP2.84□□□□□ -1.96
GCN4YEL009C BCS1P32839 456 aa2.83□□□□□ -1.96
GCN4YEL009C SEC6P32844 805 aa2.83□□□□□ -1.96
GCN4YEL009C ASK1P35734 292 aa2.83□□□□□ -1.96
GCN4YEL009C ENP1P38333 483 aaKnown RBP2.83□□□□□ -1.96
GCN4YEL009C BIT2P38346 545 aa2.83□□□□□ -1.96
GCN4YEL009C JHD1P40034 492 aa2.83□□□□□ -1.96
GCN4YEL009C NOP9P47077 666 aaKnown RBP2.83□□□□□ -1.96
GCN4YEL009C THI22Q06490 572 aa2.83□□□□□ -1.96
GCN4YEL009C YDL086WQ07505 273 aa2.83□□□□□ -1.96
GCN4YEL009C AI5_ALPHAQ9ZZX1 630 aa2.83□□□□□ -1.96
GCN4YEL009C RPO41P13433 1351 aaKnown RBP2.83□□□□□ -1.96
GCN4YEL009C APC1P53886 1748 aa2.82□□□□□ -1.96
GCN4YEL009C YIL177CP40434 1758 aa2.82□□□□□ -1.96
GCN4YEL009C YJL225CP40889 1758 aa2.82□□□□□ -1.96
GCN4YEL009C TPK2P06245 380 aa2.82□□□□□ -1.96
GCN4YEL009C RAD18P10862 487 aa2.82□□□□□ -1.96
GCN4YEL009C YEL1P34225 687 aa2.82□□□□□ -1.96
GCN4YEL009C YKL133CP36066 463 aa2.82□□□□□ -1.96
GCN4YEL009C PIG2P40187 538 aa2.82□□□□□ -1.96
GCN4YEL009C DOT5P40553 215 aa2.82□□□□□ -1.96
GCN4YEL009C PAP2P53632 584 aaKnown RBP2.82□□□□□ -1.96
GCN4YEL009C ARG7Q04728 441 aa2.82□□□□□ -1.96
GCN4YEL009C ENT2Q05785 613 aa2.82□□□□□ -1.96
GCN4YEL009C SIR4P11978 1358 aa2.82□□□□□ -1.96
GCN4YEL009C ROM2P51862 1356 aaKnown RBP2.82□□□□□ -1.96
GCN4YEL009C URB1P34241 1764 aaKnown RBP2.82□□□□□ -1.96
GCN4YEL009C TUP1P16649 713 aa2.81□□□□□ -1.96
GCN4YEL009C APL3P38065 1025 aa2.81□□□□□ -1.96
GCN4YEL009C CTP1P38152 299 aa2.81□□□□□ -1.96
GCN4YEL009C DED81P38707 554 aaKnown RBP2.81□□□□□ -1.96
GCN4YEL009C YHR097CP38809 366 aaKnown RBP2.81□□□□□ -1.96
GCN4YEL009C SNO3P43544 222 aa2.81□□□□□ -1.96
GCN4YEL009C RRP46P53256 223 aaPredicted RBP2.81□□□□□ -1.96
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