RNA–Protein interactions for RNA: tT(AGU)C

tT(AGU)C, Transcript of Threonine tRNA (tRNA-Thr), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene tT(AGU)C, Length 73 nt, Biotype tRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tT(AGU)CtT(AGU)C SSL2Q00578 843 aa0.75□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C NGL3Q03210 505 aa0.75□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C STE20Q03497 939 aaKnown RBP0.75□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C HER2Q03557 464 aa0.75□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C YDR131CQ03899 556 aa0.75□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C SXM1Q04175 944 aaKnown RBP0.75□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C YML083CQ04526 418 aa0.75□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C GFD1Q04839 188 aaKnown RBP0.75□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C YDR222WQ04925 415 aa0.75□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C RTN1Q04947 295 aaKnown RBP0.75□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C TAF9Q05027 157 aa0.75□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C HPF1Q05164 967 aa0.75□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C HCR1Q05775 265 aaKnown RBP0.75□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C HRD3Q05787 833 aa0.75□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C KAP95Q06142 861 aaKnown RBP0.75□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C RGA2Q06407 1009 aa0.75□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C YLH47Q06493 454 aa0.75□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C PMT7Q06644 662 aa0.75□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C YPR084WQ06821 456 aa0.75□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C SHS1Q07657 551 aa0.75□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C NSE1Q07913 336 aa0.75□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C YLR012CQ07927 99 aa0.75□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C PSR2Q07949 397 aa0.75□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C FMP25Q08023 583 aa0.75□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C RCL1Q08096 367 aaPredicted RBP0.75□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C ESC8Q08119 714 aa0.75□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C SIL1Q08199 421 aa0.75□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C ABP140Q08641 628 aaKnown RBP0.75□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C YOR387CQ08910 206 aa0.75□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C LEA1Q08963 238 aaPredicted RBP0.75□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C HMI1Q12039 706 aa0.75□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C DAS2Q12084 232 aa0.75□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C SLX4Q12098 748 aa0.75□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C NBP2Q12163 236 aa0.75□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C MNL2Q12205 849 aa0.75□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C PUF2Q12221 1075 aaKnown RBP RIP-Chip data0.75□□□□□ -2.29not detected
tT(AGU)CtT(AGU)C TFC8Q12308 588 aa0.75□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C GPM3Q12326 303 aa0.75□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C NDJ1Q12366 352 aa0.75□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C PDH1Q12428 516 aaKnown RBP0.75□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C YOL098CQ12496 1037 aa0.75□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C AVL9Q12500 764 aa0.75□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C ECM3Q99252 613 aa0.75□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C TRS33Q99394 268 aa0.75□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C TAO3P40468 2376 aa0.75□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C NUM1Q00402 2748 aa0.74□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C MSB2P32334 1306 aa0.74□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C CDC37P06101 506 aaKnown RBP0.74□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C CIT2P08679 460 aa0.74□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C TUB3P09734 445 aaKnown RBP0.74□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C MAS1P10507 462 aa0.74□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C PEP5P12868 1029 aa0.74□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C HOM2P13663 365 aaKnown RBP0.74□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C SPO12P17123 173 aa0.74□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C RAM1P22007 431 aa0.74□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C TRX1P22217 103 aaKnown RBP0.74□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C PEX1P24004 1043 aa0.74□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C TSR4P25040 408 aa0.74□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C MRM1P25270 412 aa0.74□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C RAD57P25301 460 aa0.74□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C HCM1P25364 564 aa0.74□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C YCR015CP25616 317 aa0.74□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C PDC6P26263 563 aaKnown RBP0.74□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C MCM2P29469 868 aa0.74□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C SEC65P29478 273 aa0.74□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C PMI40P29952 429 aaKnown RBP0.74□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C MET22P32179 357 aa0.74□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C PYC2P32327 1180 aaKnown RBP0.74□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C KAR9P32526 644 aa0.74□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C GCG1P32656 232 aaKnown RBP0.74□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C SWE1P32944 819 aa0.74□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C TYE7P33122 291 aaPredicted RBP0.74□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C SPT23P35210 1082 aa0.74□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C BLI1P35727 113 aa0.74□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C DID4P36108 232 aa0.74□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C ALY1P36117 915 aa0.74□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C SAP190P36123 1033 aa0.74□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C YBR056WP38081 501 aa0.74□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C RDH54P38086 958 aa0.74□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C APM3P38153 483 aa0.74□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C KAP104P38217 918 aaKnown RBP0.74□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C EXO5P38289 585 aa0.74□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C MCX1P38323 520 aaPredicted RBP0.74□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C SWC5P38326 303 aa0.74□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C RGD1P38339 666 aa0.74□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C RCK2P38623 610 aa0.74□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C KIC1P38692 1080 aa0.74□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C FSH1P38777 243 aaKnown RBP0.74□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C QNS1P38795 714 aaKnown RBP0.74□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C GGA2P38817 585 aaKnown RBP0.74□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C LAM1P38851 1228 aa0.74□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C NMD3P38861 518 aaKnown RBP0.74□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C SSP1P38871 571 aa0.74□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C AIM18P38884 321 aa0.74□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C SET5P38890 526 aaKnown RBP0.74□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C LYS9P38999 446 aa0.74□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C PRM9P39551 298 aa0.74□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C GEM1P39722 662 aa0.74□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C YEL075CP39972 122 aa0.74□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C EDC3P39998 551 aaKnown RBP0.74□□□□□ -2.29
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 46.3 ms