RNA–Protein interactions for RNA: YMR054W

STV1, Transcript of Subunit a of the vacuolar-ATPase V0 domain, yeast

Gene STV1, Length 2,673 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
STV1	YMR054W	DEF1	P35732	738 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
STV1	YMR054W	LSB6	P42951	607 aa		4.59	□□□□□ -1.67
STV1	YMR054W	PTK2	P47116	818 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
STV1	YMR054W	BNA2	P47125	453 aa		4.59	□□□□□ -1.67
STV1	YMR054W	MTD1	Q02046	320 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
STV1	YMR054W	LRS4	Q04087	347 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
STV1	YMR054W	RNH1	Q04740	348 aa		4.59	□□□□□ -1.67
STV1	YMR054W	RTN2	Q12443	393 aa		4.59	□□□□□ -1.67
STV1	YMR054W	ARG3	P05150	338 aa		4.59	□□□□□ -1.67
STV1	YMR054W	GLN4	P13188	809 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
STV1	YMR054W	VMA2	P16140	517 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
STV1	YMR054W	RTG1	P32607	177 aa		4.59	□□□□□ -1.67
STV1	YMR054W	SLA2	P33338	968 aa		4.59	□□□□□ -1.67
STV1	YMR054W	TIF11	P38912	153 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
STV1	YMR054W	YTA6	P40328	754 aa		4.59	□□□□□ -1.67
STV1	YMR054W	MAD2	P40958	196 aa		4.59	□□□□□ -1.67
STV1	YMR054W	SIP4	P46954	829 aa		4.59	□□□□□ -1.67
STV1	YMR054W	ELA1	P53861	379 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
STV1	YMR054W	SGT2	Q12118	346 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
STV1	YMR054W	NFI1	Q12216	726 aa		4.59	□□□□□ -1.67
STV1	YMR054W	YBL029C-A	Q3E756	94 aa		4.59	□□□□□ -1.67
STV1	YMR054W	YOL159C-A	Q3E769	90 aa		4.59	□□□□□ -1.67
STV1	YMR054W	Q0142	Q9ZZW4	58 aa		4.59	□□□□□ -1.67
STV1	YMR054W	MCM3	P24279	971 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.68
STV1	YMR054W	YKL077W	P36081	392 aa		4.59	□□□□□ -1.68
STV1	YMR054W	LAP3	Q01532	483 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.59	□□□□□ -1.68	not detected
STV1	YMR054W	YIG1	Q08956	461 aa		4.59	□□□□□ -1.68
STV1	YMR054W	ACO1	P19414	778 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.58	□□□□□ -1.68	not detected
STV1	YMR054W	YFL054C	P43549	646 aa		4.58	□□□□□ -1.68
STV1	YMR054W	SPO74	P45819	413 aa		4.58	□□□□□ -1.68
STV1	YMR054W	YJR039W	P47107	1121 aa		4.58	□□□□□ -1.68
STV1	YMR054W	YML082W	Q04533	649 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
STV1	YMR054W	MCH5	Q08777	521 aa		4.58	□□□□□ -1.68
STV1	YMR054W	PAR32	Q12515	295 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
STV1	YMR054W	SKI3	P17883	1432 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
STV1	YMR054W	GPI10	P30777	616 aa		4.58	□□□□□ -1.68
STV1	YMR054W	VID28	P40547	921 aa		4.58	□□□□□ -1.68
STV1	YMR054W	SGF73	P53165	657 aa		4.58	□□□□□ -1.68
STV1	YMR054W	FDC1	Q03034	503 aa		4.58	□□□□□ -1.68
STV1	YMR054W	YLH47	Q06493	454 aa		4.58	□□□□□ -1.68
STV1	YMR054W	NGL1	Q08213	363 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
STV1	YMR054W	DIN7	Q12086	430 aa		4.58	□□□□□ -1.68
STV1	YMR054W	PTC5	Q12511	572 aa		4.58	□□□□□ -1.68
STV1	YMR054W	PCD1	Q12524	340 aa		4.58	□□□□□ -1.68
STV1	YMR054W	NUC1	P08466	329 aa		4.57	□□□□□ -1.68
STV1	YMR054W	SWI4	P25302	1093 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
STV1	YMR054W	SED4	P25365	1065 aa		4.57	□□□□□ -1.68
STV1	YMR054W	DLD1	P32891	587 aa		4.57	□□□□□ -1.68
STV1	YMR054W	PPQ1	P32945	549 aa		4.57	□□□□□ -1.68
STV1	YMR054W	CNS1	P33313	385 aa		4.57	□□□□□ -1.68
STV1	YMR054W	TGL1	P34163	548 aa		4.57	□□□□□ -1.68
STV1	YMR054W	STL1	P39932	569 aa		4.57	□□□□□ -1.68
STV1	YMR054W	CIR1	P42940	261 aa		4.57	□□□□□ -1.68
STV1	YMR054W	CCM1	P48237	864 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
STV1	YMR054W	MTC3	P53077	123 aa		4.57	□□□□□ -1.68
STV1	YMR054W	NCE103	P53615	221 aa		4.57	□□□□□ -1.68
STV1	YMR054W	VPS75	P53853	264 aa		4.57	□□□□□ -1.68
STV1	YMR054W	YDR514C	Q04408	483 aa		4.57	□□□□□ -1.68
STV1	YMR054W	NSI1	Q12457	570 aa		4.57	□□□□□ -1.68
STV1	YMR054W	NOP58	Q12499	511 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
STV1	YMR054W	ISN1	Q99312	450 aa		4.57	□□□□□ -1.68
STV1	YMR054W	RPO21	P04050	1733 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
STV1	YMR054W	SNT2	P53127	1403 aa		4.57	□□□□□ -1.68
STV1	YMR054W	MNE1	P24720	663 aa		4.57	□□□□□ -1.68
STV1	YMR054W	ADK2	P26364	225 aa		4.57	□□□□□ -1.68
STV1	YMR054W	FRD1	P32614	470 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
STV1	YMR054W	RIB7	P33312	244 aa		4.57	□□□□□ -1.68
STV1	YMR054W	SPO22	P40511	975 aa		4.57	□□□□□ -1.68
STV1	YMR054W	YOR059C	Q08448	450 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
STV1	YMR054W	TRX1	P22217	103 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
STV1	YMR054W	PUP2	P32379	260 aa		4.56	□□□□□ -1.68
STV1	YMR054W	BCK2	P33306	851 aa		4.56	□□□□□ -1.68
STV1	YMR054W	CTF13	P35203	478 aa		4.56	□□□□□ -1.68
STV1	YMR054W	NOP9	P47077	666 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
STV1	YMR054W	PSP1	P50896	841 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
STV1	YMR054W	PRO2	P54885	456 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
STV1	YMR054W	YML119W	Q03208	357 aa		4.56	□□□□□ -1.68
STV1	YMR054W	HAS1	Q03532	505 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
STV1	YMR054W	RAD33	Q04231	177 aa		4.56	□□□□□ -1.68
STV1	YMR054W	RSC2	Q06488	889 aa		4.56	□□□□□ -1.68
STV1	YMR054W	CSR1	Q06705	408 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
STV1	YMR054W	YLR149C	Q99296	730 aa		4.56	□□□□□ -1.68
STV1	YMR054W	TY2B-B	Q12491	1770 aa		4.56	□□□□□ -1.68
STV1	YMR054W	SUI3	P09064	285 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
STV1	YMR054W	CAF20	P12962	161 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
STV1	YMR054W	RAD51	P25454	400 aa		4.56	□□□□□ -1.68
STV1	YMR054W	DBF4	P32325	704 aa		4.56	□□□□□ -1.68
STV1	YMR054W	MDL1	P33310	695 aa		4.56	□□□□□ -1.68
STV1	YMR054W	GND1	P38720	489 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
STV1	YMR054W	SAW1	P39735	261 aa		4.56	□□□□□ -1.68
STV1	YMR054W	PTC2	P39966	464 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
STV1	YMR054W	PCL7	P40186	285 aa		4.56	□□□□□ -1.68
STV1	YMR054W	LCB2	P40970	561 aa		4.56	□□□□□ -1.68
STV1	YMR054W	AAD14	P42884	376 aa		4.56	□□□□□ -1.68
STV1	YMR054W	FYV8	P46949	817 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
STV1	YMR054W	ALY2	P47029	1046 aa		4.56	□□□□□ -1.68
STV1	YMR054W	MRX6	P48564	524 aa		4.56	□□□□□ -1.68
STV1	YMR054W	LEE1	Q02799	301 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
STV1	YMR054W	YPL107W	Q02873	248 aa		4.56	□□□□□ -1.68
STV1	YMR054W	YCG1	Q06680	1035 aa		4.56	□□□□□ -1.68

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 160.2 ms