RNA–Protein interactions for RNA: YML056C

IMD4, Transcript of Inosine monophosphate dehydrogenase, yeast

Gene IMD4, Length 1,575 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
IMD4	YML056C	SEC23	P15303	768 aa	Known RBP	4	□□□□□ -1.77
IMD4	YML056C	PUF4	P25339	888 aa	Known RBP RIP-Chip data	4	□□□□□ -1.77	not detected
IMD4	YML056C	NPL6	P32832	435 aa		4	□□□□□ -1.77
IMD4	YML056C	DOM34	P33309	386 aa		4	□□□□□ -1.77
IMD4	YML056C	PIN4	P34217	668 aa	Known RBP RIP-Chip data	4	□□□□□ -1.77	not detected
IMD4	YML056C	KAP123	P40069	1113 aa	Known RBP	4	□□□□□ -1.77
IMD4	YML056C	OYE3	P41816	400 aa	Predicted RBP	4	□□□□□ -1.77
IMD4	YML056C	SET2	P46995	733 aa	Known RBP	4	□□□□□ -1.77
IMD4	YML056C	SHE10	P53075	577 aa		4	□□□□□ -1.77
IMD4	YML056C	ZDS2	P54786	942 aa		4	□□□□□ -1.77
IMD4	YML056C	VPS9	P54787	451 aa		4	□□□□□ -1.77
IMD4	YML056C	SEC5	P89102	971 aa		4	□□□□□ -1.77
IMD4	YML056C	VTC3	Q02725	835 aa		4	□□□□□ -1.77
IMD4	YML056C	RAD33	Q04231	177 aa		4	□□□□□ -1.77
IMD4	YML056C	YDL073W	Q07454	984 aa		4	□□□□□ -1.77
IMD4	YML056C	MRN1	Q08925	612 aa	Known RBP RIP-Chip data	4	□□□□□ -1.77	not detected
IMD4	YML056C	RKM4	Q12504	494 aa		4	□□□□□ -1.77
IMD4	YML056C	RAD18	P10862	487 aa		3.99	□□□□□ -1.77
IMD4	YML056C	AAC3	P18238	307 aa		3.99	□□□□□ -1.77
IMD4	YML056C	SFL1	P20134	766 aa		3.99	□□□□□ -1.77
IMD4	YML056C	MSH1	P25846	959 aa		3.99	□□□□□ -1.77
IMD4	YML056C	HEM12	P32347	362 aa	Predicted RBP	3.99	□□□□□ -1.77
IMD4	YML056C	PAH1	P32567	862 aa		3.99	□□□□□ -1.77
IMD4	YML056C	CNS1	P33313	385 aa		3.99	□□□□□ -1.77
IMD4	YML056C	NIP100	P33420	868 aa		3.99	□□□□□ -1.77
IMD4	YML056C	RER2	P35196	286 aa		3.99	□□□□□ -1.77
IMD4	YML056C	NNK1	P36003	928 aa		3.99	□□□□□ -1.77
IMD4	YML056C	MUD2	P36084	527 aa	Known RBP	3.99	□□□□□ -1.77
IMD4	YML056C	BYE1	P36106	594 aa		3.99	□□□□□ -1.77
IMD4	YML056C	BFR1	P38934	470 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.99	□□□□□ -1.77	not detected
IMD4	YML056C	RTT105	P40063	208 aa		3.99	□□□□□ -1.77
IMD4	YML056C	PCL7	P40186	285 aa		3.99	□□□□□ -1.77
IMD4	YML056C	AXL1	P40851	1208 aa		3.99	□□□□□ -1.77
IMD4	YML056C	IRC6	P43615	237 aa		3.99	□□□□□ -1.77
IMD4	YML056C	FYV8	P46949	817 aa	Known RBP	3.99	□□□□□ -1.77
IMD4	YML056C	VPS53	P47061	822 aa		3.99	□□□□□ -1.77
IMD4	YML056C	UPF3	P48412	387 aa	Known RBP	3.99	□□□□□ -1.77
IMD4	YML056C	RNR4	P49723	345 aa	Known RBP	3.99	□□□□□ -1.77
IMD4	YML056C	ZIP2	P53061	704 aa		3.99	□□□□□ -1.77
IMD4	YML056C	HST1	P53685	503 aa		3.99	□□□□□ -1.77
IMD4	YML056C	RRP5	Q05022	1729 aa	Known RBP	3.99	□□□□□ -1.77
IMD4	YML056C	YCG1	Q06680	1035 aa		3.99	□□□□□ -1.77
IMD4	YML056C	GUD1	Q07729	489 aa		3.99	□□□□□ -1.77
IMD4	YML056C	YML133C	Q03099	1374 aa		3.99	□□□□□ -1.77
IMD4	YML056C	YLL067C	Q07888	1374 aa		3.99	□□□□□ -1.77
IMD4	YML056C	YLL066C	Q99208	1374 aa		3.99	□□□□□ -1.77
IMD4	YML056C	DED1	P06634	604 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
IMD4	YML056C	YER152C	P10356	443 aa		3.98	□□□□□ -1.77
IMD4	YML056C	PDX1	P16451	410 aa		3.98	□□□□□ -1.77
IMD4	YML056C	SEC18	P18759	758 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
IMD4	YML056C	REC107	P21651	314 aa		3.98	□□□□□ -1.77
IMD4	YML056C	PCL2	P25693	308 aa		3.98	□□□□□ -1.77
IMD4	YML056C	ADD66	P36040	267 aa		3.98	□□□□□ -1.77
IMD4	YML056C	TIF5	P38431	405 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
IMD4	YML056C	VPS41	P38959	992 aa		3.98	□□□□□ -1.77
IMD4	YML056C	SIT1	P39980	628 aa		3.98	□□□□□ -1.77
IMD4	YML056C	VHR1	P40522	640 aa		3.98	□□□□□ -1.77
IMD4	YML056C	UBP6	P43593	499 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
IMD4	YML056C	MNN11	P46985	422 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
IMD4	YML056C	TPP1	Q03796	238 aa		3.98	□□□□□ -1.77
IMD4	YML056C	ARA2	Q04212	335 aa		3.98	□□□□□ -1.77
IMD4	YML056C	RSA3	Q05942	220 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
IMD4	YML056C	HDA2	Q06629	674 aa		3.98	□□□□□ -1.77
IMD4	YML056C	YVC1	Q12324	675 aa		3.98	□□□□□ -1.77
IMD4	YML056C	SNF2	P22082	1703 aa		3.98	□□□□□ -1.77
IMD4	YML056C	TUF1	P02992	437 aa	Known RBP	3.97	□□□□□ -1.77
IMD4	YML056C	CDC9	P04819	755 aa		3.97	□□□□□ -1.77
IMD4	YML056C	TOP3	P13099	656 aa		3.97	□□□□□ -1.77
IMD4	YML056C	CMP2	P14747	604 aa		3.97	□□□□□ -1.77
IMD4	YML056C	COX11	P19516	300 aa	Known RBP	3.97	□□□□□ -1.77
IMD4	YML056C	DAL7	P21826	554 aa		3.97	□□□□□ -1.77
IMD4	YML056C	RPC53	P25441	422 aa		3.97	□□□□□ -1.77
IMD4	YML056C	RPN2	P32565	945 aa	Known RBP	3.97	□□□□□ -1.77
IMD4	YML056C	AFG2	P32794	780 aa		3.97	□□□□□ -1.77
IMD4	YML056C	DID4	P36108	232 aa		3.97	□□□□□ -1.77
IMD4	YML056C	ATG14	P38270	344 aa		3.97	□□□□□ -1.77
IMD4	YML056C	PPE1	P38796	400 aa		3.97	□□□□□ -1.77
IMD4	YML056C	SPC72	P39723	622 aa		3.97	□□□□□ -1.77
IMD4	YML056C	ENT3	P47160	408 aa		3.97	□□□□□ -1.77
IMD4	YML056C	GNP1	P48813	663 aa		3.97	□□□□□ -1.77
IMD4	YML056C	AIM14	P53109	570 aa		3.97	□□□□□ -1.77
IMD4	YML056C	YAP1802	P53309	568 aa		3.97	□□□□□ -1.77
IMD4	YML056C	CNM67	P53865	581 aa	Known RBP	3.97	□□□□□ -1.77
IMD4	YML056C	SFB2	P53953	876 aa		3.97	□□□□□ -1.77
IMD4	YML056C	COG8	Q04632	607 aa		3.97	□□□□□ -1.77
IMD4	YML056C	GAD1	Q04792	585 aa		3.97	□□□□□ -1.77
IMD4	YML056C	EST2	Q06163	884 aa		3.97	□□□□□ -1.77
IMD4	YML056C	HIM1	Q06674	414 aa		3.97	□□□□□ -1.77
IMD4	YML056C	YOR059C	Q08448	450 aa	Known RBP	3.97	□□□□□ -1.77
IMD4	YML056C	PUS7	Q08647	676 aa	Known RBP	3.97	□□□□□ -1.77
IMD4	YML056C	YOL114C	Q12322	202 aa		3.97	□□□□□ -1.77
IMD4	YML056C	SFI1	Q12369	946 aa		3.97	□□□□□ -1.77
IMD4	YML056C	PHR1	P05066	565 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.97	□□□□□ -1.77	not detected
IMD4	YML056C	INO1	P11986	533 aa		3.97	□□□□□ -1.77
IMD4	YML056C	SRO9	P25567	434 aa	Known RBP	3.97	□□□□□ -1.77
IMD4	YML056C	DAL80	P26343	269 aa		3.97	□□□□□ -1.77
IMD4	YML056C	PRP45	P28004	379 aa	Predicted RBP	3.97	□□□□□ -1.77
IMD4	YML056C	DAL3	P32459	195 aa		3.97	□□□□□ -1.77
IMD4	YML056C	YKU70	P32807	602 aa		3.97	□□□□□ -1.77
IMD4	YML056C	XRS2	P33301	854 aa		3.97	□□□□□ -1.77

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