RNA–Protein interactions for RNA: YLR368W

MDM30, Transcript of F-box component of an SCF ubiquitin protein ligase complex, yeast

Gene MDM30, Length 1,797 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MDM30	YLR368W	MED8	P38304	223 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MDM30	YLR368W	SNZ3	P43545	298 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MDM30	YLR368W	SNZ2	P53824	298 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MDM30	YLR368W	CAF120	P53836	1060 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MDM30	YLR368W	TOF1	P53840	1238 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MDM30	YLR368W	IST1	P53843	298 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
MDM30	YLR368W	VPS9	P54787	451 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MDM30	YLR368W	ULP1	Q02724	621 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MDM30	YLR368W	UTP21	Q06078	939 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
MDM30	YLR368W	OPT2	Q06593	877 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MDM30	YLR368W	PUN1	Q06991	263 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MDM30	YLR368W	DSE3	Q08729	430 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MDM30	YLR368W	ISA2	Q12425	185 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MDM30	YLR368W	SWI5	P08153	709 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MDM30	YLR368W	PHO81	P17442	1178 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MDM30	YLR368W	DBP3	P20447	523 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
MDM30	YLR368W	SPB1	P25582	841 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
MDM30	YLR368W	PAH1	P32567	862 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MDM30	YLR368W	UTR2	P32623	467 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MDM30	YLR368W	YPT52	P36018	234 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
MDM30	YLR368W	LAS1	P36146	502 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
MDM30	YLR368W	PCH2	P38126	564 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MDM30	YLR368W	COS111	P38308	924 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MDM30	YLR368W	APM2	P38700	605 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MDM30	YLR368W	RTC3	P38804	111 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
MDM30	YLR368W	RVS167	P39743	482 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
MDM30	YLR368W	NOP16	P40007	231 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
MDM30	YLR368W	LSM5	P40089	93 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
MDM30	YLR368W	LCB2	P40970	561 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MDM30	YLR368W	XKS1	P42826	600 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MDM30	YLR368W	BPL1	P48445	690 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
MDM30	YLR368W	TEL2	P53038	688 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MDM30	YLR368W	LCL3	P53153	274 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MDM30	YLR368W	YMR155W	Q03795	547 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MDM30	YLR368W	KAP95	Q06142	861 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
MDM30	YLR368W	YIG1	Q08956	461 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MDM30	YLR368W	CDC19	P00549	500 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
MDM30	YLR368W	PRB1	P09232	635 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MDM30	YLR368W	RPS6A	P0CX37	236 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
MDM30	YLR368W	RPS6B	P0CX38	236 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
MDM30	YLR368W	POL3	P15436	1097 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MDM30	YLR368W	RPI1	P23250	407 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
MDM30	YLR368W	RRP7	P25368	297 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
MDM30	YLR368W	MEI5	P32489	222 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MDM30	YLR368W	MMS4	P38257	691 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MDM30	YLR368W	YBR138C	P38277	524 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MDM30	YLR368W	ACO2	P39533	789 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MDM30	YLR368W	GEM1	P39722	662 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MDM30	YLR368W	DLD3	P39976	496 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
MDM30	YLR368W	VHR1	P40522	640 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MDM30	YLR368W	AGE2	P40529	298 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MDM30	YLR368W	MPH1	P40562	993 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MDM30	YLR368W	IMA5	P40884	581 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MDM30	YLR368W	ARF3	P40994	183 aa	RIP-Chip data	4.56	□□□□□ -1.68	not detected
MDM30	YLR368W	GCN20	P43535	752 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
MDM30	YLR368W	BNA6	P43619	295 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MDM30	YLR368W	NOP9	P47077	666 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
MDM30	YLR368W	YPL107W	Q02873	248 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MDM30	YLR368W	HFD1	Q04458	532 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MDM30	YLR368W	VIK1	Q12045	647 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MDM30	YLR368W	SSM4	P40318	1319 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MDM30	YLR368W	TUS1	Q06412	1307 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MDM30	YLR368W	CPA2	P03965	1118 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
MDM30	YLR368W	RAD3	P06839	778 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MDM30	YLR368W	MSS18	P08593	268 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MDM30	YLR368W	BAS1	P22035	811 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MDM30	YLR368W	RRP43	P25359	394 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
MDM30	YLR368W	YJU2	P28320	278 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
MDM30	YLR368W	CDC12	P32468	407 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
MDM30	YLR368W	SUR1	P33300	382 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MDM30	YLR368W	MSN4	P33749	630 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MDM30	YLR368W	LHS1	P36016	881 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MDM30	YLR368W	MCM7	P38132	845 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MDM30	YLR368W	YBR184W	P38299	523 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MDM30	YLR368W	SIP3	P38717	1229 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MDM30	YLR368W	MNL1	P38888	796 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MDM30	YLR368W	SLN1	P39928	1220 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
MDM30	YLR368W	YTA12	P40341	825 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MDM30	YLR368W	SPO22	P40511	975 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MDM30	YLR368W	CIR1	P42940	261 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MDM30	YLR368W	DUG1	P43616	481 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
MDM30	YLR368W	AIM14	P53109	570 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MDM30	YLR368W	DIP5	P53388	608 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MDM30	YLR368W	YNL146W	P53906	100 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MDM30	YLR368W	CIK1	Q01649	594 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MDM30	YLR368W	TRS120	Q04183	1289 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MDM30	YLR368W	VBA4	Q04602	768 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
MDM30	YLR368W	IVY1	Q04934	453 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MDM30	YLR368W	SPH1	Q06160	661 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MDM30	YLR368W	SPO75	Q07798	868 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MDM30	YLR368W	YLL032C	Q07834	825 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.55	□□□□□ -1.68	not detected
MDM30	YLR368W	TLG2	Q08144	397 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MDM30	YLR368W	VPS54	Q12071	889 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MDM30	YLR368W	GNT1	Q12096	491 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MDM30	YLR368W	DAT1	P13483	248 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
MDM30	YLR368W	FUS3	P16892	353 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
MDM30	YLR368W	YPK2	P18961	677 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MDM30	YLR368W	GPI10	P30777	616 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MDM30	YLR368W	GYP6	P32806	458 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MDM30	YLR368W	ECM2	P38241	364 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68

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