RNA–Protein interactions for RNA: YKR061W

KTR2, Transcript of Mannosyltransferase involved in N-linked protein glycosylation, yeast

Gene KTR2, Length 1,278 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
KTR2	YKR061W	AXL1	P40851	1208 aa		4.73	□□□□□ -1.65
KTR2	YKR061W	VPS53	P47061	822 aa		4.73	□□□□□ -1.65
KTR2	YKR061W	GYP7	P48365	746 aa		4.73	□□□□□ -1.65
KTR2	YKR061W	ZIP2	P53061	704 aa		4.73	□□□□□ -1.65
KTR2	YKR061W	PIL1	P53252	339 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
KTR2	YKR061W	KIN4	Q01919	800 aa		4.73	□□□□□ -1.65
KTR2	YKR061W	RAT1	Q02792	1006 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
KTR2	YKR061W	EEB1	Q02891	456 aa		4.73	□□□□□ -1.65
KTR2	YKR061W	TAF11	Q04226	346 aa		4.73	□□□□□ -1.65
KTR2	YKR061W	YKU80	Q04437	629 aa		4.73	□□□□□ -1.65
KTR2	YKR061W	MRL1	Q06815	381 aa		4.73	□□□□□ -1.65
KTR2	YKR061W	PCL8	Q08966	492 aa		4.73	□□□□□ -1.65
KTR2	YKR061W	APL4	Q12028	832 aa		4.73	□□□□□ -1.65
KTR2	YKR061W	CTT1	P06115	562 aa		4.72	□□□□□ -1.65
KTR2	YKR061W	PDX1	P16451	410 aa		4.72	□□□□□ -1.65
KTR2	YKR061W	SRO9	P25567	434 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
KTR2	YKR061W	SMY1	P32364	656 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
KTR2	YKR061W	PAH1	P32567	862 aa		4.72	□□□□□ -1.65
KTR2	YKR061W	ARC19	P33204	171 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
KTR2	YKR061W	RIB7	P33312	244 aa		4.72	□□□□□ -1.65
KTR2	YKR061W	BYE1	P36106	594 aa		4.72	□□□□□ -1.65
KTR2	YKR061W	PIM1	P36775	1133 aa		4.72	□□□□□ -1.65
KTR2	YKR061W	ETP1	P38748	585 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
KTR2	YKR061W	SIT1	P39980	628 aa		4.72	□□□□□ -1.65
KTR2	YKR061W	PSY2	P40164	858 aa		4.72	□□□□□ -1.65
KTR2	YKR061W	MMM1	P41800	426 aa		4.72	□□□□□ -1.65
KTR2	YKR061W	SEC26	P41810	973 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
KTR2	YKR061W	RGD2	P43556	714 aa		4.72	□□□□□ -1.65
KTR2	YKR061W	LAM5	P43560	674 aa		4.72	□□□□□ -1.65
KTR2	YKR061W	IRC6	P43615	237 aa		4.72	□□□□□ -1.65
KTR2	YKR061W	EAR1	Q03212	550 aa		4.72	□□□□□ -1.65
KTR2	YKR061W	EIS1	Q05050	843 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
KTR2	YKR061W	DBP9	Q06218	594 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
KTR2	YKR061W	SPP382	Q06411	708 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
KTR2	YKR061W	MLH2	Q07980	695 aa		4.72	□□□□□ -1.65
KTR2	YKR061W	CLP1	Q08685	445 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
KTR2	YKR061W	YOR223W	Q12015	292 aa		4.72	□□□□□ -1.65
KTR2	YKR061W	RUD3	Q12234	484 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
KTR2	YKR061W	UTP10	P42945	1769 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
KTR2	YKR061W	YMR084W	A2P2R3	262 aa		4.71	□□□□□ -1.66
KTR2	YKR061W	MSS18	P08593	268 aa		4.71	□□□□□ -1.66
KTR2	YKR061W	HVG1	P0CE11	249 aa		4.71	□□□□□ -1.66
KTR2	YKR061W	HOM2	P13663	365 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
KTR2	YKR061W	PMS1	P14242	873 aa		4.71	□□□□□ -1.66
KTR2	YKR061W	RPB4	P20433	221 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.66
KTR2	YKR061W	RPC53	P25441	422 aa		4.71	□□□□□ -1.66
KTR2	YKR061W	VBA3	P25594	458 aa		4.71	□□□□□ -1.66
KTR2	YKR061W	MCM5	P29496	775 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
KTR2	YKR061W	NTG1	P31378	399 aa		4.71	□□□□□ -1.66
KTR2	YKR061W	ABD1	P32783	436 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.66
KTR2	YKR061W	PFF1	P38244	976 aa		4.71	□□□□□ -1.66
KTR2	YKR061W	GZF3	P42944	551 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
KTR2	YKR061W	QRI7	P43122	407 aa		4.71	□□□□□ -1.66
KTR2	YKR061W	CIT3	P43635	486 aa		4.71	□□□□□ -1.66
KTR2	YKR061W	YJR124C	P47159	448 aa		4.71	□□□□□ -1.66
KTR2	YKR061W	YNR065C	P53751	1116 aa		4.71	□□□□□ -1.66
KTR2	YKR061W	NPL3	Q01560	414 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.71	□□□□□ -1.66	not detected
KTR2	YKR061W	SRT1	Q03175	343 aa		4.71	□□□□□ -1.66
KTR2	YKR061W	FCP1	Q03254	732 aa		4.71	□□□□□ -1.66
KTR2	YKR061W	ATG38	Q05789	226 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
KTR2	YKR061W	REX3	Q12090	404 aa		4.71	□□□□□ -1.66
KTR2	YKR061W	TRP2	P00899	507 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
KTR2	YKR061W	RPP0	P05317	312 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
KTR2	YKR061W	PET123	P17558	318 aa		4.7	□□□□□ -1.66
KTR2	YKR061W	MSH3	P25336	1018 aa		4.7	□□□□□ -1.66
KTR2	YKR061W	MKK2	P32491	506 aa		4.7	□□□□□ -1.66
KTR2	YKR061W	SSE1	P32589	693 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
KTR2	YKR061W	XRS2	P33301	854 aa		4.7	□□□□□ -1.66
KTR2	YKR061W	MDL1	P33310	695 aa		4.7	□□□□□ -1.66
KTR2	YKR061W	IRS4	P36115	615 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
KTR2	YKR061W	PPE1	P38796	400 aa		4.7	□□□□□ -1.66
KTR2	YKR061W	CKB2	P38930	258 aa		4.7	□□□□□ -1.66
KTR2	YKR061W	CCC2	P38995	1004 aa		4.7	□□□□□ -1.66
KTR2	YKR061W	OAF1	P39720	1047 aa	Predicted RBP	4.7	□□□□□ -1.66
KTR2	YKR061W	FUN12	P39730	1002 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
KTR2	YKR061W	KHA1	P40309	873 aa		4.7	□□□□□ -1.66
KTR2	YKR061W	TOK1	P40310	691 aa		4.7	□□□□□ -1.66
KTR2	YKR061W	FET4	P40988	552 aa		4.7	□□□□□ -1.66
KTR2	YKR061W	ERR3	P42222	437 aa		4.7	□□□□□ -1.66
KTR2	YKR061W	CIR1	P42940	261 aa		4.7	□□□□□ -1.66
KTR2	YKR061W	CCT7	P42943	550 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
KTR2	YKR061W	AIM14	P53109	570 aa		4.7	□□□□□ -1.66
KTR2	YKR061W	SLD3	P53135	668 aa		4.7	□□□□□ -1.66
KTR2	YKR061W	MNP1	P53163	194 aa	Predicted RBP	4.7	□□□□□ -1.66
KTR2	YKR061W	SPO1	P53541	631 aa		4.7	□□□□□ -1.66
KTR2	YKR061W	ULP1	Q02724	621 aa		4.7	□□□□□ -1.66
KTR2	YKR061W	HAS1	Q03532	505 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
KTR2	YKR061W	VPS64	Q03944	604 aa		4.7	□□□□□ -1.66
KTR2	YKR061W	ARV1	Q06541	321 aa		4.7	□□□□□ -1.66
KTR2	YKR061W	YDR306C	Q06640	478 aa		4.7	□□□□□ -1.66
KTR2	YKR061W	ISA2	Q12425	185 aa		4.7	□□□□□ -1.66
KTR2	YKR061W	RRP36	Q12481	300 aa	Predicted RBP	4.7	□□□□□ -1.66
KTR2	YKR061W	DFG16	Q99234	619 aa		4.7	□□□□□ -1.66
KTR2	YKR061W	ERS1	P17261	260 aa		4.69	□□□□□ -1.66
KTR2	YKR061W	AAC3	P18238	307 aa		4.69	□□□□□ -1.66
KTR2	YKR061W	RAD53	P22216	821 aa		4.69	□□□□□ -1.66
KTR2	YKR061W	RNQ1	P25367	405 aa		4.69	□□□□□ -1.66
KTR2	YKR061W	POL4	P25615	582 aa		4.69	□□□□□ -1.66
KTR2	YKR061W	MSH1	P25846	959 aa		4.69	□□□□□ -1.66
KTR2	YKR061W	RPL5	P26321	297 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 128.2 ms