RNA–Protein interactions for RNA: YDL135C

RDI1, Transcript of Rho GDP dissociation inhibitor, yeast

Gene RDI1, Length 609 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RDI1	YDL135C	HOS4	P40480	1083 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RDI1	YDL135C	YIR042C	P40586	236 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RDI1	YDL135C	BUD8	P41698	603 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RDI1	YDL135C	RSC8	P43609	557 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RDI1	YDL135C	CTK1	Q03957	528 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RDI1	YDL135C	RGC1	Q06108	1083 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RDI1	YDL135C	ATG11	Q12527	1178 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RDI1	YDL135C	ATP4	P05626	244 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RDI1	YDL135C	MET3	P08536	511 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RDI1	YDL135C	HCM1	P25364	564 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RDI1	YDL135C	DGR2	P32330	852 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RDI1	YDL135C	MF(ALPHA)2	P32435	120 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RDI1	YDL135C	TRM2	P33753	639 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RDI1	YDL135C	NIC96	P34077	839 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RDI1	YDL135C	EAF5	P39995	279 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RDI1	YDL135C	ELO3	P40319	345 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RDI1	YDL135C	BAP3	P41815	604 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RDI1	YDL135C	MSE1	P48525	536 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RDI1	YDL135C	AMA1	P50082	593 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RDI1	YDL135C	MET14	Q02196	202 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RDI1	YDL135C	CWC2	Q12046	339 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RDI1	YDL135C	NYV1	Q12255	253 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RDI1	YDL135C	GAL1	P04385	528 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RDI1	YDL135C	ERG4	P25340	473 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RDI1	YDL135C	EFT1	P32324	842 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RDI1	YDL135C	BIT61	P47041	543 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RDI1	YDL135C	SUN4	P53616	420 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RDI1	YDL135C	NTO1	Q12311	748 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RDI1	YDL135C	ACO1	P19414	778 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.87	□□□□□ -1.63	not detected
RDI1	YDL135C	PEX1	P24004	1043 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RDI1	YDL135C	KCC4	P25389	1037 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RDI1	YDL135C	HRR25	P29295	494 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RDI1	YDL135C	FMO1	P38866	432 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RDI1	YDL135C	PXA1	P41909	870 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RDI1	YDL135C	IRC5	P43610	853 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RDI1	YDL135C	PIP2	P52960	996 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RDI1	YDL135C	VBA4	Q04602	768 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RDI1	YDL135C	AIM39	Q08223	395 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RDI1	YDL135C	REV3	P14284	1504 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RDI1	YDL135C	ERG20	P08524	352 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RDI1	YDL135C	YEF3	P16521	1044 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RDI1	YDL135C	DEF1	P35732	738 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RDI1	YDL135C	SRP68	P38687	599 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RDI1	YDL135C	BCD1	P38772	366 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RDI1	YDL135C	NUP60	P39705	539 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RDI1	YDL135C	TAF4	P50105	388 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RDI1	YDL135C	OMS1	Q06668	471 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RDI1	YDL135C	DIA2	Q08496	732 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RDI1	YDL135C	IRC13	Q08630	104 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RDI1	YDL135C	FRE5	Q08908	694 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RDI1	YDL135C	POM34	Q12445	299 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RDI1	YDL135C	BUD4	P47136	1447 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RDI1	YDL135C	PIF1	P07271	859 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RDI1	YDL135C	YEL076C-A	P0CX16	216 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RDI1	YDL135C	YLR464W	P0CX17	216 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RDI1	YDL135C	KTR4	P38131	464 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RDI1	YDL135C	YHR033W	P38690	423 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RDI1	YDL135C	YEL076C	P39971	216 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RDI1	YDL135C	YIL092W	P40497	633 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RDI1	YDL135C	YJL163C	P46996	555 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RDI1	YDL135C	UBC11	P52492	156 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RDI1	YDL135C	HOL1	P53389	586 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RDI1	YDL135C	NSE5	Q03718	556 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RDI1	YDL135C	THI22	Q06490	572 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RDI1	YDL135C	YLR040C	Q07988	224 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RDI1	YDL135C	THO2	P53552	1597 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RDI1	YDL135C	SKI3	P17883	1432 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
RDI1	YDL135C	ALG7	P07286	448 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RDI1	YDL135C	PTP2	P29461	750 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RDI1	YDL135C	PRE4	P30657	266 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RDI1	YDL135C	MVD1	P32377	396 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
RDI1	YDL135C	MTC7	P32633	139 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RDI1	YDL135C	BCS1	P32839	456 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RDI1	YDL135C	HIS7	P33734	552 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
RDI1	YDL135C	CCT3	P39077	534 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
RDI1	YDL135C	ENP2	P48234	707 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
RDI1	YDL135C	CNM67	P53865	581 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
RDI1	YDL135C	MTD1	Q02046	320 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
RDI1	YDL135C	YML122C	Q03207	126 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RDI1	YDL135C	ADY4	Q05955	493 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RDI1	YDL135C	RPS9B	P05755	195 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
RDI1	YDL135C	KIN82	P25341	720 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RDI1	YDL135C	YKL133C	P36066	463 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RDI1	YDL135C	CDS1	P38221	457 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RDI1	YDL135C	SUL1	P38359	859 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RDI1	YDL135C	HRB1	P38922	454 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.83	□□□□□ -1.64	not detected
RDI1	YDL135C	RRP8	P38961	392 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
RDI1	YDL135C	STL1	P39932	569 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RDI1	YDL135C	HIS6	P40545	261 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RDI1	YDL135C	CEG1	Q01159	459 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
RDI1	YDL135C	RNT1	Q02555	471 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RDI1	YDL135C	PPN1	Q04119	674 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RDI1	YDL135C	MLC2	Q06580	163 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RDI1	YDL135C	ATG2	P53855	1592 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RDI1	YDL135C	MDS3	P53094	1487 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RDI1	YDL135C	HOP1	P20050	605 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RDI1	YDL135C	SEC15	P22224	910 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RDI1	YDL135C	PRP22	P24384	1145 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
RDI1	YDL135C	FEN2	P25621	512 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
RDI1	YDL135C	RMA1	P36001	430 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 58.6 ms