RNA–Protein interactions for RNA: Q0140

VAR1, Transcript of Mitochondrial ribosomal protein of the small subunit, yeast

Gene VAR1, Length 1,197 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
VAR1	Q0140	SNP1	Q00916	300 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
VAR1	Q0140	YTH1	Q06102	208 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
VAR1	Q0140	RPN7	Q06103	429 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
VAR1	Q0140	CHS5	Q12114	671 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
VAR1	Q0140	LAM4	P38800	1345 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VAR1	Q0140	RAD18	P10862	487 aa		4.62	□□□□□ -1.67
VAR1	Q0140	SEC6	P32844	805 aa		4.62	□□□□□ -1.67
VAR1	Q0140	YKR018C	P36114	725 aa		4.62	□□□□□ -1.67
VAR1	Q0140	PCL10	P53124	433 aa		4.62	□□□□□ -1.67
VAR1	Q0140	ATP23	P53722	227 aa		4.62	□□□□□ -1.67
VAR1	Q0140	IRC3	Q06683	689 aa		4.62	□□□□□ -1.67
VAR1	Q0140	PRS5	Q12265	496 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
VAR1	Q0140	MDM20	Q12387	796 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
VAR1	Q0140	HSL7	P38274	827 aa		4.61	□□□□□ -1.67
VAR1	Q0140	SDS24	P38314	527 aa		4.61	□□□□□ -1.67
VAR1	Q0140	YNL195C	P40168	261 aa		4.61	□□□□□ -1.67
VAR1	Q0140	MNT3	P40549	630 aa		4.61	□□□□□ -1.67
VAR1	Q0140	MAL11	P53048	616 aa		4.61	□□□□□ -1.67
VAR1	Q0140	NMA2	P53204	395 aa		4.61	□□□□□ -1.67
VAR1	Q0140	MIH1	P23748	554 aa		4.6	□□□□□ -1.67
VAR1	Q0140	CTP1	P38152	299 aa		4.6	□□□□□ -1.67
VAR1	Q0140	MPS3	P47069	682 aa		4.6	□□□□□ -1.67
VAR1	Q0140	ERG13	P54839	491 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
VAR1	Q0140	CDC9	P04819	755 aa		4.59	□□□□□ -1.67
VAR1	Q0140	AAD3	P25612	363 aa		4.59	□□□□□ -1.67
VAR1	Q0140	APL3	P38065	1025 aa		4.59	□□□□□ -1.67
VAR1	Q0140	ARP4	P80428	489 aa		4.59	□□□□□ -1.67
VAR1	Q0140	LEE1	Q02799	301 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
VAR1	Q0140	NHX1	Q04121	633 aa		4.59	□□□□□ -1.67
VAR1	Q0140	YSH1	Q06224	779 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
VAR1	Q0140	FEN2	P25621	512 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
VAR1	Q0140	KHA1	P40309	873 aa		4.58	□□□□□ -1.68
VAR1	Q0140	PMT6	P42934	759 aa		4.58	□□□□□ -1.68
VAR1	Q0140	SET2	P46995	733 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
VAR1	Q0140	CDC53	Q12018	815 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
VAR1	Q0140	TUP1	P16649	713 aa		4.57	□□□□□ -1.68
VAR1	Q0140	APN2	P38207	520 aa		4.57	□□□□□ -1.68
VAR1	Q0140	NMD5	P46970	1048 aa		4.57	□□□□□ -1.68
VAR1	Q0140	RFX1	P48743	811 aa		4.57	□□□□□ -1.68
VAR1	Q0140	RKI1	Q12189	258 aa		4.57	□□□□□ -1.68
VAR1	Q0140	MDM12	Q92328	271 aa		4.57	□□□□□ -1.68
VAR1	Q0140	HOG1	P32485	435 aa		4.56	□□□□□ -1.68
VAR1	Q0140	YEL1	P34225	687 aa		4.56	□□□□□ -1.68
VAR1	Q0140	CHZ1	P40019	153 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
VAR1	Q0140	NSE3	Q05541	303 aa		4.56	□□□□□ -1.68
VAR1	Q0140	CIT2	P08679	460 aa		4.55	□□□□□ -1.68
VAR1	Q0140	STI1	P15705	589 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.55	□□□□□ -1.68	not detected
VAR1	Q0140	NTH1	P32356	751 aa		4.55	□□□□□ -1.68
VAR1	Q0140	PEX6	P33760	1030 aa		4.55	□□□□□ -1.68
VAR1	Q0140	JHD1	P40034	492 aa		4.55	□□□□□ -1.68
VAR1	Q0140	YDR179W-A	Q03983	463 aa		4.55	□□□□□ -1.68
VAR1	Q0140	ERR1	P0CX10	437 aa		4.54	□□□□□ -1.68
VAR1	Q0140	ERR2	P0CX11	437 aa		4.54	□□□□□ -1.68
VAR1	Q0140	GSY1	P23337	708 aa		4.54	□□□□□ -1.68
VAR1	Q0140	VBA3	P25594	458 aa		4.54	□□□□□ -1.68
VAR1	Q0140	YIL077C	P40508	320 aa		4.54	□□□□□ -1.68
VAR1	Q0140	DIP5	P53388	608 aa		4.54	□□□□□ -1.68
VAR1	Q0140	BRE5	P53741	515 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
VAR1	Q0140	NGL2	Q03264	515 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
VAR1	Q0140	POM34	Q12445	299 aa		4.54	□□□□□ -1.68
VAR1	Q0140	MSS1	P32559	526 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
VAR1	Q0140	UFO1	Q04511	668 aa		4.53	□□□□□ -1.68
VAR1	Q0140	SNF12	P53628	566 aa		4.52	□□□□□ -1.69
VAR1	Q0140	RSC9	Q03124	581 aa		4.52	□□□□□ -1.69
VAR1	Q0140	ISA1	Q07821	250 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
VAR1	Q0140	YOX1	P34161	385 aa		4.51	□□□□□ -1.69
VAR1	Q0140	MNN4	P36044	1178 aa		4.51	□□□□□ -1.69
VAR1	Q0140	COS111	P38308	924 aa		4.51	□□□□□ -1.69
VAR1	Q0140	SSZ1	P38788	538 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
VAR1	Q0140	DUN1	P39009	513 aa		4.51	□□□□□ -1.69
VAR1	Q0140	YFT2	Q06676	274 aa		4.51	□□□□□ -1.69
VAR1	Q0140	VPS36	Q06696	566 aa		4.51	□□□□□ -1.69
VAR1	Q0140	ERG20	P08524	352 aa	Known RBP	4.5	□□□□□ -1.69
VAR1	Q0140	SRD1	P09007	221 aa		4.5	□□□□□ -1.69
VAR1	Q0140	SEC15	P22224	910 aa		4.5	□□□□□ -1.69
VAR1	Q0140	TSR4	P25040	408 aa		4.5	□□□□□ -1.69
VAR1	Q0140	AKL1	P38080	1108 aa	Known RBP	4.5	□□□□□ -1.69
VAR1	Q0140	DSS1	P39112	969 aa		4.5	□□□□□ -1.69
VAR1	Q0140	DOT6	P40059	670 aa	Known RBP	4.5	□□□□□ -1.69
VAR1	Q0140	YGL117W	P53133	265 aa		4.5	□□□□□ -1.69
VAR1	Q0140	YOR131C	Q12486	218 aa		4.5	□□□□□ -1.69
VAR1	Q0140	YPT7	P32939	208 aa		4.49	□□□□□ -1.69
VAR1	Q0140	SNO3	P43544	222 aa		4.49	□□□□□ -1.69
VAR1	Q0140	NOP7	P53261	605 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
VAR1	Q0140	CPR8	P53728	308 aa		4.49	□□□□□ -1.69
VAR1	Q0140	LEU2	P04173	364 aa	Predicted RBP	4.48	□□□□□ -1.69
VAR1	Q0140	MEF1	P25039	761 aa		4.48	□□□□□ -1.69
VAR1	Q0140	ELF1	P36053	145 aa		4.48	□□□□□ -1.69
VAR1	Q0140	BIT61	P47041	543 aa		4.48	□□□□□ -1.69
VAR1	Q0140	YJR039W	P47107	1121 aa		4.48	□□□□□ -1.69
VAR1	Q0140	IZH3	Q07959	543 aa		4.48	□□□□□ -1.69
VAR1	Q0140	KIN82	P25341	720 aa		4.47	□□□□□ -1.69
VAR1	Q0140	YHR202W	P38887	602 aa		4.47	□□□□□ -1.69
VAR1	Q0140	DAK1	P54838	584 aa	Known RBP	4.47	□□□□□ -1.69
VAR1	Q0140	GPD1	Q00055	391 aa	Known RBP	4.47	□□□□□ -1.69
VAR1	Q0140	COG8	Q04632	607 aa		4.47	□□□□□ -1.69
VAR1	Q0140	VHS3	Q08438	674 aa		4.47	□□□□□ -1.69
VAR1	Q0140	PHO2	P07269	559 aa		4.46	□□□□□ -1.7
VAR1	Q0140	FRS1	P15624	595 aa	Known RBP	4.45	□□□□□ -1.7
VAR1	Q0140	PET127	P32606	800 aa		4.45	□□□□□ -1.7

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 64.6 ms