RNA–Protein interactions for RNA: YHR088W

RPF1, Transcript of Protein involved in assembly and export of the large ribosomal subunit, yeast

Gene RPF1, Length 888 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RPF1	YHR088W	FUB1	P25659	250 aa		4.19	□□□□□ -1.74
RPF1	YHR088W	GMH1	P36125	273 aa		4.19	□□□□□ -1.74
RPF1	YHR088W	NNF1	P47149	201 aa		4.19	□□□□□ -1.74
RPF1	YHR088W	GLO1	P50107	326 aa		4.19	□□□□□ -1.74
RPF1	YHR088W	YAP7	Q08182	245 aa		4.19	□□□□□ -1.74
RPF1	YHR088W	CDC53	Q12018	815 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
RPF1	YHR088W	YOR131C	Q12486	218 aa		4.19	□□□□□ -1.74
RPF1	YHR088W	HOM2	P13663	365 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
RPF1	YHR088W	PRP28	P23394	588 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RPF1	YHR088W	YKR018C	P36114	725 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RPF1	YHR088W	HSL7	P38274	827 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RPF1	YHR088W	BMS1	Q08965	1183 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
RPF1	YHR088W	MLH3	Q12083	715 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RPF1	YHR088W	MDM12	Q92328	271 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RPF1	YHR088W	RNR1	P21524	888 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
RPF1	YHR088W	LTP1	P40347	161 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RPF1	YHR088W	COG8	Q04632	607 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RPF1	YHR088W	CIT2	P08679	460 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RPF1	YHR088W	GET2	P40056	285 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RPF1	YHR088W	PIG2	P40187	538 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RPF1	YHR088W	PCL10	P53124	433 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RPF1	YHR088W	NHX1	Q04121	633 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RPF1	YHR088W	RPN7	Q06103	429 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
RPF1	YHR088W	USV1	Q12132	391 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RPF1	YHR088W	ERG6	P25087	383 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
RPF1	YHR088W	BIT2	P38346	545 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RPF1	YHR088W	NOP9	P47077	666 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
RPF1	YHR088W	MAL11	P53048	616 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RPF1	YHR088W	RIM13	Q03792	727 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RPF1	YHR088W	HOG1	P32485	435 aa		4.14	□□□□□ -1.75
RPF1	YHR088W	YGR151C	P53287	111 aa		4.14	□□□□□ -1.75
RPF1	YHR088W	THI22	Q06490	572 aa		4.14	□□□□□ -1.75
RPF1	YHR088W	OSW1	Q08692	278 aa		4.14	□□□□□ -1.75
RPF1	YHR088W	CDC9	P04819	755 aa		4.13	□□□□□ -1.75
RPF1	YHR088W	RPA135	P22138	1203 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
RPF1	YHR088W	SEC6	P32844	805 aa		4.13	□□□□□ -1.75
RPF1	YHR088W	YEL1	P34225	687 aa		4.13	□□□□□ -1.75
RPF1	YHR088W	SET3	P36124	751 aa		4.13	□□□□□ -1.75
RPF1	YHR088W	YKR051W	P36142	418 aa		4.13	□□□□□ -1.75
RPF1	YHR088W	RSC8	P43609	557 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
RPF1	YHR088W	BNA3	P47039	444 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
RPF1	YHR088W	Q0142	Q9ZZW4	58 aa		4.13	□□□□□ -1.75
RPF1	YHR088W	BCS1	P32839	456 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RPF1	YHR088W	APN2	P38207	520 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RPF1	YHR088W	SET2	P46995	733 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
RPF1	YHR088W	ORC1	P54784	914 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
RPF1	YHR088W	RPN4	Q03465	531 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RPF1	YHR088W	CHS5	Q12114	671 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
RPF1	YHR088W	PGK1	P00560	416 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
RPF1	YHR088W	PTP1	P25044	335 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RPF1	YHR088W	SAT4	P25333	603 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
RPF1	YHR088W	NTH1	P32356	751 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RPF1	YHR088W	UGP1	P32861	499 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
RPF1	YHR088W	YMC2	P38087	329 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RPF1	YHR088W	COX18	P53239	316 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RPF1	YHR088W	SPC98	P53540	846 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RPF1	YHR088W	YDL086W	Q07505	273 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RPF1	YHR088W	YOL098C	Q12496	1037 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RPF1	YHR088W	ADE5,7	P07244	802 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
RPF1	YHR088W	MIH1	P23748	554 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RPF1	YHR088W	APL3	P38065	1025 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RPF1	YHR088W	CTP1	P38152	299 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RPF1	YHR088W	UGO1	Q03327	502 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RPF1	YHR088W	YSH1	Q06224	779 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
RPF1	YHR088W	SRD1	P09007	221 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RPF1	YHR088W	ERR1	P0CX10	437 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RPF1	YHR088W	ERR2	P0CX11	437 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RPF1	YHR088W	RAD18	P10862	487 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RPF1	YHR088W	KSP1	P38691	1029 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
RPF1	YHR088W	DOT6	P40059	670 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
RPF1	YHR088W	RGC1	Q06108	1083 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
RPF1	YHR088W	YLR125W	Q12138	136 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RPF1	YHR088W	ERG20	P08524	352 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
RPF1	YHR088W	VBA3	P25594	458 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RPF1	YHR088W	SRP40	P32583	406 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
RPF1	YHR088W	SSZ1	P38788	538 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
RPF1	YHR088W	DSS1	P39112	969 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RPF1	YHR088W	ATG36	P46983	293 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RPF1	YHR088W	NET1	P47035	1189 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RPF1	YHR088W	MPS3	P47069	682 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RPF1	YHR088W	GPD1	Q00055	391 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
RPF1	YHR088W	POM34	Q12445	299 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RPF1	YHR088W	ECM3	Q99252	613 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RPF1	YHR088W	ERG11	P10614	530 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RPF1	YHR088W	FEN2	P25621	512 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
RPF1	YHR088W	PMC1	P38929	1173 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
RPF1	YHR088W	YJR039W	P47107	1121 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RPF1	YHR088W	ARP4	P80428	489 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RPF1	YHR088W	FMP30	Q02883	468 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RPF1	YHR088W	PHO5	P00635	467 aa		4.06	□□□□□ -1.76
RPF1	YHR088W	SEC15	P22224	910 aa		4.06	□□□□□ -1.76
RPF1	YHR088W	KIN82	P25341	720 aa		4.06	□□□□□ -1.76
RPF1	YHR088W	MSH2	P25847	964 aa		4.06	□□□□□ -1.76
RPF1	YHR088W	MIT1	P40002	666 aa		4.06	□□□□□ -1.76
RPF1	YHR088W	KHA1	P40309	873 aa		4.06	□□□□□ -1.76
RPF1	YHR088W	GAT1	P43574	510 aa		4.06	□□□□□ -1.76
RPF1	YHR088W	NGL2	Q03264	515 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
RPF1	YHR088W	ULA1	Q12059	462 aa		4.06	□□□□□ -1.76
RPF1	YHR088W	RKI1	Q12189	258 aa		4.06	□□□□□ -1.76
RPF1	YHR088W	MDM20	Q12387	796 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76

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