RNA–Protein interactions for RNA: YHR065C

RRP3, Transcript of Protein involved in rRNA processing, yeast

Gene RRP3, Length 1,506 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RRP3	YHR065C	DUS3	Q06053	668 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
RRP3	YHR065C	COG4	Q06096	861 aa		5.2	□□□□□ -1.58
RRP3	YHR065C	CDC60	P26637	1090 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
RRP3	YHR065C	PSO2	P30620	661 aa		5.19	□□□□□ -1.58
RRP3	YHR065C	EUG1	P32474	517 aa		5.19	□□□□□ -1.58
RRP3	YHR065C	YKL091C	P33324	310 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
RRP3	YHR065C	YET1	P35723	206 aa		5.19	□□□□□ -1.58
RRP3	YHR065C	UBP11	P36026	717 aa		5.19	□□□□□ -1.58
RRP3	YHR065C	PXL1	P36166	706 aa		5.19	□□□□□ -1.58
RRP3	YHR065C	PIH1	P38768	344 aa		5.19	□□□□□ -1.58
RRP3	YHR065C	CTM1	P38818	585 aa		5.19	□□□□□ -1.58
RRP3	YHR065C	HMF1	P40037	129 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
RRP3	YHR065C	FIS1	P40515	155 aa		5.19	□□□□□ -1.58
RRP3	YHR065C	FYV8	P46949	817 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
RRP3	YHR065C	HUL5	P53119	910 aa		5.19	□□□□□ -1.58
RRP3	YHR065C	ZPR1	P53303	486 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
RRP3	YHR065C	DIP5	P53388	608 aa		5.19	□□□□□ -1.58
RRP3	YHR065C	TCO89	Q08921	799 aa		5.19	□□□□□ -1.58
RRP3	YHR065C	TY3A-G	Q12173	290 aa		5.19	□□□□□ -1.58
RRP3	YHR065C	RKM4	Q12504	494 aa		5.19	□□□□□ -1.58
RRP3	YHR065C	TY3A-I	Q99219	290 aa		5.19	□□□□□ -1.58
RRP3	YHR065C	SPO11	P23179	398 aa		5.18	□□□□□ -1.58
RRP3	YHR065C	TKL1	P23254	680 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
RRP3	YHR065C	MSH3	P25336	1018 aa		5.18	□□□□□ -1.58
RRP3	YHR065C	SHP1	P34223	423 aa		5.18	□□□□□ -1.58
RRP3	YHR065C	KAE1	P36132	386 aa		5.18	□□□□□ -1.58
RRP3	YHR065C	OMA1	P36163	345 aa		5.18	□□□□□ -1.58
RRP3	YHR065C	PPS1	P38148	807 aa		5.18	□□□□□ -1.58
RRP3	YHR065C	HUL4	P40985	892 aa		5.18	□□□□□ -1.58
RRP3	YHR065C	STU2	P46675	888 aa		5.18	□□□□□ -1.58
RRP3	YHR065C	INP52	P50942	1183 aa		5.18	□□□□□ -1.58
RRP3	YHR065C	VID30	P53076	958 aa		5.18	□□□□□ -1.58
RRP3	YHR065C	SPO71	Q03868	1245 aa		5.18	□□□□□ -1.58
RRP3	YHR065C	ESC2	Q06340	456 aa		5.18	□□□□□ -1.58
RRP3	YHR065C	CUR1	Q06469	252 aa		5.18	□□□□□ -1.58
RRP3	YHR065C	YAP7	Q08182	245 aa		5.18	□□□□□ -1.58
RRP3	YHR065C	MED1	Q12321	566 aa		5.18	□□□□□ -1.58
RRP3	YHR065C	PCK1	P10963	549 aa		5.18	□□□□□ -1.58
RRP3	YHR065C	TCP1	P12612	559 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
RRP3	YHR065C	APE3	P37302	537 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
RRP3	YHR065C	EFM2	P38347	419 aa		5.18	□□□□□ -1.58
RRP3	YHR065C	SAF1	P38352	637 aa		5.18	□□□□□ -1.58
RRP3	YHR065C	MIP6	P38760	659 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
RRP3	YHR065C	RPN3	P40016	523 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
RRP3	YHR065C	CTR9	P89105	1077 aa		5.18	□□□□□ -1.58
RRP3	YHR065C	YCG1	Q06680	1035 aa		5.18	□□□□□ -1.58
RRP3	YHR065C	CRD1	Q07560	283 aa		5.18	□□□□□ -1.58
RRP3	YHR065C	YPL277C	Q08989	487 aa		5.18	□□□□□ -1.58
RRP3	YHR065C	YLR122C	Q12312	125 aa		5.18	□□□□□ -1.58
RRP3	YHR065C	ERP3	Q12403	225 aa		5.18	□□□□□ -1.58
RRP3	YHR065C	RPC53	P25441	422 aa		5.17	□□□□□ -1.58
RRP3	YHR065C	SEC65	P29478	273 aa		5.17	□□□□□ -1.58
RRP3	YHR065C	MAE1	P36013	669 aa	Known RBP	5.17	□□□□□ -1.58
RRP3	YHR065C	TVP38	P36164	337 aa		5.17	□□□□□ -1.58
RRP3	YHR065C	UBP13	P38187	747 aa		5.17	□□□□□ -1.58
RRP3	YHR065C	REG2	P38232	338 aa		5.17	□□□□□ -1.58
RRP3	YHR065C	SPT8	P38915	602 aa		5.17	□□□□□ -1.58
RRP3	YHR065C	TOS3	P43637	560 aa		5.17	□□□□□ -1.58
RRP3	YHR065C	YJR124C	P47159	448 aa		5.17	□□□□□ -1.58
RRP3	YHR065C	YNR065C	P53751	1116 aa		5.17	□□□□□ -1.58
RRP3	YHR065C	YDL057W	Q07379	328 aa		5.17	□□□□□ -1.58
RRP3	YHR065C	YOL075C	Q08234	1294 aa		5.17	□□□□□ -1.58
RRP3	YHR065C	PLP2	Q12017	286 aa		5.17	□□□□□ -1.58
RRP3	YHR065C	REC8	Q12188	680 aa		5.17	□□□□□ -1.58
RRP3	YHR065C	GLO4	Q12320	285 aa		5.17	□□□□□ -1.58
RRP3	YHR065C	APL1	P27351	700 aa		5.16	□□□□□ -1.58
RRP3	YHR065C	PYC2	P32327	1180 aa	Known RBP	5.16	□□□□□ -1.58
RRP3	YHR065C	TFC4	P33339	1025 aa		5.16	□□□□□ -1.58
RRP3	YHR065C	MOT2	P34909	587 aa	Known RBP	5.16	□□□□□ -1.58
RRP3	YHR065C	MNN4	P36044	1178 aa		5.16	□□□□□ -1.58
RRP3	YHR065C	MXR1	P40029	184 aa		5.16	□□□□□ -1.58
RRP3	YHR065C	ULP2	P40537	1034 aa	Predicted RBP	5.16	□□□□□ -1.58
RRP3	YHR065C	CTR1	P49573	406 aa		5.16	□□□□□ -1.58
RRP3	YHR065C	NBP1	P52919	319 aa	Predicted RBP	5.16	□□□□□ -1.58
RRP3	YHR065C	MDR1	P53258	950 aa		5.16	□□□□□ -1.58
RRP3	YHR065C	ALF1	P53904	254 aa		5.16	□□□□□ -1.58
RRP3	YHR065C	NCS2	P53923	493 aa	Predicted RBP	5.16	□□□□□ -1.58
RRP3	YHR065C	SLD5	Q03406	294 aa		5.16	□□□□□ -1.58
RRP3	YHR065C	YLR287C	Q05881	355 aa		5.16	□□□□□ -1.58
RRP3	YHR065C	DUS4	Q06063	367 aa		5.16	□□□□□ -1.58
RRP3	YHR065C	MED7	Q08278	222 aa		5.16	□□□□□ -1.58
RRP3	YHR065C	YPL216W	Q08964	1102 aa		5.16	□□□□□ -1.58
RRP3	YHR065C	HMI1	Q12039	706 aa		5.16	□□□□□ -1.58
RRP3	YHR065C	SSB1	P11484	613 aa	Known RBP	5.15	□□□□□ -1.58
RRP3	YHR065C	PHO8	P11491	566 aa		5.15	□□□□□ -1.58
RRP3	YHR065C	CHS2	P14180	963 aa		5.15	□□□□□ -1.58
RRP3	YHR065C	YSC83	P32792	385 aa		5.15	□□□□□ -1.58
RRP3	YHR065C	RGT1	P32862	1170 aa		5.15	□□□□□ -1.58
RRP3	YHR065C	TIM23	P32897	222 aa		5.15	□□□□□ -1.58
RRP3	YHR065C	VPS35	P34110	944 aa		5.15	□□□□□ -1.58
RRP3	YHR065C	ATG19	P35193	415 aa		5.15	□□□□□ -1.58
RRP3	YHR065C	DBP7	P36120	742 aa	Known RBP	5.15	□□□□□ -1.58
RRP3	YHR065C	VFA1	P40080	203 aa		5.15	□□□□□ -1.58
RRP3	YHR065C	SSB2	P40150	613 aa	Known RBP	5.15	□□□□□ -1.58
RRP3	YHR065C	QDR1	P40475	563 aa		5.15	□□□□□ -1.58
RRP3	YHR065C	NEO1	P40527	1151 aa		5.15	□□□□□ -1.58
RRP3	YHR065C	VPS53	P47061	822 aa		5.15	□□□□□ -1.58
RRP3	YHR065C	HFM1	P51979	1187 aa		5.15	□□□□□ -1.58
RRP3	YHR065C	YGL039W	P53183	348 aa	Known RBP	5.15	□□□□□ -1.58
RRP3	YHR065C	CAF130	P53280	1122 aa	Predicted RBP	5.15	□□□□□ -1.58

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