RNA–Protein interactions for RNA: YLL056C

YLL056C, Transcript of Putative protein of unknown function, yeastyeast

Gene YLL056C, Length 897 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YLL056CYLL056C MSC7P38694 644 aa7.27□□□□□ -1.25
YLL056CYLL056C YAP5P40574 245 aa7.27□□□□□ -1.25
YLL056CYLL056C CLA4P48562 842 aa7.27□□□□□ -1.25
YLL056CYLL056C YCG1Q06680 1035 aa7.27□□□□□ -1.25
YLL056CYLL056C IWR1Q07532 353 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
YLL056CYLL056C NEW1Q08972 1196 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
YLL056CYLL056C HMI1Q12039 706 aa7.27□□□□□ -1.25
YLL056CYLL056C YDL206WQ12424 762 aa7.27□□□□□ -1.25
YLL056CYLL056C ZPS1Q12512 249 aa7.27□□□□□ -1.25
YLL056CYLL056C TOM70P07213 617 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
YLL056CYLL056C ASP3-2P0CX77 362 aa7.26□□□□□ -1.25
YLL056CYLL056C ASP3-3P0CX78 362 aa7.26□□□□□ -1.25
YLL056CYLL056C ASP3-4P0CX79 362 aa7.26□□□□□ -1.25
YLL056CYLL056C ASP3-1P0CZ17 362 aa7.26□□□□□ -1.25
YLL056CYLL056C SPT5P27692 1063 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
YLL056CYLL056C NIP100P33420 868 aa7.26□□□□□ -1.25
YLL056CYLL056C MRPL7P36519 292 aa7.26□□□□□ -1.25
YLL056CYLL056C YHR054CP38780 354 aa7.26□□□□□ -1.25
YLL056CYLL056C YER186CP40101 306 aa7.26□□□□□ -1.25
YLL056CYLL056C ESL1P40456 1118 aa7.26□□□□□ -1.25
YLL056CYLL056C STR2P47164 639 aa7.26□□□□□ -1.25
YLL056CYLL056C ALG11P53954 548 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
YLL056CYLL056C CTR9P89105 1077 aa7.26□□□□□ -1.25
YLL056CYLL056C STE20Q03497 939 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
YLL056CYLL056C MAG2Q06436 670 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
YLL056CYLL056C OPY2Q06810 360 aa7.26□□□□□ -1.25
YLL056CYLL056C TSR1Q07381 788 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
YLL056CYLL056C SDH5Q08230 162 aa7.26□□□□□ -1.25
YLL056CYLL056C ATG9Q12142 997 aa7.26□□□□□ -1.25
YLL056CYLL056C RRP6Q12149 733 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
YLL056CYLL056C PUS1Q12211 544 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
YLL056CYLL056C SNF1P06782 633 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
YLL056CYLL056C COX11P19516 300 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
YLL056CYLL056C PRR1P28708 518 aa7.25□□□□□ -1.25
YLL056CYLL056C CYS3P31373 394 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
YLL056CYLL056C RAD54P32863 898 aa7.25□□□□□ -1.25
YLL056CYLL056C SMC1P32908 1225 aa7.25□□□□□ -1.25
YLL056CYLL056C BUD16P39988 312 aa7.25□□□□□ -1.25
YLL056CYLL056C KAP123P40069 1113 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
YLL056CYLL056C HXT8P40886 569 aa7.25□□□□□ -1.25
YLL056CYLL056C ULI1P43604 169 aa7.25□□□□□ -1.25
YLL056CYLL056C NOP13P53883 403 aaKnown RBP RIP-Chip data7.25□□□□□ -1.25not detected
YLL056CYLL056C ALF1P53904 254 aa7.25□□□□□ -1.25
YLL056CYLL056C YNL115CP53925 644 aa7.25□□□□□ -1.25
YLL056CYLL056C TBF1Q02457 562 aa7.25□□□□□ -1.25
YLL056CYLL056C EAR1Q03212 550 aa7.25□□□□□ -1.25
YLL056CYLL056C CWC21Q03375 135 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
YLL056CYLL056C UTP5Q04177 643 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
YLL056CYLL056C RGA2Q06407 1009 aa7.25□□□□□ -1.25
YLL056CYLL056C DNL4Q08387 944 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
YLL056CYLL056C SLX4Q12098 748 aa7.25□□□□□ -1.25
YLL056CYLL056C OSH2Q12451 1283 aa7.25□□□□□ -1.25
YLL056CYLL056C UBR2Q07963 1872 aa7.25□□□□□ -1.25
YLL056CYLL056C CDC42P19073 191 aa7.24□□□□□ -1.25
YLL056CYLL056C SCJ1P25303 377 aa7.24□□□□□ -1.25
YLL056CYLL056C RSA4P25382 515 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
YLL056CYLL056C XRS2P33301 854 aa7.24□□□□□ -1.25
YLL056CYLL056C KDX1P36005 433 aa7.24□□□□□ -1.25
YLL056CYLL056C SLX1P38324 304 aa7.24□□□□□ -1.25
YLL056CYLL056C RTT107P38850 1070 aa7.24□□□□□ -1.25
YLL056CYLL056C CPR7P47103 393 aa7.24□□□□□ -1.25
YLL056CYLL056C UBP3Q01477 912 aaKnown RBP RIP-Chip data7.24□□□□□ -1.25 RIP-Chip
YLL056CYLL056C UME1Q03010 460 aa7.24□□□□□ -1.25
YLL056CYLL056C ADE4P04046 510 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
YLL056CYLL056C PPR1P07272 904 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
YLL056CYLL056C MSD1P15179 658 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
YLL056CYLL056C JHD1P40034 492 aa7.23□□□□□ -1.25
YLL056CYLL056C ERG5P54781 538 aa7.23□□□□□ -1.25
YLL056CYLL056C PPM1Q04081 328 aa7.23□□□□□ -1.25
YLL056CYLL056C VPS38Q05919 439 aa7.23□□□□□ -1.25
YLL056CYLL056C YLR455WQ06188 304 aa7.23□□□□□ -1.25
YLL056CYLL056C YOR022CQ12204 715 aa7.23□□□□□ -1.25
YLL056CYLL056C RPS3P05750 240 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
YLL056CYLL056C CDC33P07260 213 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
YLL056CYLL056C RPL4AP10664 362 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
YLL056CYLL056C TUP1P16649 713 aa7.22□□□□□ -1.25
YLL056CYLL056C IME1P21190 360 aa7.22□□□□□ -1.25
YLL056CYLL056C PDC6P26263 563 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
YLL056CYLL056C SEC21P32074 935 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
YLL056CYLL056C CSE2P33308 149 aa7.22□□□□□ -1.25
YLL056CYLL056C CSG2P35206 410 aa7.22□□□□□ -1.25
YLL056CYLL056C KIC1P38692 1080 aa7.22□□□□□ -1.25
YLL056CYLL056C SAH1P39954 449 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
YLL056CYLL056C SHQ1P40486 507 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
YLL056CYLL056C RSC8P43609 557 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
YLL056CYLL056C VPS70P47161 811 aa7.22□□□□□ -1.25
YLL056CYLL056C RPL4BP49626 362 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
YLL056CYLL056C TIF35Q04067 274 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
YLL056CYLL056C YML082WQ04533 649 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
YLL056CYLL056C ABP140Q08641 628 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
YLL056CYLL056C CTF3Q12748 733 aa7.22□□□□□ -1.25
YLL056CYLL056C AI5_BETAQ9ZZX0 354 aa7.22□□□□□ -1.25
YLL056CYLL056C YPR117WQ06116 2489 aa7.21□□□□□ -1.25
YLL056CYLL056C GAL10P04397 699 aa7.21□□□□□ -1.26
YLL056CYLL056C SEC23P15303 768 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
YLL056CYLL056C SPO12P17123 173 aa7.21□□□□□ -1.26
YLL056CYLL056C VPS3P23643 1011 aa7.21□□□□□ -1.26
YLL056CYLL056C YKR023WP36119 530 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
YLL056CYLL056C JNM1P36224 373 aa7.21□□□□□ -1.26
YLL056CYLL056C PTC4P38089 393 aa7.21□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 35.2 ms