RNA–Protein interactions for RNA: YPL119C

DBP1, Transcript of Putative ATP-dependent RNA helicase of the DEAD-box protein family, yeast

Gene DBP1, Length 1,854 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
DBP1	YPL119C	KAP114	P53067	1004 aa		10.27	□□□□□ -0.76
DBP1	YPL119C	TAM41	P53230	385 aa		10.27	□□□□□ -0.76
DBP1	YPL119C	SLD5	Q03406	294 aa		10.27	□□□□□ -0.76
DBP1	YPL119C	URH1	Q04179	340 aa		10.27	□□□□□ -0.76
DBP1	YPL119C	ERP3	Q12403	225 aa		10.27	□□□□□ -0.76
DBP1	YPL119C	SSA1	P10591	642 aa	Known RBP	10.27	□□□□□ -0.77
DBP1	YPL119C	MUD1	P32605	298 aa	Known RBP	10.27	□□□□□ -0.77
DBP1	YPL119C	YKL050C	P35736	922 aa		10.27	□□□□□ -0.77
DBP1	YPL119C	MAD1	P40957	749 aa		10.27	□□□□□ -0.77
DBP1	YPL119C	MIC19	P43594	170 aa		10.27	□□□□□ -0.77
DBP1	YPL119C	YGR021W	P53212	290 aa		10.27	□□□□□ -0.77
DBP1	YPL119C	GYL1	Q04322	720 aa		10.27	□□□□□ -0.77
DBP1	YPL119C	SMC5	Q08204	1093 aa		10.27	□□□□□ -0.77
DBP1	YPL119C	ZRT2	Q12436	422 aa		10.27	□□□□□ -0.77
DBP1	YPL119C	RMP1	Q12530	201 aa		10.27	□□□□□ -0.77
DBP1	YPL119C	NUR1	Q12066	484 aa		10.26	□□□□□ -0.77
DBP1	YPL119C	YDR461C-A	Q2V2P7	80 aa		10.26	□□□□□ -0.77
DBP1	YPL119C	CDC8	P00572	216 aa		10.25	□□□□□ -0.77
DBP1	YPL119C	CBF2	P32504	956 aa		10.25	□□□□□ -0.77
DBP1	YPL119C	RAD54	P32863	898 aa		10.25	□□□□□ -0.77
DBP1	YPL119C	GPB2	P39717	880 aa		10.25	□□□□□ -0.77
DBP1	YPL119C	MVP1	P40959	511 aa	Known RBP	10.25	□□□□□ -0.77
DBP1	YPL119C	SGM1	P47166	707 aa		10.25	□□□□□ -0.77
DBP1	YPL119C	RRT6	P53117	311 aa	Predicted RBP	10.25	□□□□□ -0.77
DBP1	YPL119C	CEF1	Q03654	590 aa	Predicted RBP	10.25	□□□□□ -0.77
DBP1	YPL119C	DON1	Q05610	365 aa		10.25	□□□□□ -0.77
DBP1	YPL119C	CDC19	P00549	500 aa	Known RBP	10.25	□□□□□ -0.77
DBP1	YPL119C	COT1	P32798	439 aa		10.25	□□□□□ -0.77
DBP1	YPL119C	VPS35	P34110	944 aa		10.25	□□□□□ -0.77
DBP1	YPL119C	TVP38	P36164	337 aa		10.25	□□□□□ -0.77
DBP1	YPL119C	JJJ1	P53863	590 aa		10.25	□□□□□ -0.77
DBP1	YPL119C	ESBP6	P53918	673 aa		10.25	□□□□□ -0.77
DBP1	YPL119C	VTI1	Q04338	217 aa		10.25	□□□□□ -0.77
DBP1	YPL119C	CFT2	Q12102	859 aa	Predicted RBP	10.25	□□□□□ -0.77
DBP1	YPL119C	ECM32	P32644	1121 aa	Known RBP	10.24	□□□□□ -0.77
DBP1	YPL119C	PIN4	P34217	668 aa	Known RBP RIP-Chip data	10.24	□□□□□ -0.77	not detected
DBP1	YPL119C	TRZ1	P36159	838 aa	Predicted RBP	10.24	□□□□□ -0.77
DBP1	YPL119C	EXO5	P38289	585 aa		10.24	□□□□□ -0.77
DBP1	YPL119C	NET1	P47035	1189 aa		10.24	□□□□□ -0.77
DBP1	YPL119C	YGR125W	P53273	1036 aa		10.24	□□□□□ -0.77
DBP1	YPL119C	DUS4	Q06063	367 aa		10.24	□□□□□ -0.77
DBP1	YPL119C	NOP6	Q07623	225 aa	Known RBP	10.24	□□□□□ -0.77
DBP1	YPL119C	GPI13	Q07830	1017 aa		10.24	□□□□□ -0.77
DBP1	YPL119C	DED1	P06634	604 aa	Known RBP	10.23	□□□□□ -0.77
DBP1	YPL119C	KIP1	P28742	1111 aa		10.23	□□□□□ -0.77
DBP1	YPL119C	CDC11	P32458	415 aa		10.23	□□□□□ -0.77
DBP1	YPL119C	IXR1	P33417	597 aa		10.23	□□□□□ -0.77
DBP1	YPL119C	HMF1	P40037	129 aa	Known RBP	10.23	□□□□□ -0.77
DBP1	YPL119C	RPC17	P47076	161 aa		10.23	□□□□□ -0.77
DBP1	YPL119C	HSH155	P49955	971 aa	Known RBP	10.23	□□□□□ -0.77
DBP1	YPL119C	RTT102	P53330	157 aa		10.23	□□□□□ -0.77
DBP1	YPL119C	YMR018W	Q04364	514 aa		10.23	□□□□□ -0.77
DBP1	YPL119C	YDL206W	Q12424	762 aa		10.23	□□□□□ -0.77
DBP1	YPL119C	RAD1	P06777	1100 aa		10.23	□□□□□ -0.77
DBP1	YPL119C	CDC33	P07260	213 aa	Known RBP	10.23	□□□□□ -0.77
DBP1	YPL119C	EUG1	P32474	517 aa		10.23	□□□□□ -0.77
DBP1	YPL119C	NFU1	P32860	256 aa		10.23	□□□□□ -0.77
DBP1	YPL119C	PTC4	P38089	393 aa		10.23	□□□□□ -0.77
DBP1	YPL119C	VPS29	P38759	282 aa		10.23	□□□□□ -0.77
DBP1	YPL119C	YAF9	P53930	226 aa		10.23	□□□□□ -0.77
DBP1	YPL119C	TBF1	Q02457	562 aa		10.23	□□□□□ -0.77
DBP1	YPL119C	VTC3	Q02725	835 aa		10.23	□□□□□ -0.77
DBP1	YPL119C	ROD1	Q02805	837 aa		10.23	□□□□□ -0.77
DBP1	YPL119C	SYH1	Q02875	849 aa	Known RBP	10.23	□□□□□ -0.77
DBP1	YPL119C	APL5	Q08951	932 aa	Known RBP	10.23	□□□□□ -0.77
DBP1	YPL119C	RRN6	P32786	894 aa		10.22	□□□□□ -0.77
DBP1	YPL119C	BLI1	P35727	113 aa		10.22	□□□□□ -0.77
DBP1	YPL119C	MUD2	P36084	527 aa	Known RBP	10.22	□□□□□ -0.77
DBP1	YPL119C	OLA1	P38219	394 aa	Known RBP	10.22	□□□□□ -0.77
DBP1	YPL119C	CLA4	P48562	842 aa		10.22	□□□□□ -0.77
DBP1	YPL119C	RGA2	Q06407	1009 aa		10.22	□□□□□ -0.77
DBP1	YPL119C	SNF1	P06782	633 aa	Known RBP	10.21	□□□□□ -0.77
DBP1	YPL119C	EAF5	P39995	279 aa		10.21	□□□□□ -0.77
DBP1	YPL119C	PSY2	P40164	858 aa		10.21	□□□□□ -0.77
DBP1	YPL119C	IES4	Q08561	116 aa		10.21	□□□□□ -0.77
DBP1	YPL119C	CDC53	Q12018	815 aa	Known RBP	10.21	□□□□□ -0.77
DBP1	YPL119C	OSW2	Q12202	724 aa		10.21	□□□□□ -0.77
DBP1	YPL119C	RUD3	Q12234	484 aa	Known RBP	10.21	□□□□□ -0.77
DBP1	YPL119C	IME1	P21190	360 aa		10.21	□□□□□ -0.78
DBP1	YPL119C	PKC1	P24583	1151 aa		10.21	□□□□□ -0.78
DBP1	YPL119C	DAL2	P25335	343 aa		10.21	□□□□□ -0.78
DBP1	YPL119C	GCG1	P32656	232 aa	Known RBP	10.21	□□□□□ -0.78
DBP1	YPL119C	BCH2	P36122	765 aa		10.21	□□□□□ -0.78
DBP1	YPL119C	VPS41	P38959	992 aa		10.21	□□□□□ -0.78
DBP1	YPL119C	KAP123	P40069	1113 aa	Known RBP	10.21	□□□□□ -0.78
DBP1	YPL119C	YIL089W	P40500	205 aa		10.21	□□□□□ -0.78
DBP1	YPL119C	CTK3	P46963	296 aa	Predicted RBP	10.21	□□□□□ -0.78
DBP1	YPL119C	RPS7B	P48164	190 aa	Known RBP	10.21	□□□□□ -0.78
DBP1	YPL119C	BRO1	P48582	844 aa		10.21	□□□□□ -0.78
DBP1	YPL119C	TPO2	P53283	614 aa		10.21	□□□□□ -0.78
DBP1	YPL119C	YDR090C	Q03193	310 aa		10.21	□□□□□ -0.78
DBP1	YPL119C	COQ9	Q05779	260 aa		10.21	□□□□□ -0.78
DBP1	YPL119C	ECI1	Q05871	280 aa		10.21	□□□□□ -0.78
DBP1	YPL119C	SPO21	Q12411	609 aa		10.21	□□□□□ -0.78
DBP1	YPL119C	SEC8	P32855	1065 aa		10.2	□□□□□ -0.78
DBP1	YPL119C	LAS1	P36146	502 aa	Predicted RBP	10.2	□□□□□ -0.78
DBP1	YPL119C	PCS60	P38137	543 aa	Known RBP RIP-Chip data	10.2	□□□□□ -0.78	not detected
DBP1	YPL119C	RGD1	P38339	666 aa		10.2	□□□□□ -0.78
DBP1	YPL119C	HIS2	P38635	335 aa		10.2	□□□□□ -0.78
DBP1	YPL119C	YEL025C	P39991	1188 aa		10.2	□□□□□ -0.78

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