RNA–Protein interactions for RNA: YGL017W

ATE1, Transcript of Arginyl-tRNA-protein transferase, yeast

Gene ATE1, Length 1,512 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ATE1	YGL017W	ERP4	Q12450	207 aa		5.8	□□□□□ -1.48
ATE1	YGL017W	OSH2	Q12451	1283 aa		5.8	□□□□□ -1.48
ATE1	YGL017W	CDC19	P00549	500 aa	Known RBP	5.79	□□□□□ -1.48
ATE1	YGL017W	RPP2B	P02400	110 aa	Known RBP	5.79	□□□□□ -1.48
ATE1	YGL017W	PIF1	P07271	859 aa		5.79	□□□□□ -1.48
ATE1	YGL017W	ARD1	P07347	238 aa	Predicted RBP	5.79	□□□□□ -1.48
ATE1	YGL017W	CAF20	P12962	161 aa	Known RBP	5.79	□□□□□ -1.48
ATE1	YGL017W	RGP1	P16664	663 aa		5.79	□□□□□ -1.48
ATE1	YGL017W	SEC6	P32844	805 aa		5.79	□□□□□ -1.48
ATE1	YGL017W	STE5	P32917	917 aa		5.79	□□□□□ -1.48
ATE1	YGL017W	SPT8	P38915	602 aa		5.79	□□□□□ -1.48
ATE1	YGL017W	PMC1	P38929	1173 aa	Predicted RBP	5.79	□□□□□ -1.48
ATE1	YGL017W	RIO2	P40160	425 aa	Known RBP	5.79	□□□□□ -1.48
ATE1	YGL017W	BFA1	P47113	574 aa		5.79	□□□□□ -1.48
ATE1	YGL017W	PSR1	Q07800	427 aa		5.79	□□□□□ -1.48
ATE1	YGL017W	TMA16	Q08687	178 aa		5.79	□□□□□ -1.48
ATE1	YGL017W	YPL225W	Q08971	146 aa	Known RBP	5.79	□□□□□ -1.48
ATE1	YGL017W	WHI5	Q12416	295 aa		5.79	□□□□□ -1.48
ATE1	YGL017W	RET1	P22276	1149 aa	Known RBP	5.79	□□□□□ -1.48
ATE1	YGL017W	MCM4	P30665	933 aa	Known RBP	5.79	□□□□□ -1.48
ATE1	YGL017W	MGM1	P32266	881 aa		5.79	□□□□□ -1.48
ATE1	YGL017W	IMP2'	P32351	346 aa		5.79	□□□□□ -1.48
ATE1	YGL017W	NGR1	P32831	672 aa	Known RBP	5.79	□□□□□ -1.48
ATE1	YGL017W	PXL1	P36166	706 aa		5.79	□□□□□ -1.48
ATE1	YGL017W	VPS8	P39702	1274 aa		5.79	□□□□□ -1.48
ATE1	YGL017W	HUL4	P40985	892 aa		5.79	□□□□□ -1.48
ATE1	YGL017W	OCA1	P50946	238 aa	Predicted RBP	5.79	□□□□□ -1.48
ATE1	YGL017W	DSL1	P53847	754 aa		5.79	□□□□□ -1.48
ATE1	YGL017W	SQS1	P53866	767 aa	Known RBP	5.79	□□□□□ -1.48
ATE1	YGL017W	NUT2	Q06213	157 aa		5.79	□□□□□ -1.48
ATE1	YGL017W	THI3	Q07471	609 aa		5.79	□□□□□ -1.48
ATE1	YGL017W	YOL098C	Q12496	1037 aa		5.79	□□□□□ -1.48
ATE1	YGL017W	BRR1	Q99177	341 aa	Predicted RBP	5.79	□□□□□ -1.48
ATE1	YGL017W	FRT1	Q99332	602 aa		5.79	□□□□□ -1.48
ATE1	YGL017W	POM152	P39685	1337 aa		5.78	□□□□□ -1.48
ATE1	YGL017W	FIG2	P25653	1609 aa		5.78	□□□□□ -1.48
ATE1	YGL017W	CDC31	P06704	161 aa	Known RBP	5.78	□□□□□ -1.48
ATE1	YGL017W	SEC23	P15303	768 aa	Known RBP	5.78	□□□□□ -1.48
ATE1	YGL017W	CBP3	P21560	335 aa		5.78	□□□□□ -1.48
ATE1	YGL017W	DAL1	P32375	460 aa		5.78	□□□□□ -1.48
ATE1	YGL017W	SAC6	P32599	642 aa	Known RBP	5.78	□□□□□ -1.48
ATE1	YGL017W	ARC19	P33204	171 aa	Known RBP	5.78	□□□□□ -1.48
ATE1	YGL017W	CNS1	P33313	385 aa		5.78	□□□□□ -1.48
ATE1	YGL017W	BOI1	P38041	980 aa	Known RBP	5.78	□□□□□ -1.48
ATE1	YGL017W	EFM2	P38347	419 aa		5.78	□□□□□ -1.48
ATE1	YGL017W	PPX1	P38698	397 aa		5.78	□□□□□ -1.48
ATE1	YGL017W	OCA5	P38738	679 aa		5.78	□□□□□ -1.48
ATE1	YGL017W	YHR218W	P38899	603 aa		5.78	□□□□□ -1.48
ATE1	YGL017W	FYV8	P46949	817 aa	Known RBP	5.78	□□□□□ -1.48
ATE1	YGL017W	KEL2	P50090	882 aa		5.78	□□□□□ -1.48
ATE1	YGL017W	ELA1	P53861	379 aa	Predicted RBP	5.78	□□□□□ -1.48
ATE1	YGL017W	YNL058C	P53947	316 aa		5.78	□□□□□ -1.48
ATE1	YGL017W	NAM8	Q00539	523 aa	Known RBP	5.78	□□□□□ -1.48
ATE1	YGL017W	CRF1	Q04930	467 aa		5.78	□□□□□ -1.48
ATE1	YGL017W	VAC14	Q06708	880 aa		5.78	□□□□□ -1.48
ATE1	YGL017W	WTM2	Q12206	467 aa		5.78	□□□□□ -1.48
ATE1	YGL017W	SEC39	Q12745	709 aa		5.78	□□□□□ -1.48
ATE1	YGL017W	ECM32	P32644	1121 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49
ATE1	YGL017W	ISC10	P32645	267 aa		5.77	□□□□□ -1.49
ATE1	YGL017W	SLA1	P32790	1244 aa		5.77	□□□□□ -1.49
ATE1	YGL017W	SKI2	P35207	1287 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.77	□□□□□ -1.49	not detected
ATE1	YGL017W	EXO84	P38261	753 aa		5.77	□□□□□ -1.49
ATE1	YGL017W	YBR197C	P38306	217 aa		5.77	□□□□□ -1.49
ATE1	YGL017W	MCX1	P38323	520 aa	Predicted RBP	5.77	□□□□□ -1.49
ATE1	YGL017W	SPL2	P38839	148 aa		5.77	□□□□□ -1.49
ATE1	YGL017W	CCC2	P38995	1004 aa		5.77	□□□□□ -1.49
ATE1	YGL017W	SAP1	P39955	897 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49
ATE1	YGL017W	DLD3	P39976	496 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49
ATE1	YGL017W	UTP7	P40055	554 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49
ATE1	YGL017W	YTA6	P40328	754 aa		5.77	□□□□□ -1.49
ATE1	YGL017W	EPL1	P43572	832 aa		5.77	□□□□□ -1.49
ATE1	YGL017W	ACF4	P47129	309 aa		5.77	□□□□□ -1.49
ATE1	YGL017W	CUE3	P53137	624 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49
ATE1	YGL017W	BOP3	P53958	396 aa		5.77	□□□□□ -1.49
ATE1	YGL017W	SSF2	Q12153	453 aa	Predicted RBP	5.77	□□□□□ -1.49
ATE1	YGL017W	APC2	Q12440	853 aa		5.77	□□□□□ -1.49
ATE1	YGL017W	PFK2	P16862	959 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.76	□□□□□ -1.49	not detected
ATE1	YGL017W	SEC18	P18759	758 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
ATE1	YGL017W	KDX1	P36005	433 aa		5.76	□□□□□ -1.49
ATE1	YGL017W	PXR1	P53335	271 aa	Predicted RBP	5.76	□□□□□ -1.49
ATE1	YGL017W	RPT4	P53549	437 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
ATE1	YGL017W	RRG1	Q12167	365 aa	Predicted RBP	5.76	□□□□□ -1.49
ATE1	YGL017W	LSO1	Q3E827	93 aa		5.76	□□□□□ -1.49
ATE1	YGL017W	PUP2	P32379	260 aa		5.75	□□□□□ -1.49
ATE1	YGL017W	BEM4	P39011	633 aa		5.75	□□□□□ -1.49
ATE1	YGL017W	SWD1	P39706	426 aa		5.75	□□□□□ -1.49
ATE1	YGL017W	PXA1	P41909	870 aa		5.75	□□□□□ -1.49
ATE1	YGL017W	MIC19	P43594	170 aa		5.75	□□□□□ -1.49
ATE1	YGL017W	ERG5	P54781	538 aa		5.75	□□□□□ -1.49
ATE1	YGL017W	PRP42	Q03776	544 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
ATE1	YGL017W	STE23	Q06010	1027 aa		5.75	□□□□□ -1.49
ATE1	YGL017W	UTP4	Q06679	776 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
ATE1	YGL017W	ACK1	Q07622	623 aa	Predicted RBP	5.75	□□□□□ -1.49
ATE1	YGL017W	NOP6	Q07623	225 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
ATE1	YGL017W	AFT2	Q08957	416 aa		5.75	□□□□□ -1.49
ATE1	YGL017W	YOR223W	Q12015	292 aa		5.75	□□□□□ -1.49
ATE1	YGL017W	HMI1	Q12039	706 aa		5.75	□□□□□ -1.49
ATE1	YGL017W	NUR1	Q12066	484 aa		5.75	□□□□□ -1.49
ATE1	YGL017W	CDC8	P00572	216 aa		5.74	□□□□□ -1.49
ATE1	YGL017W	RAD1	P06777	1100 aa		5.74	□□□□□ -1.49

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