RNA–Protein interactions for RNA: YJL134W

LCB3, Transcript of Long-chain base-1-phosphate phosphatase, yeastyeast

Gene LCB3, Length 1,230 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LCB3YJL134W SHM1P37292 490 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
LCB3YJL134W PCH2P38126 564 aa6.89□□□□□ -1.31
LCB3YJL134W ISW1P38144 1129 aa6.89□□□□□ -1.31
LCB3YJL134W PPS1P38148 807 aa6.89□□□□□ -1.31
LCB3YJL134W CAJ1P39101 391 aa6.89□□□□□ -1.31
LCB3YJL134W YEL076CP39971 216 aa6.89□□□□□ -1.31
LCB3YJL134W APT1P49435 187 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
LCB3YJL134W PGA2P53903 129 aa6.89□□□□□ -1.31
LCB3YJL134W VPS60Q03390 229 aa6.89□□□□□ -1.31
LCB3YJL134W YLR287CQ05881 355 aa6.89□□□□□ -1.31
LCB3YJL134W COG4Q06096 861 aa6.89□□□□□ -1.31
LCB3YJL134W YOL075CQ08234 1294 aa6.89□□□□□ -1.31
LCB3YJL134W HMI1Q12039 706 aa6.89□□□□□ -1.31
LCB3YJL134W ATG9Q12142 997 aa6.89□□□□□ -1.31
LCB3YJL134W YOL098CQ12496 1037 aa6.89□□□□□ -1.31
LCB3YJL134W ISY1P21374 235 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
LCB3YJL134W NUD1P32336 851 aa6.88□□□□□ -1.31
LCB3YJL134W PXL1P36166 706 aa6.88□□□□□ -1.31
LCB3YJL134W PAM1P37304 830 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
LCB3YJL134W PHO88P38264 188 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
LCB3YJL134W EFM2P38347 419 aa6.88□□□□□ -1.31
LCB3YJL134W SIP3P38717 1229 aa6.88□□□□□ -1.31
LCB3YJL134W ATG3P40344 310 aa6.88□□□□□ -1.31
LCB3YJL134W KTR7P40504 517 aa6.88□□□□□ -1.31
LCB3YJL134W CEP3P40969 608 aa6.88□□□□□ -1.31
LCB3YJL134W TOS3P43637 560 aa6.88□□□□□ -1.31
LCB3YJL134W GUP1P53154 560 aa6.88□□□□□ -1.31
LCB3YJL134W ALF1P53904 254 aa6.88□□□□□ -1.31
LCB3YJL134W YML037CQ03703 340 aa6.88□□□□□ -1.31
LCB3YJL134W PML39Q03760 334 aa6.88□□□□□ -1.31
LCB3YJL134W RRP6Q12149 733 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
LCB3YJL134W PFK1P16861 987 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
LCB3YJL134W RPC53P25441 422 aa6.87□□□□□ -1.31
LCB3YJL134W TCD1P38756 429 aa6.87□□□□□ -1.31
LCB3YJL134W PIH1P38768 344 aa6.87□□□□□ -1.31
LCB3YJL134W NUP82P40368 713 aa6.87□□□□□ -1.31
LCB3YJL134W MID1P41821 548 aa6.87□□□□□ -1.31
LCB3YJL134W ERG5P54781 538 aa6.87□□□□□ -1.31
LCB3YJL134W SEC5P89102 971 aa6.87□□□□□ -1.31
LCB3YJL134W PEX29Q03370 554 aa6.87□□□□□ -1.31
LCB3YJL134W SPO75Q07798 868 aa6.87□□□□□ -1.31
LCB3YJL134W RKM4Q12504 494 aa6.87□□□□□ -1.31
LCB3YJL134W YBL113CQ7M4S9 792 aa6.87□□□□□ -1.31
LCB3YJL134W PET111P08468 800 aa6.86□□□□□ -1.31
LCB3YJL134W MTF2P10849 440 aa6.86□□□□□ -1.31
LCB3YJL134W SEC23P15303 768 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
LCB3YJL134W UGA4P32837 571 aa6.86□□□□□ -1.31
LCB3YJL134W PGM1P33401 570 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
LCB3YJL134W UBX7P38349 436 aa6.86□□□□□ -1.31
LCB3YJL134W VFA1P40080 203 aa6.86□□□□□ -1.31
LCB3YJL134W HFM1P51979 1187 aa6.86□□□□□ -1.31
LCB3YJL134W CAF130P53280 1122 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
LCB3YJL134W CNM67P53865 581 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
LCB3YJL134W ORC4P54791 529 aa6.86□□□□□ -1.31
LCB3YJL134W UME1Q03010 460 aa6.86□□□□□ -1.31
LCB3YJL134W UTP5Q04177 643 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
LCB3YJL134W FUS2Q05670 677 aa6.86□□□□□ -1.31
LCB3YJL134W RAD18P10862 487 aa6.85□□□□□ -1.31
LCB3YJL134W UBC1P21734 215 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
LCB3YJL134W STO1P34160 861 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
LCB3YJL134W SEC9P40357 651 aa6.85□□□□□ -1.31
LCB3YJL134W SHQ1P40486 507 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
LCB3YJL134W HUL4P40985 892 aa6.85□□□□□ -1.31
LCB3YJL134W BRE2P43132 505 aa6.85□□□□□ -1.31
LCB3YJL134W YFL034WP43564 1073 aa6.85□□□□□ -1.31
LCB3YJL134W ULI1P43604 169 aa6.85□□□□□ -1.31
LCB3YJL134W LIF1P53150 421 aa6.85□□□□□ -1.31
LCB3YJL134W NMA111P53920 997 aa6.85□□□□□ -1.31
LCB3YJL134W CWC2Q12046 339 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
LCB3YJL134W GIN4Q12263 1142 aa6.85□□□□□ -1.31
LCB3YJL134W ARP6Q12509 438 aa6.85□□□□□ -1.31
LCB3YJL134W PHR1P05066 565 aaKnown RBP RIP-Chip data6.84□□□□□ -1.31not detected
LCB3YJL134W SRD1P09007 221 aa6.84□□□□□ -1.31
LCB3YJL134W SAM1P10659 382 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
LCB3YJL134W SPO12P17123 173 aa6.84□□□□□ -1.31
LCB3YJL134W OCT1P35999 772 aa6.84□□□□□ -1.31
LCB3YJL134W PNT1P38969 423 aa6.84□□□□□ -1.31
LCB3YJL134W NDC80P40460 691 aa6.84□□□□□ -1.31
LCB3YJL134W SPR3P41901 512 aa6.84□□□□□ -1.31
LCB3YJL134W IES1P43579 692 aa6.84□□□□□ -1.31
LCB3YJL134W NBP1P52919 319 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
LCB3YJL134W HUL5P53119 910 aa6.84□□□□□ -1.31
LCB3YJL134W YNL035CP53962 389 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
LCB3YJL134W ERF2Q06551 359 aa6.84□□□□□ -1.31
LCB3YJL134W TCO89Q08921 799 aa6.84□□□□□ -1.31
LCB3YJL134W NEW1Q08972 1196 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
LCB3YJL134W PLP2Q12017 286 aa6.84□□□□□ -1.31
LCB3YJL134W YDL206WQ12424 762 aa6.84□□□□□ -1.31
LCB3YJL134W PGK1P00560 416 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
LCB3YJL134W SSB1P11484 613 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
LCB3YJL134W CLN3P13365 580 aa6.83□□□□□ -1.32
LCB3YJL134W CDC60P26637 1090 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
LCB3YJL134W APL1P27351 700 aa6.83□□□□□ -1.32
LCB3YJL134W MRF1P30775 413 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
LCB3YJL134W ISF1P32488 338 aa6.83□□□□□ -1.32
LCB3YJL134W TGL1P34163 548 aa6.83□□□□□ -1.32
LCB3YJL134W MCX1P38323 520 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
LCB3YJL134W ERP5P38819 212 aa6.83□□□□□ -1.32
LCB3YJL134W TIF11P38912 153 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
LCB3YJL134W SMC2P38989 1170 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
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