RNA–Protein interactions for RNA: Q0050

AI1, Reverse transcriptase required for splicing of the COX1 pre-mRNA, yeast

Gene AI1, Length 2,505 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
AI1	Q0050	SUT1	P53032	299 aa	Known RBP	0.87	□□□□□ -2.27
AI1	Q0050	YMR206W	Q03695	313 aa		0.87	□□□□□ -2.27
AI1	Q0050	PUF6	Q04373	656 aa	Known RBP	0.87	□□□□□ -2.27
AI1	Q0050	PSK1	P31374	1356 aa		0.87	□□□□□ -2.27
AI1	Q0050	GSC2	P40989	1895 aa		0.87	□□□□□ -2.27
AI1	Q0050	RDH54	P38086	958 aa		0.86	□□□□□ -2.27
AI1	Q0050	BOL3	P39724	118 aa		0.86	□□□□□ -2.27
AI1	Q0050	RPL34B	P40525	121 aa	Known RBP	0.86	□□□□□ -2.27
AI1	Q0050	LYS4	P49367	693 aa	Predicted RBP	0.86	□□□□□ -2.27
AI1	Q0050	PUS2	P53167	370 aa		0.86	□□□□□ -2.27
AI1	Q0050	ECM23	Q02710	187 aa		0.86	□□□□□ -2.27
AI1	Q0050	RSA3	Q05942	220 aa	Known RBP	0.86	□□□□□ -2.27
AI1	Q0050	URB1	P34241	1764 aa	Known RBP	0.86	□□□□□ -2.27
AI1	Q0050	SNF5	P18480	905 aa		0.86	□□□□□ -2.27
AI1	Q0050	YKL077W	P36081	392 aa		0.86	□□□□□ -2.27
AI1	Q0050	SLS1	P42900	643 aa		0.86	□□□□□ -2.27
AI1	Q0050	YJL045W	P47052	634 aa		0.86	□□□□□ -2.27
AI1	Q0050	ART5	P53244	586 aa	Known RBP	0.86	□□□□□ -2.27
AI1	Q0050	NOG1	Q02892	647 aa	Known RBP	0.86	□□□□□ -2.27
AI1	Q0050	HMI1	Q12039	706 aa		0.86	□□□□□ -2.27
AI1	Q0050	SPO21	Q12411	609 aa		0.86	□□□□□ -2.27
AI1	Q0050	SIR4	P11978	1358 aa		0.86	□□□□□ -2.27
AI1	Q0050	MOT2	P34909	587 aa	Known RBP	0.85	□□□□□ -2.27
AI1	Q0050	SIS2	P36024	562 aa		0.85	□□□□□ -2.27
AI1	Q0050	KTR4	P38131	464 aa		0.85	□□□□□ -2.27
AI1	Q0050	YIL089W	P40500	205 aa		0.85	□□□□□ -2.27
AI1	Q0050	DOT5	P40553	215 aa		0.85	□□□□□ -2.27
AI1	Q0050	MTR4	P47047	1073 aa	Known RBP	0.85	□□□□□ -2.27
AI1	Q0050	YNR029C	P53729	429 aa	Known RBP	0.85	□□□□□ -2.27
AI1	Q0050	MPS1	P54199	764 aa		0.85	□□□□□ -2.27
AI1	Q0050	TDA9	Q04545	1251 aa		0.85	□□□□□ -2.27
AI1	Q0050	TAF7	Q05021	590 aa		0.85	□□□□□ -2.27
AI1	Q0050	YPR117W	Q06116	2489 aa		0.85	□□□□□ -2.27
AI1	Q0050	YSC84	P32793	468 aa		0.85	□□□□□ -2.27
AI1	Q0050	ORC2	P32833	620 aa		0.85	□□□□□ -2.27
AI1	Q0050	RFC5	P38251	354 aa		0.85	□□□□□ -2.27
AI1	Q0050	RPN1	P38764	993 aa	Known RBP	0.85	□□□□□ -2.27
AI1	Q0050	SHC1	P39000	512 aa		0.85	□□□□□ -2.27
AI1	Q0050	RRT6	P53117	311 aa	Predicted RBP	0.85	□□□□□ -2.27
AI1	Q0050	YAF9	P53930	226 aa		0.85	□□□□□ -2.27
AI1	Q0050	ECM30	Q06673	1274 aa		0.85	□□□□□ -2.27
AI1	Q0050	VTS1	Q08831	523 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.85	□□□□□ -2.27	not detected
AI1	Q0050	SUT2	Q12286	268 aa		0.85	□□□□□ -2.27
AI1	Q0050	RGT2	Q12300	763 aa		0.85	□□□□□ -2.27
AI1	Q0050	YLR278C	Q05854	1341 aa		0.85	□□□□□ -2.27
AI1	Q0050	RPS9A	O13516	197 aa	Known RBP	0.84	□□□□□ -2.27
AI1	Q0050	AFG2	P32794	780 aa		0.84	□□□□□ -2.27
AI1	Q0050	UBX7	P38349	436 aa		0.84	□□□□□ -2.27
AI1	Q0050	NUT1	P53114	1132 aa		0.84	□□□□□ -2.27
AI1	Q0050	SQS1	P53866	767 aa	Known RBP	0.84	□□□□□ -2.27
AI1	Q0050	YML083C	Q04526	418 aa		0.84	□□□□□ -2.27
AI1	Q0050	GPI13	Q07830	1017 aa		0.84	□□□□□ -2.27
AI1	Q0050	YLR040C	Q07988	224 aa		0.84	□□□□□ -2.27
AI1	Q0050	NOB1	Q08444	459 aa	Known RBP	0.84	□□□□□ -2.27
AI1	Q0050	BUG1	Q12191	341 aa		0.84	□□□□□ -2.27
AI1	Q0050	FLP1	P03870	423 aa		0.84	□□□□□ -2.28
AI1	Q0050	PTP1	P25044	335 aa		0.84	□□□□□ -2.28
AI1	Q0050	YHR131C	P38835	850 aa		0.84	□□□□□ -2.28
AI1	Q0050	SHU2	P38957	223 aa		0.84	□□□□□ -2.28
AI1	Q0050	YFL054C	P43549	646 aa		0.84	□□□□□ -2.28
AI1	Q0050	ZDS1	P50111	915 aa	Known RBP	0.84	□□□□□ -2.28
AI1	Q0050	EXG2	P52911	562 aa		0.84	□□□□□ -2.28
AI1	Q0050	TNA1	P53322	534 aa		0.84	□□□□□ -2.28
AI1	Q0050	UTP5	Q04177	643 aa	Known RBP	0.84	□□□□□ -2.28
AI1	Q0050	SIZ1	Q04195	904 aa		0.84	□□□□□ -2.28
AI1	Q0050	RPL40A	P0CH08	128 aa	Known RBP	0.83	□□□□□ -2.28
AI1	Q0050	RPL40B	P0CH09	128 aa	Known RBP	0.83	□□□□□ -2.28
AI1	Q0050	RAD4	P14736	754 aa		0.83	□□□□□ -2.28
AI1	Q0050	CDC43	P18898	376 aa		0.83	□□□□□ -2.28
AI1	Q0050	FLO10	P36170	1169 aa		0.83	□□□□□ -2.28
AI1	Q0050	APE3	P37302	537 aa	Known RBP	0.83	□□□□□ -2.28
AI1	Q0050	PEA2	P40091	420 aa		0.83	□□□□□ -2.28
AI1	Q0050	EAF6	P47128	113 aa		0.83	□□□□□ -2.28
AI1	Q0050	MAP1	Q01662	387 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.83	□□□□□ -2.28	not detected
AI1	Q0050	TOS4	Q06266	489 aa		0.83	□□□□□ -2.28
AI1	Q0050	DAP1	Q12091	152 aa		0.83	□□□□□ -2.28
AI1	Q0050	NUP192	P47054	1683 aa		0.83	□□□□□ -2.28
AI1	Q0050	PFF1	P38244	976 aa		0.83	□□□□□ -2.28
AI1	Q0050	TDP1	P38319	544 aa		0.83	□□□□□ -2.28
AI1	Q0050	PIK1	P39104	1066 aa		0.83	□□□□□ -2.28
AI1	Q0050	PNP1	Q05788	311 aa		0.83	□□□□□ -2.28
AI1	Q0050	TUS1	Q06412	1307 aa		0.83	□□□□□ -2.28
AI1	Q0050	APC1	P53886	1748 aa		0.82	□□□□□ -2.28
AI1	Q0050	NUM1	Q00402	2748 aa		0.82	□□□□□ -2.28
AI1	Q0050	APL1	P27351	700 aa		0.82	□□□□□ -2.28
AI1	Q0050	SDS3	P40505	327 aa		0.82	□□□□□ -2.28
AI1	Q0050	CHA4	P43634	648 aa		0.82	□□□□□ -2.28
AI1	Q0050	PUN1	Q06991	263 aa		0.82	□□□□□ -2.28
AI1	Q0050	MSL5	Q12186	476 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.82	□□□□□ -2.28	not detected
AI1	Q0050	FKS3	Q04952	1785 aa		0.82	□□□□□ -2.28
AI1	Q0050	YRF1-4	O13559	1382 aa		0.82	□□□□□ -2.28
AI1	Q0050	PAH1	P32567	862 aa		0.82	□□□□□ -2.28
AI1	Q0050	YKR075C	P36155	307 aa		0.82	□□□□□ -2.28
AI1	Q0050	GCV2	P49095	1034 aa		0.82	□□□□□ -2.28
AI1	Q0050	ERG5	P54781	538 aa		0.82	□□□□□ -2.28
AI1	Q0050	SLU7	Q02775	382 aa	Known RBP	0.82	□□□□□ -2.28
AI1	Q0050	RBA50	Q04418	439 aa		0.82	□□□□□ -2.28
AI1	Q0050	ENB1	Q08299	606 aa		0.82	□□□□□ -2.28
AI1	Q0050	MRH1	Q12117	320 aa	Predicted RBP	0.82	□□□□□ -2.28
AI1	Q0050	YRF1-3	P0CX14	1859 aa		0.81	□□□□□ -2.28

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