RNA–Protein interactions for RNA: YOR163W

DDP1, Transcript of Polyphosphate phosphatase, yeast

Gene DDP1, Length 567 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
DDP1	YOR163W	LAP2	Q10740	671 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DDP1	YOR163W	YLR125W	Q12138	136 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DDP1	YOR163W	HIF1	Q12373	385 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DDP1	YOR163W	ADR1	P07248	1323 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DDP1	YOR163W	TUB2	P02557	457 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
DDP1	YOR163W	ERR1	P0CX10	437 aa		4.61	□□□□□ -1.67
DDP1	YOR163W	ERR2	P0CX11	437 aa		4.61	□□□□□ -1.67
DDP1	YOR163W	MSH3	P25336	1018 aa		4.61	□□□□□ -1.67
DDP1	YOR163W	XKS1	P42826	600 aa		4.61	□□□□□ -1.67
DDP1	YOR163W	YJL045W	P47052	634 aa		4.61	□□□□□ -1.67
DDP1	YOR163W	FAA4	P47912	694 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
DDP1	YOR163W	NAN1	Q02931	896 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
DDP1	YOR163W	SPO20	Q04359	397 aa		4.61	□□□□□ -1.67
DDP1	YOR163W	TOS4	Q06266	489 aa		4.61	□□□□□ -1.67
DDP1	YOR163W	TDA5	Q06417	326 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
DDP1	YOR163W	YOR378W	Q08902	515 aa		4.61	□□□□□ -1.67
DDP1	YOR163W	NOP14	Q99207	810 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
DDP1	YOR163W	MRC1	P25588	1096 aa		4.6	□□□□□ -1.67
DDP1	YOR163W	GCD6	P32501	712 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
DDP1	YOR163W	SAM37	P50110	327 aa		4.6	□□□□□ -1.67
DDP1	YOR163W	YGR122W	P53272	402 aa		4.6	□□□□□ -1.67
DDP1	YOR163W	YNR029C	P53729	429 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
DDP1	YOR163W	RSC58	Q07979	502 aa		4.6	□□□□□ -1.67
DDP1	YOR163W	TAD3	Q9URQ3	322 aa		4.6	□□□□□ -1.67
DDP1	YOR163W	RPN12	P32496	274 aa		4.59	□□□□□ -1.67
DDP1	YOR163W	PAF1	P38351	445 aa		4.59	□□□□□ -1.67
DDP1	YOR163W	YHR020W	P38708	688 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
DDP1	YOR163W	QNS1	P38795	714 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
DDP1	YOR163W	DAS1	P47005	663 aa		4.59	□□□□□ -1.67
DDP1	YOR163W	TYW3	P53177	273 aa		4.59	□□□□□ -1.67
DDP1	YOR163W	VMS1	Q04311	632 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
DDP1	YOR163W	TMA17	Q12513	150 aa		4.59	□□□□□ -1.67
DDP1	YOR163W	SPS1	P08458	490 aa		4.58	□□□□□ -1.68
DDP1	YOR163W	CDC11	P32458	415 aa		4.58	□□□□□ -1.68
DDP1	YOR163W	MFT1	P33441	392 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
DDP1	YOR163W	YKL069W	P36088	180 aa		4.58	□□□□□ -1.68
DDP1	YOR163W	CIC1	P38779	376 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
DDP1	YOR163W	FAA3	P39002	694 aa		4.58	□□□□□ -1.68
DDP1	YOR163W	SPF1	P39986	1215 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
DDP1	YOR163W	CHZ1	P40019	153 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
DDP1	YOR163W	YFR016C	P43597	1233 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
DDP1	YOR163W	YJR120W	P47157	116 aa		4.58	□□□□□ -1.68
DDP1	YOR163W	NAB6	Q03735	1134 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.58	□□□□□ -1.68	not detected
DDP1	YOR163W	ATG16	Q03818	150 aa		4.58	□□□□□ -1.68
DDP1	YOR163W	NBA1	Q08229	501 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
DDP1	YOR163W	FLC1	Q08967	793 aa		4.58	□□□□□ -1.68
DDP1	YOR163W	SLX4	Q12098	748 aa		4.58	□□□□□ -1.68
DDP1	YOR163W	PNS1	Q12412	539 aa		4.58	□□□□□ -1.68
DDP1	YOR163W	TCB3	Q03640	1545 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
DDP1	YOR163W	YSC84	P32793	468 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DDP1	YOR163W	VPS35	P34110	944 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DDP1	YOR163W	ATG14	P38270	344 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DDP1	YOR163W	MPT5	P39016	859 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.57	□□□□□ -1.68	not detected
DDP1	YOR163W	RSP5	P39940	809 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
DDP1	YOR163W	IES1	P43579	692 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DDP1	YOR163W	RKM2	Q03942	479 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DDP1	YOR163W	SGD1	Q06132	899 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DDP1	YOR163W	OPI10	Q08202	246 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DDP1	YOR163W	OXR1	Q08952	273 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DDP1	YOR163W	NYV1	Q12255	253 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DDP1	YOR163W	ERP4	Q12450	207 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DDP1	YOR163W	SCP160	P06105	1222 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.56	□□□□□ -1.68	not detected
DDP1	YOR163W	RPL8A	P17076	256 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
DDP1	YOR163W	DPB3	P27344	201 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DDP1	YOR163W	LAM1	P38851	1228 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DDP1	YOR163W	MEF2	P39677	819 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DDP1	YOR163W	SNF7	P39929	240 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
DDP1	YOR163W	SPT20	P50875	604 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DDP1	YOR163W	ESF2	P53743	316 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
DDP1	YOR163W	YNR063W	P53749	607 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DDP1	YOR163W	PEX13	P80667	386 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DDP1	YOR163W	GCN5	Q03330	439 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DDP1	YOR163W	SND1	Q04007	877 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DDP1	YOR163W	NTG2	Q08214	380 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DDP1	YOR163W	YOR352W	Q08816	343 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DDP1	YOR163W	HXK1	P04806	485 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
DDP1	YOR163W	YEF3	P16521	1044 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
DDP1	YOR163W	SFP1	P32432	683 aa		4.55	□□□□□ -1.68
DDP1	YOR163W	VID27	P40157	782 aa		4.55	□□□□□ -1.68
DDP1	YOR163W	VPS53	P47061	822 aa		4.55	□□□□□ -1.68
DDP1	YOR163W	YGR021W	P53212	290 aa		4.55	□□□□□ -1.68
DDP1	YOR163W	YGR125W	P53273	1036 aa		4.55	□□□□□ -1.68
DDP1	YOR163W	TMA7	Q3E764	64 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
DDP1	YOR163W	PIF1	P07271	859 aa		4.54	□□□□□ -1.68
DDP1	YOR163W	CDC34	P14682	295 aa		4.54	□□□□□ -1.68
DDP1	YOR163W	HIR1	P32479	840 aa		4.54	□□□□□ -1.68
DDP1	YOR163W	NFU1	P32860	256 aa		4.54	□□□□□ -1.68
DDP1	YOR163W	PRP40	P33203	583 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
DDP1	YOR163W	RDH54	P38086	958 aa		4.54	□□□□□ -1.68
DDP1	YOR163W	HNT2	P49775	206 aa		4.54	□□□□□ -1.68
DDP1	YOR163W	RCL1	Q08096	367 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
DDP1	YOR163W	FAL1	Q12099	399 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
DDP1	YOR163W	COQ4	O13525	335 aa		4.53	□□□□□ -1.68
DDP1	YOR163W	CIT1	P00890	479 aa		4.53	□□□□□ -1.68
DDP1	YOR163W	BAS1	P22035	811 aa		4.53	□□□□□ -1.68
DDP1	YOR163W	UGA4	P32837	571 aa		4.53	□□□□□ -1.68
DDP1	YOR163W	MTC2	P34246	357 aa		4.53	□□□□□ -1.68
DDP1	YOR163W	ADD66	P36040	267 aa		4.53	□□□□□ -1.68
DDP1	YOR163W	RPS0B	P46654	252 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
DDP1	YOR163W	RSM26	P47141	266 aa		4.53	□□□□□ -1.68

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