RNA–Protein interactions for RNA: tS(GCU)Q1

tS(GCU)Q1, Transcript of Mitochondrial serine tRNA (tRNA-Ser), yeastyeast

Gene tS(GCU)Q1, Length 86 nt, Biotype tRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YLR040CQ07988 224 aa1.74□□□□□ -2.13
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 BNR1P40450 1375 aa1.73□□□□□ -2.13
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 EFT1P32324 842 aaKnown RBP1.73□□□□□ -2.13
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 BAP2P38084 609 aa1.73□□□□□ -2.13
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 EXO5P38289 585 aa1.73□□□□□ -2.13
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 PIK1P39104 1066 aa1.73□□□□□ -2.13
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 EXG2P52911 562 aa1.73□□□□□ -2.13
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 TNA1P53322 534 aa1.73□□□□□ -2.13
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 THI7Q05998 598 aa1.73□□□□□ -2.13
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 TUB1P09733 447 aaKnown RBP1.72□□□□□ -2.13
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 GAT1P43574 510 aa1.72□□□□□ -2.13
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YNR063WP53749 607 aa1.72□□□□□ -2.13
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 HOS3Q02959 697 aaKnown RBP1.72□□□□□ -2.13
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 RIX1P38883 763 aaPredicted RBP1.71□□□□□ -2.14
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 VPS53P47061 822 aa1.71□□□□□ -2.14
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 MRPS35P53292 345 aa1.71□□□□□ -2.14
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 ILV6P25605 309 aaKnown RBP1.7□□□□□ -2.14
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 APL1P27351 700 aa1.7□□□□□ -2.14
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 KTR4P38131 464 aa1.7□□□□□ -2.14
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 GPB2P39717 880 aa1.7□□□□□ -2.14
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 NUT1P53114 1132 aa1.7□□□□□ -2.14
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 UTP5Q04177 643 aaKnown RBP1.7□□□□□ -2.14
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 MSL5Q12186 476 aaKnown RBP RIP-Chip data1.7□□□□□ -2.14not detected
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 XKS1P42826 600 aa1.69□□□□□ -2.14
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 RSC4Q02206 625 aa1.69□□□□□ -2.14
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 LSO1Q3E827 93 aa1.69□□□□□ -2.14
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 RVS167P39743 482 aaKnown RBP1.68□□□□□ -2.14
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 MUK1Q02866 612 aa1.68□□□□□ -2.14
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 ENB1Q08299 606 aa1.68□□□□□ -2.14
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 RIB2Q12362 591 aaKnown RBP1.68□□□□□ -2.14
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 KIP1P28742 1111 aa1.67□□□□□ -2.14
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 RPN1P38764 993 aaKnown RBP1.67□□□□□ -2.14
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 MET12P46151 657 aa1.67□□□□□ -2.14
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 BPL1P48445 690 aaPredicted RBP1.67□□□□□ -2.14
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 SIZ1Q04195 904 aa1.67□□□□□ -2.14
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 PNP1Q05788 311 aa1.67□□□□□ -2.14
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 HIS5P07172 385 aa1.66□□□□□ -2.14
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 GFA1P14742 717 aaKnown RBP1.66□□□□□ -2.14
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 SNF5P18480 905 aa1.66□□□□□ -2.14
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 SDS3P40505 327 aa1.66□□□□□ -2.14
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 CWC15Q03772 175 aaKnown RBP1.66□□□□□ -2.14
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 HBT1Q07653 1046 aaKnown RBP1.66□□□□□ -2.14
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 TPO1Q07824 586 aa1.66□□□□□ -2.14
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 MRH1Q12117 320 aaPredicted RBP1.66□□□□□ -2.14
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 SVS1Q12254 260 aa1.66□□□□□ -2.14
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 SUT2Q12286 268 aa1.66□□□□□ -2.14
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 FLP1P03870 423 aa1.65□□□□□ -2.15
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 STE4P18851 423 aa1.65□□□□□ -2.15
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 ERG4P25340 473 aa1.65□□□□□ -2.15
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 PEP7P32609 515 aa1.65□□□□□ -2.15
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 FLO10P36170 1169 aa1.65□□□□□ -2.15
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 CHA4P43634 648 aa1.65□□□□□ -2.15
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 GIS2P53849 153 aaKnown RBP RIP-Chip data1.65□□□□□ -2.15not detected
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 MAP1Q01662 387 aaKnown RBP RIP-Chip data1.65□□□□□ -2.15not detected
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 RPP2AP05319 106 aaKnown RBP1.64□□□□□ -2.15
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 POA1P38218 177 aa1.64□□□□□ -2.15
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 TDP1P38319 544 aa1.64□□□□□ -2.15
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 SLX1P38324 304 aa1.64□□□□□ -2.15
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 RNT1Q02555 471 aa1.64□□□□□ -2.15
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 TDA9Q04545 1251 aa1.64□□□□□ -2.15
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 KCS1Q12494 1050 aa1.64□□□□□ -2.15
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 HCA4P20448 770 aaKnown RBP1.63□□□□□ -2.15
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 BUL1P48524 976 aa1.63□□□□□ -2.15
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 PUS2P53167 370 aa1.63□□□□□ -2.15
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 NOG1Q02892 647 aaKnown RBP1.63□□□□□ -2.15
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 MSC2Q03455 724 aa1.63□□□□□ -2.15
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 RKM2Q03942 479 aa1.63□□□□□ -2.15
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 FUR4P05316 633 aaKnown RBP1.62□□□□□ -2.15
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 VMA4P22203 233 aaKnown RBP1.62□□□□□ -2.15
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 RPN3P40016 523 aaKnown RBP1.62□□□□□ -2.15
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 MND2P40577 368 aa1.62□□□□□ -2.15
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 MEP2P41948 499 aa1.62□□□□□ -2.15
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 MON1P53129 644 aa1.62□□□□□ -2.15
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 ARO10Q06408 635 aa1.62□□□□□ -2.15
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 ADY3Q07732 790 aa1.62□□□□□ -2.15
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 LAS17Q12446 633 aa1.62□□□□□ -2.15
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 PPR1P07272 904 aaPredicted RBP1.61□□□□□ -2.15
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 MSH3P25336 1018 aa1.61□□□□□ -2.15
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 TTI1P36097 1038 aa1.61□□□□□ -2.15
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 RSP5P39940 809 aaKnown RBP1.61□□□□□ -2.15
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 UFD2P54860 961 aa1.61□□□□□ -2.15
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 BSC2Q05611 235 aa1.61□□□□□ -2.15
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 ALG7P07286 448 aa1.6□□□□□ -2.15
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 ADD66P36040 267 aa1.6□□□□□ -2.15
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 TAH11P47112 604 aa1.6□□□□□ -2.15
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 HGH1P48362 394 aaKnown RBP1.6□□□□□ -2.15
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 MPS1P54199 764 aa1.6□□□□□ -2.15
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 SCP160P06105 1222 aaKnown RBP RIP-Chip data1.59□□□□□ -2.15not detected
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 GEF1P37020 779 aa1.59□□□□□ -2.15
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YNL011CP53980 444 aa1.59□□□□□ -2.15
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YIL166CP40445 542 aa1.58□□□□□ -2.16
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 VPS73P53142 486 aaKnown RBP1.58□□□□□ -2.16
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 PEX13P80667 386 aa1.58□□□□□ -2.16
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 RGT2Q12300 763 aa1.58□□□□□ -2.16
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 PTC5Q12511 572 aa1.58□□□□□ -2.16
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 CDC43P18898 376 aa1.57□□□□□ -2.16
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 CAD1P24813 409 aaKnown RBP1.57□□□□□ -2.16
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 PUP1P25043 261 aa1.57□□□□□ -2.16
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 KAR4P25583 335 aa1.57□□□□□ -2.16
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 ORC2P32833 620 aa1.57□□□□□ -2.16
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 24.3 ms