RNA–Protein interactions for RNA: YPL179W

PPQ1, Transcript of Protein phosphatase that regulates the mating response, yeast

Gene PPQ1, Length 1,650 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PPQ1	YPL179W	RSC4	Q02206	625 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PPQ1	YPL179W	RAT1	Q02792	1006 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
PPQ1	YPL179W	TIF6	Q12522	245 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
PPQ1	YPL179W	SSK22	P25390	1331 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
PPQ1	YPL179W	SMY1	P32364	656 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
PPQ1	YPL179W	ERP5	P38819	212 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PPQ1	YPL179W	MDJ2	P42834	146 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PPQ1	YPL179W	YNR014W	P53719	212 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PPQ1	YPL179W	UBP16	Q02863	499 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PPQ1	YPL179W	MTC5	Q03897	1148 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PPQ1	YPL179W	TRS120	Q04183	1289 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PPQ1	YPL179W	TDA6	Q06466	467 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PPQ1	YPL179W	BDF2	Q07442	638 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PPQ1	YPL179W	HAT1	Q12341	374 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PPQ1	YPL179W	YBL113C	Q7M4S9	792 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PPQ1	YPL179W	NHA1	Q99271	985 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PPQ1	YPL179W	HKR1	P41809	1802 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PPQ1	YPL179W	MRP10	O75012	95 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PPQ1	YPL179W	GCD7	P32502	381 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
PPQ1	YPL179W	PGM2	P37012	569 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
PPQ1	YPL179W	ERT1	P38140	529 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PPQ1	YPL179W	ALG14	P38242	237 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PPQ1	YPL179W	PPT1	P53043	513 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PPQ1	YPL179W	KIN4	Q01919	800 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PPQ1	YPL179W	SKN7	P38889	622 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PPQ1	YPL179W	MNL2	Q12205	849 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PPQ1	YPL179W	YPR053C	Q6Q5F3	151 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PPQ1	YPL179W	FAS2	P19097	1887 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
PPQ1	YPL179W	FRD1	P32614	470 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
PPQ1	YPL179W	KTR3	P38130	404 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
PPQ1	YPL179W	PFF1	P38244	976 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PPQ1	YPL179W	SSF1	P38789	453 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
PPQ1	YPL179W	INP51	P40559	946 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
PPQ1	YPL179W	LEM3	P42838	414 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PPQ1	YPL179W	SAC3	P46674	1301 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PPQ1	YPL179W	BIO5	P53744	561 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
PPQ1	YPL179W	SOG2	Q08817	791 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PPQ1	YPL179W	FIG2	P25653	1609 aa		4.65	□□□□□ -1.66
PPQ1	YPL179W	FUS1	P11710	512 aa		4.65	□□□□□ -1.66
PPQ1	YPL179W	GUP1	P53154	560 aa		4.65	□□□□□ -1.66
PPQ1	YPL179W	YNL011C	P53980	444 aa		4.65	□□□□□ -1.66
PPQ1	YPL179W	YMR187C	Q03236	431 aa		4.65	□□□□□ -1.66
PPQ1	YPL179W	GRS1	P38088	690 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
PPQ1	YPL179W	NMD2	P38798	1089 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
PPQ1	YPL179W	SPL2	P38839	148 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PPQ1	YPL179W	ERO1	Q03103	563 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PPQ1	YPL179W	SYF1	Q04048	859 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
PPQ1	YPL179W	IRC3	Q06683	689 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PPQ1	YPL179W	DIB1	Q06819	143 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
PPQ1	YPL179W	HVG1	P0CE11	249 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PPQ1	YPL179W	YCK2	P23292	546 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
PPQ1	YPL179W	MGM1	P32266	881 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PPQ1	YPL179W	YKL222C	P35995	705 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PPQ1	YPL179W	AMN1	P38285	549 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
PPQ1	YPL179W	RPT4	P53549	437 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
PPQ1	YPL179W	CDC55	Q00362	526 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PPQ1	YPL179W	NUT2	Q06213	157 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PPQ1	YPL179W	THI3	Q07471	609 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PPQ1	YPL179W	YDR215C	Q12240	137 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PPQ1	YPL179W	ADR1	P07248	1323 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PPQ1	YPL179W	TY4B-P	A0A0B7P3V8	1104 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PPQ1	YPL179W	CTT1	P06115	562 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PPQ1	YPL179W	SEC18	P18759	758 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PPQ1	YPL179W	PYC2	P32327	1180 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PPQ1	YPL179W	FPR3	P38911	411 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PPQ1	YPL179W	GIP2	P40036	548 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PPQ1	YPL179W	CTR9	P89105	1077 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PPQ1	YPL179W	RPN7	Q06103	429 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PPQ1	YPL179W	TY4A-H	Q6Q5P6	413 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PPQ1	YPL179W	NOT3	P06102	836 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PPQ1	YPL179W	RET1	P22276	1149 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PPQ1	YPL179W	ICL1	P28240	557 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PPQ1	YPL179W	TFA2	P36145	328 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PPQ1	YPL179W	STM1	P39015	273 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PPQ1	YPL179W	CCT8	P47079	568 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PPQ1	YPL179W	BUD9	P53226	547 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PPQ1	YPL179W	YNL193W	P53870	558 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PPQ1	YPL179W	RMD1	Q03441	430 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PPQ1	YPL179W	NKP2	Q06162	153 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PPQ1	YPL179W	GLO4	Q12320	285 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PPQ1	YPL179W	SNU66	Q12420	587 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PPQ1	YPL179W	POM152	P39685	1337 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PPQ1	YPL179W	KRE2	P27809	442 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PPQ1	YPL179W	SFA1	P32771	386 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PPQ1	YPL179W	RFC1	P38630	861 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PPQ1	YPL179W	SOK2	P53438	785 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PPQ1	YPL179W	ALO1	P54783	526 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PPQ1	YPL179W	MSH6	Q03834	1242 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PPQ1	YPL179W	TOS4	Q06266	489 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PPQ1	YPL179W	GAS5	Q08193	484 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PPQ1	YPL179W	FRT1	Q99332	602 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PPQ1	YPL179W	TOP1	P04786	769 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PPQ1	YPL179W	ECM21	P38167	1117 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PPQ1	YPL179W	PPX1	P38698	397 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PPQ1	YPL179W	PIB2	P53191	635 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PPQ1	YPL179W	BSC2	Q05611	235 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PPQ1	YPL179W	GPI13	Q07830	1017 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PPQ1	YPL179W	FLO11	P08640	1367 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PPQ1	YPL179W	PDR18	P53756	1333 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PPQ1	YPL179W	AI3	P03877	415 aa		4.6	□□□□□ -1.67

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 14.5 ms