RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000553007.2

ATP5B-211, Transcript of ATP synthase subunit beta, mitochondrial, humanhuman

TSL 5

Gene ATP5B, Length 814 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5B-211ENST00000553007 NISCHQ9Y2I1 1504 aa46.37■■■■■ 5.01
ATP5B-211ENST00000553007 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa41.33■■■■■ 4.21
ATP5B-211ENST00000553007 ABCC9O60706 1549 aa40.37■■■■■ 4.05
ATP5B-211ENST00000553007 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa38.87■■■■□ 3.81
ATP5B-211ENST00000553007 NACADO15069 1562 aa38.83■■■■□ 3.81
ATP5B-211ENST00000553007 MYO15BQ96JP2 1530 aa38.65■■■■□ 3.78
ATP5B-211ENST00000553007 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP38.63■■■■□ 3.77
ATP5B-211ENST00000553007 DCAF8L2P0C7V8 631 aa38.5■■■■□ 3.75
ATP5B-211ENST00000553007 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa38.43■■■■□ 3.74
ATP5B-211ENST00000553007 UNC13AQ9UPW8 1703 aa38.04■■■■□ 3.68
ATP5B-211ENST00000553007 BICRAQ9NZM4 1560 aa37.75■■■■□ 3.63
ATP5B-211ENST00000553007 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP37.63■■■■□ 3.61
ATP5B-211ENST00000553007 SCRIBQ14160 1630 aa37.58■■■■□ 3.61
ATP5B-211ENST00000553007 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa37.39■■■■□ 3.58
ATP5B-211ENST00000553007 DNAJC5BQ9UF47 199 aa37.12■■■■□ 3.53
ATP5B-211ENST00000553007 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP36.72■■■■□ 3.47
ATP5B-211ENST00000553007 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa36.57■■■■□ 3.44
ATP5B-211ENST00000553007 CECR2Q9BXF3 1484 aa36.31■■■■□ 3.4
ATP5B-211ENST00000553007 SMARCA4P51532 1647 aa36■■■■□ 3.35
ATP5B-211ENST00000553007 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP35.93■■■■□ 3.34
ATP5B-211ENST00000553007 NCAPD3P42695 1498 aa35.83■■■■□ 3.33
ATP5B-211ENST00000553007 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa35.81■■■■□ 3.32
ATP5B-211ENST00000553007 SMARCA2P51531 1590 aa35.77■■■■□ 3.32
ATP5B-211ENST00000553007 PEG3Q9GZU2 1588 aa35.72■■■■□ 3.31
ATP5B-211ENST00000553007 MROH2BQ7Z745 1585 aa35.71■■■■□ 3.31
ATP5B-211ENST00000553007 HMGXB3Q12766 1538 aa35.67■■■■□ 3.3
ATP5B-211ENST00000553007 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP35.48■■■■□ 3.27
ATP5B-211ENST00000553007 WIZO95785 1651 aa35.3■■■■□ 3.24
ATP5B-211ENST00000553007 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP35.26■■■■□ 3.24
ATP5B-211ENST00000553007 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP34.96■■■■□ 3.19
ATP5B-211ENST00000553007 NESP48681 1621 aa34.92■■■■□ 3.18
ATP5B-211ENST00000553007 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa34.9■■■■□ 3.18
ATP5B-211ENST00000553007 ERCC6Q03468 1493 aa34.78■■■■□ 3.16
ATP5B-211ENST00000553007 CADPSQ9ULU8 1353 aa34.73■■■■□ 3.15
ATP5B-211ENST00000553007 PDS5BQ9NTI5 1447 aa34.61■■■■□ 3.13
ATP5B-211ENST00000553007 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa34.56■■■■□ 3.12
ATP5B-211ENST00000553007 CFTRP13569 1480 aa34.55■■■■□ 3.12
ATP5B-211ENST00000553007 CUX2O14529 1486 aa34.54■■■■□ 3.12
ATP5B-211ENST00000553007 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP34.51■■■■□ 3.12
ATP5B-211ENST00000553007 CCDC88BA6NC98 1476 aa34.51■■■■□ 3.11
ATP5B-211ENST00000553007 PRDM2Q13029 1718 aa34.33■■■■□ 3.09
ATP5B-211ENST00000553007 FANCD2Q9BXW9 1451 aa34.33■■■■□ 3.09
ATP5B-211ENST00000553007 CEP164Q9UPV0 1460 aa34.3■■■■□ 3.08
ATP5B-211ENST00000553007 MRC2Q9UBG0 1479 aa34.28■■■■□ 3.08
ATP5B-211ENST00000553007 WDR62O43379 1518 aa34.22■■■■□ 3.07
ATP5B-211ENST00000553007 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP34.11■■■■□ 3.05
ATP5B-211ENST00000553007 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP34.02■■■■□ 3.04
ATP5B-211ENST00000553007 TOPBP1Q92547 1522 aa33.79■■■■□ 3
ATP5B-211ENST00000553007 ABCC8Q09428 1581 aa33.79■■■■□ 3
ATP5B-211ENST00000553007 DNMBPQ6XZF7 1577 aa33.77■■■■□ 3
ATP5B-211ENST00000553007 IFT140Q96RY7 1462 aa33.6■■■□□ 2.97
ATP5B-211ENST00000553007 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa33.52■■■□□ 2.96
ATP5B-211ENST00000553007 CUX1P39880 1505 aa33.52■■■□□ 2.96
ATP5B-211ENST00000553007 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP33.5■■■□□ 2.95
ATP5B-211ENST00000553007 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP33.48■■■□□ 2.95
ATP5B-211ENST00000553007 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP33.43■■■□□ 2.94
ATP5B-211ENST00000553007 FGD5Q6ZNL6 1462 aa33.38■■■□□ 2.93
ATP5B-211ENST00000553007 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP33.34■■■□□ 2.93
ATP5B-211ENST00000553007 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa33.31■■■□□ 2.92
ATP5B-211ENST00000553007 SOGA1O94964 1423 aa33.3■■■□□ 2.92
ATP5B-211ENST00000553007 WDR97A6NE52 1622 aa33.24■■■□□ 2.91
ATP5B-211ENST00000553007 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa33.24■■■□□ 2.91
ATP5B-211ENST00000553007 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP33.22■■■□□ 2.91
ATP5B-211ENST00000553007 TOP2BQ02880 1626 aa33.22■■■□□ 2.91
ATP5B-211ENST00000553007 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP33.19■■■□□ 2.99e-14■■■■□ 24
ATP5B-211ENST00000553007 SYNJ1O43426 1573 aa33.19■■■□□ 2.9
ATP5B-211ENST00000553007 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP33.1■■■□□ 2.89
ATP5B-211ENST00000553007 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa33.1■■■□□ 2.89
ATP5B-211ENST00000553007 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa33.01■■■□□ 2.87
ATP5B-211ENST00000553007 OSCARQ8IYS5 282 aa32.98■■■□□ 2.87
ATP5B-211ENST00000553007 GRIN2BQ13224 1484 aa32.97■■■□□ 2.87
ATP5B-211ENST00000553007 GAPVD1Q14C86 1478 aa32.94■■■□□ 2.86
ATP5B-211ENST00000553007 PBRM1Q86U86 1689 aa32.93■■■□□ 2.86
ATP5B-211ENST00000553007 CHD1O14646 1710 aa32.93■■■□□ 2.86
ATP5B-211ENST00000553007 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa32.93■■■□□ 2.86
ATP5B-211ENST00000553007 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP32.92■■■□□ 2.86
ATP5B-211ENST00000553007 SYNJ2O15056 1496 aa32.78■■■□□ 2.84
ATP5B-211ENST00000553007 ERICH3Q5RHP9 1530 aa32.71■■■□□ 2.83
ATP5B-211ENST00000553007 FBLN2P98095 1184 aa32.69■■■□□ 2.82
ATP5B-211ENST00000553007 ADAMTS12P58397 1594 aa32.68■■■□□ 2.82
ATP5B-211ENST00000553007 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP32.65■■■□□ 2.82
ATP5B-211ENST00000553007 CLASP1Q7Z460 1538 aa32.61■■■□□ 2.81
ATP5B-211ENST00000553007 FHAD1B1AJZ9 1412 aa32.58■■■□□ 2.81
ATP5B-211ENST00000553007 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa32.56■■■□□ 2.8
ATP5B-211ENST00000553007 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa32.56■■■□□ 2.8
ATP5B-211ENST00000553007 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa32.56■■■□□ 2.8
ATP5B-211ENST00000553007 GRIN2AQ12879 1464 aa32.55■■■□□ 2.8
ATP5B-211ENST00000553007 ARHGEF11O15085 1522 aa32.54■■■□□ 2.8
ATP5B-211ENST00000553007 KIF27Q86VH2 1401 aa32.52■■■□□ 2.8
ATP5B-211ENST00000553007 NUP160Q12769 1436 aa32.44■■■□□ 2.78
ATP5B-211ENST00000553007 IGF1RP08069 1367 aa32.42■■■□□ 2.78
ATP5B-211ENST00000553007 CEP170Q5SW79 1584 aa32.41■■■□□ 2.78
ATP5B-211ENST00000553007 CUL7Q14999 1698 aa32.4■■■□□ 2.78
ATP5B-211ENST00000553007 ARAP1Q96P48 1450 aa32.28■■■□□ 2.76
ATP5B-211ENST00000553007 TRIM41Q8WV44 630 aa32.26■■■□□ 2.75
ATP5B-211ENST00000553007 SHROOM2Q13796 1616 aa32.25■■■□□ 2.75
ATP5B-211ENST00000553007 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa32.21■■■□□ 2.75
ATP5B-211ENST00000553007 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa32.19■■■□□ 2.74
ATP5B-211ENST00000553007 CYB5RLQ6IPT4 315 aa32.11■■■□□ 2.73
ATP5B-211ENST00000553007 ERCC6L2Q5T890 1561 aa32.1■■■□□ 2.73
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