Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0B1

FTO, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase FTO, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FTOQ9C0B1 FP236383.1-201ENST00000623860 2498 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.11e-14■■■■■ 559.8
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FTOQ9C0B1 ALDH1A2-204ENST00000537372 3700 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.091e-91■■■■■ 349.5
FTOQ9C0B1 ALDH1A2-208ENST00000558239 664 ntTSL 413.45□□□□□ -0.261e-91■■■■■ 349.5
FTOQ9C0B1 ALDH1A2-207ENST00000558231 1664 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.451e-91■■■■■ 349.5
FTOQ9C0B1 ALDH1A2-205ENST00000557967 577 ntTSL 411.26□□□□□ -0.611e-91■■■■■ 349.5
FTOQ9C0B1 ALDH1A2-206ENST00000558073 581 ntTSL 410.09□□□□□ -0.791e-91■■■■■ 349.5
FTOQ9C0B1 ALDH1A2-220ENST00000560122 562 ntTSL 59.78□□□□□ -0.841e-91■■■■■ 349.5
FTOQ9C0B1 ALDH1A2-216ENST00000559297 542 ntTSL 47.54□□□□□ -1.21e-91■■■■■ 349.5
FTOQ9C0B1 FOXRED1-216ENST00000533839 559 ntTSL 411.02□□□□□ -0.655e-11■■■■■ 204.6
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FTOQ9C0B1 FOXRED1-207ENST00000527004 1760 ntTSL 518.4■□□□□ 0.542e-6■■■■■ 157.3
FTOQ9C0B1 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.52e-6■■■■■ 157.3
FTOQ9C0B1 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.442e-6■■■■■ 157.3
FTOQ9C0B1 FOXRED1-204ENST00000525770 1427 ntTSL 216.73■□□□□ 0.272e-6■■■■■ 157.3
FTOQ9C0B1 FOXRED1-217ENST00000534011 1955 ntTSL 216.2■□□□□ 0.182e-6■■■■■ 157.3
FTOQ9C0B1 FOXRED1-218ENST00000534315 2210 ntTSL 1 (best)15.98■□□□□ 0.152e-6■■■■■ 157.3
FTOQ9C0B1 FOXRED1-210ENST00000530642 3045 ntTSL 29.78□□□□□ -0.842e-6■■■■■ 157.3
FTOQ9C0B1 MANF-202ENST00000470900 1509 ntTSL 228.7■■■□□ 2.198e-33■■■■■ 90.7
FTOQ9C0B1 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.056e-13■■■■■ 83.9
FTOQ9C0B1 FAM178B-205ENST00000494172 592 ntTSL 320.24■□□□□ 0.834e-8■■■■■ 73.4
FTOQ9C0B1 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.84e-8■■■■■ 73.4
FTOQ9C0B1 FAM178B-201ENST00000393526 1004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.084e-8■■■■■ 73.4
FTOQ9C0B1 FAM178B-202ENST00000470789 722 ntTSL 1 (best)12.77□□□□□ -0.374e-8■■■■■ 73.4
FTOQ9C0B1 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.123e-29■■■■■ 72.1
FTOQ9C0B1 MANF-201ENST00000446668 846 ntTSL 323.87■■□□□ 1.413e-29■■■■■ 72.1
FTOQ9C0B1 ATP11A-201ENST00000375630 8768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.293e-15■■■■■ 70.9
FTOQ9C0B1 ATP11A-202ENST00000375645 8795 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.33e-15■■■■■ 70.9
FTOQ9C0B1 ATP11A-212ENST00000487903 8858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.563e-15■■■■■ 70.9
FTOQ9C0B1 ATP11A-209ENST00000466946 431 ntTSL 58.57□□□□□ -1.043e-15■■■■■ 70.9
FTOQ9C0B1 PDAP1-203ENST00000488214 274 ntTSL 37.97□□□□□ -1.131e-12■■■■■ 67.7
FTOQ9C0B1 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.733e-12■■■■■ 66
FTOQ9C0B1 PDAP1-202ENST00000426447 767 ntTSL 517.39■□□□□ 0.373e-12■■■■■ 66
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FTOQ9C0B1 ULK1-205ENST00000541761 1262 ntTSL 217.5■□□□□ 0.392e-10■■■■■ 58.2
FTOQ9C0B1 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.58e-12■■■■■ 58.1
FTOQ9C0B1 FP671120.1-201ENST00000623664 2498 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.11e-7■■■■■ 57.9
FTOQ9C0B1 HFM1-204ENST00000448819 540 ntTSL 510.88□□□□□ -0.671e-14■■■■■ 57.8
FTOQ9C0B1 HFM1-202ENST00000427444 672 ntTSL 54.19□□□□□ -1.741e-14■■■■■ 57.8
FTOQ9C0B1 HFM1-208ENST00000488023 1699 ntTSL 53.94□□□□□ -1.781e-14■■■■■ 57.8
FTOQ9C0B1 HFM1-207ENST00000481900 2020 ntTSL 53.44□□□□□ -1.861e-14■■■■■ 57.8
FTOQ9C0B1 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.131e-14■■■■■ 57.8
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FTOQ9C0B1 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.192e-6■■■■■ 57.7
FTOQ9C0B1 LINC01237-202ENST00000429947 470 ntTSL 415.67■□□□□ 0.12e-6■■■■■ 57.7
FTOQ9C0B1 C1QTNF12-205ENST00000486627 639 ntTSL 325.79■■□□□ 1.725e-12■■■■■ 56.3
FTOQ9C0B1 STXBP2-205ENST00000593854 704 ntTSL 221.16■□□□□ 0.984e-9■■■■■ 56.1
FTOQ9C0B1 ARF3-205ENST00000536283 537 ntTSL 425.53■■□□□ 1.682e-9■■■■■ 54.5
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FTOQ9C0B1 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.412e-9■■■■■ 54.5
FTOQ9C0B1 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.132e-9■■■■■ 54.5
FTOQ9C0B1 ARF3-204ENST00000485410 563 ntTSL 322.06■■□□□ 1.122e-9■■■■■ 54.5
FTOQ9C0B1 ARF3-201ENST00000256682 4105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.062e-9■■■■■ 54.5
FTOQ9C0B1 AC073610.3-201ENST00000398092 939 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.732e-9■■■■■ 54.5
FTOQ9C0B1 NUCB1-203ENST00000411700 673 ntTSL 423.12■■□□□ 1.291e-11■■■■■ 54.4
FTOQ9C0B1 NUCB1-204ENST00000424608 884 ntAPPRIS ALT2 TSL 522.57■■□□□ 1.21e-11■■■■■ 54.4
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FTOQ9C0B1 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.351e-11■■■■■ 54.4
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FTOQ9C0B1 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.571e-11■■■■■ 53.6
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FTOQ9C0B1 ADARB1-203ENST00000389861 5031 ntTSL 1 (best)23.74■■□□□ 1.391e-9■■■■■ 53.4
FTOQ9C0B1 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.391e-9■■■■■ 53.4
FTOQ9C0B1 ADARB1-211ENST00000492414 4913 ntTSL 1 (best)22.83■■□□□ 1.241e-9■■■■■ 53.4
FTOQ9C0B1 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.781e-9■■■■■ 53.4
FTOQ9C0B1 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.781e-9■■■■■ 53.4
FTOQ9C0B1 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.431e-9■■■■■ 53.4
FTOQ9C0B1 ADARB1-214ENST00000629643 4583 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.161e-9■■■■■ 53.4
FTOQ9C0B1 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.764e-11■■■■■ 53.2
FTOQ9C0B1 BLVRB-203ENST00000597870 1392 ntTSL 520.85■□□□□ 0.933e-12■■■■■ 53
FTOQ9C0B1 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.433e-12■■■■■ 53
FTOQ9C0B1 BLVRB-202ENST00000595483 649 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.013e-12■■■■■ 53
FTOQ9C0B1 SBNO2-205ENST00000587655 914 ntTSL 318.62■□□□□ 0.576e-7■■■■■ 51.4
FTOQ9C0B1 SBNO2-209ENST00000590998 562 ntTSL 416.57■□□□□ 0.246e-7■■■■■ 51.4
FTOQ9C0B1 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.461e-8■■■■■ 51.3
FTOQ9C0B1 EIPR1-204ENST00000435721 672 ntTSL 321.46■■□□□ 1.031e-8■■■■■ 51.3
FTOQ9C0B1 EIPR1-203ENST00000406835 738 ntTSL 521.46■■□□□ 1.031e-8■■■■■ 51.3
FTOQ9C0B1 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.961e-8■■■■■ 51.3
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FTOQ9C0B1 EIPR1-205ENST00000441271 647 ntTSL 519.41■□□□□ 0.71e-8■■■■■ 51.3
FTOQ9C0B1 EIPR1-212ENST00000478754 2932 ntTSL 519.34■□□□□ 0.691e-8■■■■■ 51.3
FTOQ9C0B1 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.631e-8■■■■■ 51.3
FTOQ9C0B1 EIPR1-208ENST00000455162 847 ntTSL 512.07□□□□□ -0.481e-8■■■■■ 51.3
FTOQ9C0B1 EIPR1-210ENST00000463662 757 ntTSL 310.25□□□□□ -0.771e-8■■■■■ 51.3
FTOQ9C0B1 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.943e-7■■■■■ 50.9
FTOQ9C0B1 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.61e-6■■■■■ 50.8
FTOQ9C0B1 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.491e-6■■■■■ 50.8
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