Protein–RNA interactions for Protein: Q02790

FKBP4, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase FKBP4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FKBP4Q02790 FP236383.1-201ENST00000623860 2498 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.161e-43■■■■■ 247
FKBP4Q02790 PPP6R2-206ENST00000427222 1811 ntTSL 521.72■■□□□ 1.072e-10■■■■■ 138.7
FKBP4Q02790 PPP6R2-205ENST00000401672 2199 ntTSL 216.11■□□□□ 0.173e-10■■■■■ 134.6
FKBP4Q02790 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.338e-9■■■■■ 132
FKBP4Q02790 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.278e-9■■■■■ 132
FKBP4Q02790 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.238e-9■■■■■ 132
FKBP4Q02790 PPP6R2-209ENST00000612753 4104 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.058e-9■■■■■ 132
FKBP4Q02790 PPP6R2-201ENST00000216061 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.148e-9■■■■■ 132
FKBP4Q02790 SNORD3B-1-201ENST00000577988 758 ntBASIC17.5■□□□□ 0.393e-22■■■■■ 129.2
FKBP4Q02790 SNORD3B-1-203ENST00000631292 217 nt13.8□□□□□ -0.23e-22■■■■■ 129.2
FKBP4Q02790 SNORD3B-1-202ENST00000617128 218 nt13.43□□□□□ -0.263e-22■■■■■ 129.2
FKBP4Q02790 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.653e-9■■■■■ 56.5
FKBP4Q02790 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.23e-9■■■■■ 56.5
FKBP4Q02790 SLC16A3-215ENST00000582946 586 ntTSL 422.02■■□□□ 1.126e-20■■■■■ 53.9
FKBP4Q02790 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.174e-7■■■■■ 52.2
FKBP4Q02790 GOLGA3-207ENST00000545875 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.284e-7■■■■■ 52.2
FKBP4Q02790 GOLGA3-202ENST00000450791 8870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.334e-7■■■■■ 52.2
FKBP4Q02790 GOLGA3-201ENST00000204726 9252 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.384e-7■■■■■ 52.2
FKBP4Q02790 FAM20C-205ENST00000515795 2177 ntTSL 1 (best)23.78■■□□□ 1.41e-7■■■■■ 51.9
FKBP4Q02790 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.445e-10■■■■■ 50.9
FKBP4Q02790 SLC6A9-209ENST00000492434 592 ntTSL 329.88■■■□□ 2.375e-10■■■■■ 50.9
FKBP4Q02790 SLC6A9-208ENST00000489764 930 ntTSL 324.45■■□□□ 1.55e-10■■■■■ 50.9
FKBP4Q02790 PXDC1-203ENST00000477592 1697 ntTSL 521.29■■□□□ 15e-10■■■■■ 50.9
FKBP4Q02790 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.495e-10■■■■■ 50.9
FKBP4Q02790 SLC6A9-207ENST00000475075 1881 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.445e-10■■■■■ 50.9
FKBP4Q02790 SLC6A9-205ENST00000372310 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.195e-10■■■■■ 50.9
FKBP4Q02790 PXDC1-204ENST00000485986 532 ntTSL 215.66■□□□□ 0.15e-10■■■■■ 50.9
FKBP4Q02790 SLC6A9-206ENST00000466926 591 ntTSL 315.2■□□□□ 0.025e-10■■■■■ 50.9
FKBP4Q02790 NECAB3-212ENST00000485976 1016 ntTSL 528.93■■■□□ 2.221e-11■■■■■ 50.7
FKBP4Q02790 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.524e-7■■■■■ 50.2
FKBP4Q02790 CTDSP1-211ENST00000492545 634 ntTSL 530.6■■■□□ 2.492e-9■■■■■ 48
FKBP4Q02790 AL390719.1-206ENST00000451054 565 ntTSL 215.83■□□□□ 0.122e-9■■■■■ 48
FKBP4Q02790 AL390719.1-205ENST00000433695 540 ntTSL 214.83□□□□□ -0.042e-9■■■■■ 48
FKBP4Q02790 FAM20C-204ENST00000512382 1018 ntTSL 218.68■□□□□ 0.581e-7■■■■■ 45.7
FKBP4Q02790 PTMA-208ENST00000448874 1108 ntTSL 221.86■■□□□ 1.096e-9■■■■■ 44.9
FKBP4Q02790 PTMA-212ENST00000481928 1635 ntTSL 320.47■□□□□ 0.876e-9■■■■■ 44.9
FKBP4Q02790 PTMA-211ENST00000468027 621 ntTSL 1 (best)16.62■□□□□ 0.256e-9■■■■■ 44.9
FKBP4Q02790 PTMA-209ENST00000466801 784 ntTSL 513.63□□□□□ -0.236e-9■■■■■ 44.9
FKBP4Q02790 PTMA-201ENST00000341369 1212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.246e-9■■■■■ 44.9
FKBP4Q02790 PTMA-204ENST00000409683 933 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.336e-9■■■■■ 44.9
FKBP4Q02790 PTMA-203ENST00000409321 735 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.356e-9■■■■■ 44.9
FKBP4Q02790 PTMA-202ENST00000409115 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.376e-9■■■■■ 44.9
FKBP4Q02790 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.871e-7■■■■■ 44.7
FKBP4Q02790 PTPRF-207ENST00000436724 2168 ntTSL 1 (best)25.48■■□□□ 1.671e-7■■■■■ 44.7
FKBP4Q02790 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.871e-7■■■■■ 44.7
FKBP4Q02790 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.591e-7■■■■■ 44.7
FKBP4Q02790 PTPRF-202ENST00000372405 1962 ntTSL 1 (best)16.63■□□□□ 0.251e-7■■■■■ 44.7
FKBP4Q02790 PTPRF-208ENST00000437607 788 ntTSL 1 (best)15.85■□□□□ 0.131e-7■■■■■ 44.7
FKBP4Q02790 NECAB3-217ENST00000606106 591 ntTSL 425.18■■□□□ 1.621e-7■■■■■ 43.7
FKBP4Q02790 NECAB3-208ENST00000480994 732 ntTSL 521.75■■□□□ 1.071e-7■■■■■ 43.7
FKBP4Q02790 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.198e-7■■■■■ 42.8
FKBP4Q02790 AC068675.1-201ENST00000588996 561 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.244e-6■■■■■ 42.4
FKBP4Q02790 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.167e-9■■■■■ 42
FKBP4Q02790 RRBP1-205ENST00000398782 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 231.66■■■□□ 2.665e-7■■■■■ 41
FKBP4Q02790 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.495e-7■■■■■ 41
FKBP4Q02790 RRBP1-202ENST00000360807 3727 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.215e-7■■■■■ 41
FKBP4Q02790 RRBP1-206ENST00000455029 2485 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.085e-7■■■■■ 41
FKBP4Q02790 RRBP1-203ENST00000377807 3792 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.355e-7■■■■■ 41
FKBP4Q02790 TCF25-211ENST00000563636 721 ntTSL 222.78■■□□□ 1.241e-12■■■■■ 40.7
FKBP4Q02790 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.188e-8■■■■■ 39.6
FKBP4Q02790 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.048e-8■■■■■ 39.6
FKBP4Q02790 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.018e-8■■■■■ 39.6
FKBP4Q02790 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.838e-8■■■■■ 39.6
FKBP4Q02790 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.778e-8■■■■■ 39.6
FKBP4Q02790 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.748e-8■■■■■ 39.6
FKBP4Q02790 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.718e-8■■■■■ 39.6
FKBP4Q02790 EWSR1-212ENST00000444626 560 ntTSL 519.36■□□□□ 0.698e-8■■■■■ 39.6
FKBP4Q02790 AKT1-218ENST00000557552 8396 ntTSL 519.34■□□□□ 0.698e-8■■■■■ 39.6
FKBP4Q02790 EWSR1-213ENST00000447973 582 ntTSL 418.25■□□□□ 0.518e-8■■■■■ 39.6
FKBP4Q02790 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.518e-8■■■■■ 39.6
FKBP4Q02790 EWSR1-210ENST00000436425 553 ntTSL 416.89■□□□□ 0.298e-8■■■■■ 39.6
FKBP4Q02790 EWSR1-217ENST00000483415 3231 ntTSL 1 (best)12.77□□□□□ -0.368e-8■■■■■ 39.6
FKBP4Q02790 EWSR1-211ENST00000437155 933 ntTSL 511.68□□□□□ -0.548e-8■■■■■ 39.6
FKBP4Q02790 EWSR1-214ENST00000455726 710 ntTSL 39.15□□□□□ -0.948e-8■■■■■ 39.6
FKBP4Q02790 EWSR1-219ENST00000485037 479 ntTSL 58.18□□□□□ -1.18e-8■■■■■ 39.6
FKBP4Q02790 EWSR1-209ENST00000415761 587 ntTSL 34.04□□□□□ -1.768e-8■■■■■ 39.6
FKBP4Q02790 PTMA-206ENST00000412128 863 ntTSL 331.94■■■□□ 2.74e-12■■■■■ 39.4
FKBP4Q02790 PTMA-207ENST00000440384 222 ntTSL 324.23■■□□□ 1.474e-12■■■■■ 39.4
FKBP4Q02790 MAGI1-205ENST00000464060 2247 ntTSL 1 (best)28.02■■■□□ 2.086e-9■■■■■ 39
FKBP4Q02790 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.726e-9■■■■■ 39
FKBP4Q02790 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.636e-9■■■■■ 39
FKBP4Q02790 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.546e-9■■■■■ 39
FKBP4Q02790 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.286e-9■■■■■ 39
FKBP4Q02790 TCF25-207ENST00000562256 1879 ntTSL 1 (best)21.36■■□□□ 1.014e-10■■■■■ 38.3
FKBP4Q02790 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.64e-10■■■■■ 38.3
FKBP4Q02790 TCF25-224ENST00000570116 1947 ntTSL 518.59■□□□□ 0.574e-10■■■■■ 38.3
FKBP4Q02790 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.494e-10■■■■■ 38.3
FKBP4Q02790 TCF25-221ENST00000568409 857 ntTSL 317.18■□□□□ 0.344e-10■■■■■ 38.3
FKBP4Q02790 TCF25-206ENST00000562193 627 ntTSL 314.99□□□□□ -0.014e-10■■■■■ 38.3
FKBP4Q02790 BRD3-203ENST00000371842 574 ntTSL 519.7■□□□□ 0.745e-7■■■■■ 38.1
FKBP4Q02790 TCF25-226ENST00000640279 2688 ntTSL 518.48■□□□□ 0.557e-8■■■■■ 37.5
FKBP4Q02790 PPP1CB-208ENST00000455580 721 ntTSL 331.14■■■□□ 2.582e-8■■■■■ 37.1
FKBP4Q02790 PPP1CB-205ENST00000420282 570 ntTSL 426.74■■□□□ 1.872e-8■■■■■ 37.1
FKBP4Q02790 PPP1CB-206ENST00000427786 569 ntTSL 425.37■■□□□ 1.652e-8■■■■■ 37.1
FKBP4Q02790 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.762e-8■■■■■ 37.1
FKBP4Q02790 PPP1CB-207ENST00000441461 584 ntTSL 219.15■□□□□ 0.662e-8■■■■■ 37.1
FKBP4Q02790 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.412e-8■■■■■ 37.1
FKBP4Q02790 PPP1CB-209ENST00000464273 577 ntTSL 217.29■□□□□ 0.362e-8■■■■■ 37.1
FKBP4Q02790 PPP1CB-201ENST00000296122 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.132e-8■■■■■ 37.1
FKBP4Q02790 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.653e-7■■■■■ 36.7
Retrieved 100 of 2,944 protein–RNA pairs in 174.6 ms