Protein–RNA interactions for Protein: Q3LHN0

KRTAP25-1, Keratin-associated protein 25-1, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP25-1Q3LHN0 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
KRTAP25-1Q3LHN0 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
KRTAP25-1Q3LHN0 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
KRTAP25-1Q3LHN0 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
KRTAP25-1Q3LHN0 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
KRTAP25-1Q3LHN0 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
KRTAP25-1Q3LHN0 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
KRTAP25-1Q3LHN0 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
KRTAP25-1Q3LHN0 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.7□□□□□ -1.02
KRTAP25-1Q3LHN0 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
KRTAP25-1Q3LHN0 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
KRTAP25-1Q3LHN0 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
KRTAP25-1Q3LHN0 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.7□□□□□ -1.02
KRTAP25-1Q3LHN0 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
KRTAP25-1Q3LHN0 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
KRTAP25-1Q3LHN0 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.7□□□□□ -1.02
KRTAP25-1Q3LHN0 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
KRTAP25-1Q3LHN0 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
KRTAP25-1Q3LHN0 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
KRTAP25-1Q3LHN0 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC8.7□□□□□ -1.02
KRTAP25-1Q3LHN0 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
KRTAP25-1Q3LHN0 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
KRTAP25-1Q3LHN0 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
KRTAP25-1Q3LHN0 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
KRTAP25-1Q3LHN0 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
KRTAP25-1Q3LHN0 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC8.7□□□□□ -1.02
KRTAP25-1Q3LHN0 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
KRTAP25-1Q3LHN0 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
KRTAP25-1Q3LHN0 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
KRTAP25-1Q3LHN0 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
KRTAP25-1Q3LHN0 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
KRTAP25-1Q3LHN0 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
KRTAP25-1Q3LHN0 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
KRTAP25-1Q3LHN0 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
KRTAP25-1Q3LHN0 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
KRTAP25-1Q3LHN0 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
KRTAP25-1Q3LHN0 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
KRTAP25-1Q3LHN0 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
KRTAP25-1Q3LHN0 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
KRTAP25-1Q3LHN0 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC8.7□□□□□ -1.02
KRTAP25-1Q3LHN0 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.7□□□□□ -1.02
KRTAP25-1Q3LHN0 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
KRTAP25-1Q3LHN0 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
KRTAP25-1Q3LHN0 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
KRTAP25-1Q3LHN0 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
KRTAP25-1Q3LHN0 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
KRTAP25-1Q3LHN0 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
KRTAP25-1Q3LHN0 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
KRTAP25-1Q3LHN0 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
KRTAP25-1Q3LHN0 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
KRTAP25-1Q3LHN0 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
KRTAP25-1Q3LHN0 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
KRTAP25-1Q3LHN0 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
KRTAP25-1Q3LHN0 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
KRTAP25-1Q3LHN0 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
KRTAP25-1Q3LHN0 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
KRTAP25-1Q3LHN0 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
KRTAP25-1Q3LHN0 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
KRTAP25-1Q3LHN0 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
KRTAP25-1Q3LHN0 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
KRTAP25-1Q3LHN0 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC8.7□□□□□ -1.02
KRTAP25-1Q3LHN0 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
KRTAP25-1Q3LHN0 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
KRTAP25-1Q3LHN0 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
KRTAP25-1Q3LHN0 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
KRTAP25-1Q3LHN0 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC8.7□□□□□ -1.02
KRTAP25-1Q3LHN0 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC8.69□□□□□ -1.02
KRTAP25-1Q3LHN0 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
KRTAP25-1Q3LHN0 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
KRTAP25-1Q3LHN0 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
KRTAP25-1Q3LHN0 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
KRTAP25-1Q3LHN0 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
KRTAP25-1Q3LHN0 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
KRTAP25-1Q3LHN0 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
KRTAP25-1Q3LHN0 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
KRTAP25-1Q3LHN0 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
KRTAP25-1Q3LHN0 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.69□□□□□ -1.02
KRTAP25-1Q3LHN0 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC8.69□□□□□ -1.02
KRTAP25-1Q3LHN0 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
KRTAP25-1Q3LHN0 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC8.69□□□□□ -1.02
KRTAP25-1Q3LHN0 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
KRTAP25-1Q3LHN0 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
KRTAP25-1Q3LHN0 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
KRTAP25-1Q3LHN0 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
KRTAP25-1Q3LHN0 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
KRTAP25-1Q3LHN0 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
KRTAP25-1Q3LHN0 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
KRTAP25-1Q3LHN0 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
KRTAP25-1Q3LHN0 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
KRTAP25-1Q3LHN0 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC8.69□□□□□ -1.02
KRTAP25-1Q3LHN0 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
KRTAP25-1Q3LHN0 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC8.69□□□□□ -1.02
KRTAP25-1Q3LHN0 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC8.69□□□□□ -1.02
KRTAP25-1Q3LHN0 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
KRTAP25-1Q3LHN0 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
KRTAP25-1Q3LHN0 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
KRTAP25-1Q3LHN0 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
KRTAP25-1Q3LHN0 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
KRTAP25-1Q3LHN0 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
KRTAP25-1Q3LHN0 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 243.4 ms