RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264645.11

CASC3-201, Transcript of CASC3, exon junction complex subunit, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CASC3, Length 4,116 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC3-201ENST00000264645 NISCHQ9Y2I1 1504 aa25.29■■□□□ 1.64
CASC3-201ENST00000264645 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
CASC3-201ENST00000264645 DCAF8L2P0C7V8 631 aa24.76■■□□□ 1.55
CASC3-201ENST00000264645 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa24.59■■□□□ 1.53
CASC3-201ENST00000264645 PCGF6Q9BYE7 350 aa24.54■■□□□ 1.52
CASC3-201ENST00000264645 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP24.21■■□□□ 1.47
CASC3-201ENST00000264645 HRCP23327 699 aa24.08■■□□□ 1.45
CASC3-201ENST00000264645 EHMT2Q96KQ7 1210 aa23.94■■□□□ 1.42
CASC3-201ENST00000264645 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP23.8■■□□□ 1.4
CASC3-201ENST00000264645 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
CASC3-201ENST00000264645 MYT1Q01538 1121 aa23.57■■□□□ 1.36
CASC3-201ENST00000264645 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
CASC3-201ENST00000264645 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
CASC3-201ENST00000264645 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
CASC3-201ENST00000264645 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
CASC3-201ENST00000264645 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
CASC3-201ENST00000264645 CHIC1Q5VXU3 224 aa23.22■■□□□ 1.31
CASC3-201ENST00000264645 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa23.19■■□□□ 1.3
CASC3-201ENST00000264645 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP23.17■■□□□ 1.3
CASC3-201ENST00000264645 TRIM41Q8WV44 630 aa22.99■■□□□ 1.27
CASC3-201ENST00000264645 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa22.77■■□□□ 1.24
CASC3-201ENST00000264645 APLP2Q06481 763 aa22.71■■□□□ 1.23
CASC3-201ENST00000264645 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
CASC3-201ENST00000264645 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.21
CASC3-201ENST00000264645 ERICH6Q7L0X2 663 aa22.63■■□□□ 1.21
CASC3-201ENST00000264645 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
CASC3-201ENST00000264645 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
CASC3-201ENST00000264645 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
CASC3-201ENST00000264645 NEFLP07196 543 aa22.37■■□□□ 1.17
CASC3-201ENST00000264645 UBTFP17480 764 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
CASC3-201ENST00000264645 NEUROD1Q13562 356 aa22.32■■□□□ 1.16
CASC3-201ENST00000264645 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
CASC3-201ENST00000264645 MYO15BQ96JP2 1530 aa22.11■■□□□ 1.13
CASC3-201ENST00000264645 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa22.09■■□□□ 1.13
CASC3-201ENST00000264645 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
CASC3-201ENST00000264645 BCANQ96GW7 911 aa22■■□□□ 1.11
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CASC3-201ENST00000264645 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP21.73■■□□□ 1.07
CASC3-201ENST00000264645 MIER1Q8N108 512 aa21.62■■□□□ 1.05
CASC3-201ENST00000264645 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
CASC3-201ENST00000264645 FKBP8Q14318 412 aa21.47■■□□□ 1.03
CASC3-201ENST00000264645 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa21.47■■□□□ 1.03
CASC3-201ENST00000264645 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
CASC3-201ENST00000264645 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
CASC3-201ENST00000264645 CLSPNQ9HAW4 1339 aa21.42■■□□□ 1.02
CASC3-201ENST00000264645 ANP32EQ9BTT0 268 aa21.42■■□□□ 1.02
CASC3-201ENST00000264645 BCL11AQ9H165 835 aa21.31■■□□□ 1
CASC3-201ENST00000264645 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP21.3■■□□□ 1
CASC3-201ENST00000264645 ANP32CO43423 234 aa21.29■■□□□ 1
CASC3-201ENST00000264645 POLR3GLQ9BT43 218 aa21.28■■□□□ 1
CASC3-201ENST00000264645 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP21.17■□□□□ 0.98
CASC3-201ENST00000264645 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP21.16■□□□□ 0.98
CASC3-201ENST00000264645 TRIM52Q96A61 297 aa21.15■□□□□ 0.98
CASC3-201ENST00000264645 CSRNP3Q8WYN3 585 aa21.14■□□□□ 0.98
CASC3-201ENST00000264645 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP21.13■□□□□ 0.97
CASC3-201ENST00000264645 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP21.11■□□□□ 0.97
CASC3-201ENST00000264645 NBR1Q14596 966 aa21.07■□□□□ 0.96
CASC3-201ENST00000264645 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP21.01■□□□□ 0.95
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CASC3-201ENST00000264645 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP20.98■□□□□ 0.95
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CASC3-201ENST00000264645 MYT1LQ9UL68 1186 aa20.95■□□□□ 0.94
CASC3-201ENST00000264645 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP20.93■□□□□ 0.94
CASC3-201ENST00000264645 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa20.92■□□□□ 0.94
CASC3-201ENST00000264645 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP20.87■□□□□ 0.93
CASC3-201ENST00000264645 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP20.81■□□□□ 0.92
CASC3-201ENST00000264645 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP20.76■□□□□ 0.91
CASC3-201ENST00000264645 FAM9BQ8IZU0 186 aa20.76■□□□□ 0.91
CASC3-201ENST00000264645 CEP162Q5TB80 1403 aa20.75■□□□□ 0.91
CASC3-201ENST00000264645 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP20.67■□□□□ 0.9
CASC3-201ENST00000264645 CCDC136Q96JN2 1154 aa20.67■□□□□ 0.9
CASC3-201ENST00000264645 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP20.66■□□□□ 0.9
CASC3-201ENST00000264645 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
CASC3-201ENST00000264645 DEKP35659 375 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
CASC3-201ENST00000264645 TONSLQ96HA7 1378 aa20.61■□□□□ 0.89
CASC3-201ENST00000264645 P3H3Q8IVL6 736 aa20.57■□□□□ 0.88
CASC3-201ENST00000264645 CLIP1P30622 1438 aa20.56■□□□□ 0.88
CASC3-201ENST00000264645 SCRIBQ14160 1630 aa20.53■□□□□ 0.88
CASC3-201ENST00000264645 MRS2Q9HD23 443 aa20.53■□□□□ 0.88
CASC3-201ENST00000264645 TNIKQ9UKE5 1360 aa20.49■□□□□ 0.87
CASC3-201ENST00000264645 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
CASC3-201ENST00000264645 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
CASC3-201ENST00000264645 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP20.47■□□□□ 0.875e-6■■■■□ 22.2
CASC3-201ENST00000264645 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa20.46■□□□□ 0.87
CASC3-201ENST00000264645 KCNH8Q96L42 1107 aa20.45■□□□□ 0.86
CASC3-201ENST00000264645 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa20.44■□□□□ 0.86
CASC3-201ENST00000264645 PPP4R2Q9NY27 417 aa20.43■□□□□ 0.86
CASC3-201ENST00000264645 SIN3AQ96ST3 1273 aa20.42■□□□□ 0.86
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CASC3-201ENST00000264645 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
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CASC3-201ENST00000264645 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa20.37■□□□□ 0.85
CASC3-201ENST00000264645 GOLGA3Q08378 1498 aa20.36■□□□□ 0.85
CASC3-201ENST00000264645 NEFMP07197 916 aa20.33■□□□□ 0.85
CASC3-201ENST00000264645 TMC1Q8TDI8 760 aa20.3■□□□□ 0.84
CASC3-201ENST00000264645 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
CASC3-201ENST00000264645 EEA1Q15075 1411 aa20.27■□□□□ 0.84
CASC3-201ENST00000264645 SOGA1O94964 1423 aa20.25■□□□□ 0.83
CASC3-201ENST00000264645 CCER2I3L3R5 266 aa20.24■□□□□ 0.83
CASC3-201ENST00000264645 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP20.23■□□□□ 0.83
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