RNA: ENST00000264645.11

CASC3-201, Transcript of CASC3, exon junction complex subunit, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CASC3, Length 4,116 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC3-201ENST00000264645 NISCHQ9Y2I1 1504 aa25.29■■□□□ 1.64
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CASC3-201ENST00000264645 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa24.59■■□□□ 1.53
CASC3-201ENST00000264645 PCGF6Q9BYE7 350 aa24.54■■□□□ 1.52
CASC3-201ENST00000264645 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP24.21■■□□□ 1.47
CASC3-201ENST00000264645 HRCP23327 699 aa24.08■■□□□ 1.45
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CASC3-201ENST00000264645 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa23.19■■□□□ 1.3
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CASC3-201ENST00000264645 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
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CASC3-201ENST00000264645 MYO15BQ96JP2 1530 aa22.11■■□□□ 1.13
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CASC3-201ENST00000264645 BCANQ96GW7 911 aa22■■□□□ 1.11
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CASC3-201ENST00000264645 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa21.47■■□□□ 1.03
CASC3-201ENST00000264645 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
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CASC3-201ENST00000264645 CLSPNQ9HAW4 1339 aa21.42■■□□□ 1.02
CASC3-201ENST00000264645 ANP32EQ9BTT0 268 aa21.42■■□□□ 1.02
CASC3-201ENST00000264645 BCL11AQ9H165 835 aa21.31■■□□□ 1
CASC3-201ENST00000264645 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP21.3■■□□□ 1
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CASC3-201ENST00000264645 CEP162Q5TB80 1403 aa20.75■□□□□ 0.91
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CASC3-201ENST00000264645 P3H3Q8IVL6 736 aa20.57■□□□□ 0.88
CASC3-201ENST00000264645 CLIP1P30622 1438 aa20.56■□□□□ 0.88
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CASC3-201ENST00000264645 MRS2Q9HD23 443 aa20.53■□□□□ 0.88
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CASC3-201ENST00000264645 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP20.23■□□□□ 0.83
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