Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFW8

CGGBP1, CGG triplet repeat-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGGBP1Q9UFW8 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CGGBP1Q9UFW8 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CGGBP1Q9UFW8 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CGGBP1Q9UFW8 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CGGBP1Q9UFW8 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CGGBP1Q9UFW8 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CGGBP1Q9UFW8 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CGGBP1Q9UFW8 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CGGBP1Q9UFW8 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CGGBP1Q9UFW8 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CGGBP1Q9UFW8 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CGGBP1Q9UFW8 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CGGBP1Q9UFW8 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CGGBP1Q9UFW8 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CGGBP1Q9UFW8 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CGGBP1Q9UFW8 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CGGBP1Q9UFW8 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CGGBP1Q9UFW8 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CGGBP1Q9UFW8 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CGGBP1Q9UFW8 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CGGBP1Q9UFW8 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CGGBP1Q9UFW8 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CGGBP1Q9UFW8 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CGGBP1Q9UFW8 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CGGBP1Q9UFW8 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CGGBP1Q9UFW8 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CGGBP1Q9UFW8 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CGGBP1Q9UFW8 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CGGBP1Q9UFW8 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CGGBP1Q9UFW8 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CGGBP1Q9UFW8 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CGGBP1Q9UFW8 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CGGBP1Q9UFW8 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CGGBP1Q9UFW8 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CGGBP1Q9UFW8 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CGGBP1Q9UFW8 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CGGBP1Q9UFW8 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CGGBP1Q9UFW8 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CGGBP1Q9UFW8 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CGGBP1Q9UFW8 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CGGBP1Q9UFW8 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CGGBP1Q9UFW8 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CGGBP1Q9UFW8 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CGGBP1Q9UFW8 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CGGBP1Q9UFW8 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CGGBP1Q9UFW8 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CGGBP1Q9UFW8 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CGGBP1Q9UFW8 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CGGBP1Q9UFW8 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CGGBP1Q9UFW8 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CGGBP1Q9UFW8 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CGGBP1Q9UFW8 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CGGBP1Q9UFW8 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CGGBP1Q9UFW8 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CGGBP1Q9UFW8 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CGGBP1Q9UFW8 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CGGBP1Q9UFW8 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CGGBP1Q9UFW8 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CGGBP1Q9UFW8 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CGGBP1Q9UFW8 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CGGBP1Q9UFW8 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CGGBP1Q9UFW8 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CGGBP1Q9UFW8 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CGGBP1Q9UFW8 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CGGBP1Q9UFW8 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CGGBP1Q9UFW8 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CGGBP1Q9UFW8 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CGGBP1Q9UFW8 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CGGBP1Q9UFW8 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CGGBP1Q9UFW8 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CGGBP1Q9UFW8 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CGGBP1Q9UFW8 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CGGBP1Q9UFW8 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CGGBP1Q9UFW8 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CGGBP1Q9UFW8 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CGGBP1Q9UFW8 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CGGBP1Q9UFW8 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CGGBP1Q9UFW8 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CGGBP1Q9UFW8 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CGGBP1Q9UFW8 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CGGBP1Q9UFW8 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CGGBP1Q9UFW8 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CGGBP1Q9UFW8 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CGGBP1Q9UFW8 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CGGBP1Q9UFW8 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CGGBP1Q9UFW8 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CGGBP1Q9UFW8 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CGGBP1Q9UFW8 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CGGBP1Q9UFW8 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CGGBP1Q9UFW8 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CGGBP1Q9UFW8 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CGGBP1Q9UFW8 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CGGBP1Q9UFW8 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CGGBP1Q9UFW8 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CGGBP1Q9UFW8 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CGGBP1Q9UFW8 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CGGBP1Q9UFW8 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CGGBP1Q9UFW8 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CGGBP1Q9UFW8 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CGGBP1Q9UFW8 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 130.1 ms