RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000335523.7

VSTM2B-201, Transcript of V-set and transmembrane domain containing 2B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene VSTM2B, Length 1,488 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM2B-201ENST00000335523 NISCHQ9Y2I1 1504 aa45.08■■■■■ 4.81
VSTM2B-201ENST00000335523 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa39.47■■■■□ 3.91
VSTM2B-201ENST00000335523 ABCC9O60706 1549 aa38.27■■■■□ 3.72
VSTM2B-201ENST00000335523 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP37.74■■■■□ 3.63
VSTM2B-201ENST00000335523 DCAF8L2P0C7V8 631 aa37.48■■■■□ 3.59
VSTM2B-201ENST00000335523 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa37.32■■■■□ 3.56
VSTM2B-201ENST00000335523 MYO15BQ96JP2 1530 aa37.09■■■■□ 3.53
VSTM2B-201ENST00000335523 NACADO15069 1562 aa36.98■■■■□ 3.51
VSTM2B-201ENST00000335523 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa36.92■■■■□ 3.5
VSTM2B-201ENST00000335523 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa36.4■■■■□ 3.42
VSTM2B-201ENST00000335523 SCRIBQ14160 1630 aa36.18■■■■□ 3.38
VSTM2B-201ENST00000335523 UNC13AQ9UPW8 1703 aa36■■■■□ 3.35
VSTM2B-201ENST00000335523 BICRAQ9NZM4 1560 aa35.76■■■■□ 3.31
VSTM2B-201ENST00000335523 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP35.7■■■■□ 3.31
VSTM2B-201ENST00000335523 DNAJC5BQ9UF47 199 aa35.23■■■■□ 3.23
VSTM2B-201ENST00000335523 CECR2Q9BXF3 1484 aa35.01■■■■□ 3.2
VSTM2B-201ENST00000335523 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP34.88■■■■□ 3.17
VSTM2B-201ENST00000335523 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP34.86■■■■□ 3.17
VSTM2B-201ENST00000335523 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP34.83■■■■□ 3.17
VSTM2B-201ENST00000335523 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP34.8■■■■□ 3.16
VSTM2B-201ENST00000335523 MROH2BQ7Z745 1585 aa34.76■■■■□ 3.15
VSTM2B-201ENST00000335523 SMARCA4P51532 1647 aa34.69■■■■□ 3.14
VSTM2B-201ENST00000335523 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa34.68■■■■□ 3.14
VSTM2B-201ENST00000335523 WIZO95785 1651 aa34.39■■■■□ 3.1
VSTM2B-201ENST00000335523 PEG3Q9GZU2 1588 aa34.33■■■■□ 3.09
VSTM2B-201ENST00000335523 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa34.32■■■■□ 3.08
VSTM2B-201ENST00000335523 SMARCA2P51531 1590 aa34.3■■■■□ 3.08
VSTM2B-201ENST00000335523 NCAPD3P42695 1498 aa34.15■■■■□ 3.06
VSTM2B-201ENST00000335523 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP34.11■■■■□ 3.05
VSTM2B-201ENST00000335523 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP34.1■■■■□ 3.05
VSTM2B-201ENST00000335523 HMGXB3Q12766 1538 aa34■■■■□ 3.03
VSTM2B-201ENST00000335523 CCDC88BA6NC98 1476 aa33.77■■■■□ 3
VSTM2B-201ENST00000335523 CADPSQ9ULU8 1353 aa33.26■■■□□ 2.92
VSTM2B-201ENST00000335523 CFTRP13569 1480 aa33.24■■■□□ 2.91
VSTM2B-201ENST00000335523 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa33.15■■■□□ 2.9
VSTM2B-201ENST00000335523 CHIC1Q5VXU3 224 aa33.15■■■□□ 2.9
VSTM2B-201ENST00000335523 NESP48681 1621 aa33.08■■■□□ 2.89
VSTM2B-201ENST00000335523 ERCC6Q03468 1493 aa33.03■■■□□ 2.88
VSTM2B-201ENST00000335523 PDS5BQ9NTI5 1447 aa32.93■■■□□ 2.86
VSTM2B-201ENST00000335523 TRIM41Q8WV44 630 aa32.91■■■□□ 2.86
VSTM2B-201ENST00000335523 CUX2O14529 1486 aa32.85■■■□□ 2.85
VSTM2B-201ENST00000335523 PRDM2Q13029 1718 aa32.85■■■□□ 2.85
VSTM2B-201ENST00000335523 FANCD2Q9BXW9 1451 aa32.83■■■□□ 2.85
VSTM2B-201ENST00000335523 ABCC8Q09428 1581 aa32.8■■■□□ 2.84
VSTM2B-201ENST00000335523 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP32.8■■■□□ 2.84
VSTM2B-201ENST00000335523 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa32.71■■■□□ 2.83
VSTM2B-201ENST00000335523 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP32.69■■■□□ 2.82
VSTM2B-201ENST00000335523 CEP164Q9UPV0 1460 aa32.68■■■□□ 2.82
VSTM2B-201ENST00000335523 SYNJ1O43426 1573 aa32.55■■■□□ 2.8
VSTM2B-201ENST00000335523 MRC2Q9UBG0 1479 aa32.54■■■□□ 2.8
VSTM2B-201ENST00000335523 CUX1P39880 1505 aa32.54■■■□□ 2.8
VSTM2B-201ENST00000335523 TOP2BQ02880 1626 aa32.51■■■□□ 2.8
VSTM2B-201ENST00000335523 WDR62O43379 1518 aa32.46■■■□□ 2.79
VSTM2B-201ENST00000335523 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa32.45■■■□□ 2.78
VSTM2B-201ENST00000335523 DNMBPQ6XZF7 1577 aa32.42■■■□□ 2.78
VSTM2B-201ENST00000335523 TOPBP1Q92547 1522 aa32.4■■■□□ 2.78
VSTM2B-201ENST00000335523 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP32.39■■■□□ 2.78
VSTM2B-201ENST00000335523 FGD5Q6ZNL6 1462 aa32.28■■■□□ 2.76
VSTM2B-201ENST00000335523 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP32.2■■■□□ 2.75
VSTM2B-201ENST00000335523 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP32.2■■■□□ 2.74
VSTM2B-201ENST00000335523 SOGA1O94964 1423 aa32.18■■■□□ 2.74
VSTM2B-201ENST00000335523 EEA1Q15075 1411 aa32.16■■■□□ 2.74
VSTM2B-201ENST00000335523 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa32.08■■■□□ 2.73
VSTM2B-201ENST00000335523 KIF27Q86VH2 1401 aa32.06■■■□□ 2.72
VSTM2B-201ENST00000335523 CSRNP3Q8WYN3 585 aa32.04■■■□□ 2.72
VSTM2B-201ENST00000335523 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa32.04■■■□□ 2.72
VSTM2B-201ENST00000335523 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa32.02■■■□□ 2.72
VSTM2B-201ENST00000335523 IFT140Q96RY7 1462 aa31.97■■■□□ 2.71
VSTM2B-201ENST00000335523 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa31.94■■■□□ 2.7
VSTM2B-201ENST00000335523 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP31.89■■■□□ 2.7
VSTM2B-201ENST00000335523 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP31.87■■■□□ 2.69
VSTM2B-201ENST00000335523 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa31.83■■■□□ 2.69
VSTM2B-201ENST00000335523 IGF1RP08069 1367 aa31.81■■■□□ 2.68
VSTM2B-201ENST00000335523 WDR97A6NE52 1622 aa31.8■■■□□ 2.68
VSTM2B-201ENST00000335523 GAPVD1Q14C86 1478 aa31.78■■■□□ 2.68
VSTM2B-201ENST00000335523 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP31.72■■■□□ 2.67
VSTM2B-201ENST00000335523 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP31.7■■■□□ 2.67
VSTM2B-201ENST00000335523 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa31.7■■■□□ 2.67
VSTM2B-201ENST00000335523 EHMT2Q96KQ7 1210 aa31.7■■■□□ 2.66
VSTM2B-201ENST00000335523 PRXQ9BXM0 1461 aa31.67■■■□□ 2.66
VSTM2B-201ENST00000335523 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa31.65■■■□□ 2.66
VSTM2B-201ENST00000335523 ERICH3Q5RHP9 1530 aa31.65■■■□□ 2.66
VSTM2B-201ENST00000335523 GRIN2BQ13224 1484 aa31.62■■■□□ 2.65
VSTM2B-201ENST00000335523 KIF21BO75037 1637 aa31.62■■■□□ 2.65
VSTM2B-201ENST00000335523 GOLGA3Q08378 1498 aa31.61■■■□□ 2.65
VSTM2B-201ENST00000335523 UBTFP17480 764 aaKnown RBP31.59■■■□□ 2.65
VSTM2B-201ENST00000335523 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP31.58■■■□□ 2.65
VSTM2B-201ENST00000335523 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa31.54■■■□□ 2.64
VSTM2B-201ENST00000335523 CUL7Q14999 1698 aa31.51■■■□□ 2.63
VSTM2B-201ENST00000335523 TNIKQ9UKE5 1360 aa31.47■■■□□ 2.63
VSTM2B-201ENST00000335523 PBRM1Q86U86 1689 aa31.46■■■□□ 2.63
VSTM2B-201ENST00000335523 FHAD1B1AJZ9 1412 aa31.46■■■□□ 2.63
VSTM2B-201ENST00000335523 OSCARQ8IYS5 282 aa31.44■■■□□ 2.62
VSTM2B-201ENST00000335523 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa31.4■■■□□ 2.62
VSTM2B-201ENST00000335523 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP31.4■■■□□ 2.62
VSTM2B-201ENST00000335523 ADAMTS12P58397 1594 aa31.34■■■□□ 2.61
VSTM2B-201ENST00000335523 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP31.32■■■□□ 2.6
VSTM2B-201ENST00000335523 SYNJ2O15056 1496 aa31.28■■■□□ 2.6
VSTM2B-201ENST00000335523 FBLN2P98095 1184 aa31.25■■■□□ 2.59
VSTM2B-201ENST00000335523 CEP162Q5TB80 1403 aa31.19■■■□□ 2.58
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